九月壬戌日，刘秀从内黄返回。
陕县的贼寇苏况把弘农给攻破了，刘秀就派景丹去征讨。结果景丹去世了，于是又派征虏将军祭遵去攻打弘农、柏华、蛮中这些地方的贼寇，祭遵把他们都平定了。
赤眉军打算往西向陇地进发，隗嚣派将军杨广迎头阻击，把赤眉军打败了，还在乌氏、泾阳之间追击，再次击败赤眉军。赤眉军走到阳城番须的时候，碰上了大雪，山谷都被雪填满了，很多士兵都被冻死。没办法，他们只好往回走，还去挖掘各个皇陵，抢夺里面的财宝。那些用玉匣装殓的尸体，大多看起来跟活人一样，赤眉军居然还侮辱了吕后的尸体。邓禹派兵在郁夷攻打赤眉军，反而被赤眉军打败。邓禹只好带兵撤出，到了云阳。赤眉军又进入了长安。延岑驻扎在杜陵，赤眉军将领逢安去攻打他。邓禹觉得逢安的精兵都在外面，就带兵去偷袭长安，结果谢禄赶来救援，邓禹的军队战败逃跑。延岑趁机攻打逢安，把逢安打得大败，死了十多万人。廖湛带着十八万赤眉军去攻打汉中王刘嘉，刘嘉在谷口和他们交战，把廖湛打得大败，刘嘉还亲手杀了廖湛，然后到云阳去寻找粮食。刘嘉妻子的哥哥是新野的来歙，来歙是刘秀姑姑的儿子。刘秀让邓禹去招降刘嘉，刘嘉就通过来歙到邓禹那里投降了。但刘嘉的部将李宝态度傲慢无礼，邓禹就把他给杀了。
这年冬天十一月，刘秀任命廷尉岑彭为征南大将军。在一次大会上，刘秀指着王常对大臣们说：“这家伙率领下江的各位将领辅佐汉室，忠心耿耿，就像金石一样坚定，真是个忠臣啊！”当天，就封王常为汉忠将军，让他和岑彭率领建义大将军朱祜等七位将军去讨伐邓奉和董欣。岑彭他们先攻打堵乡，邓奉赶来救援。朱祜的军队战败，他自己也被邓奉俘虏了。
铜马、青犊、尤来这些残余的贼寇一起拥立孙登为天子。孙登的将领乐玄把孙登杀了，带着五万多人投降了。
自从冯愔反叛之后，邓禹的威望逐渐降低，军队又缺少粮食，打仗也多次失利，归附他的人越来越少。赤眉军和延岑在三辅地区肆意捣乱，郡县里的豪门大族各自拥兵自重，邓禹没办法平定。刘秀就派偏将军冯异代替邓禹去征讨，还亲自把冯异送到河南，告诫冯异说：“三辅地区先后遭受王莽、更始帝的祸乱，又加上赤眉军和延岑的残酷掠夺，老百姓生活在水深火热之中，没地方诉苦。将军你现在奉命去讨伐那些不法之徒，对于投降的营寨，把他们的首领送到京城来；让普通百姓解散，去从事农业生产；毁掉他们的营垒，别让他们再聚集起来。打仗不一定要占领土地、屠杀城池里的百姓，关键是要平定局势，让百姓安定下来。其他将领不是不勇猛能打仗，但是喜欢抢掠。你向来能管理好士兵，要注意自我约束，别让郡县的百姓受苦！”冯异磕头领命，带兵往西进发，每到一处，都树立起威信，很多盗贼都投降了。
司马光评论说：以前周人歌颂周武王的德行说：“宣扬德教，念念不忘，我出征只是为了让天下安定。”这说的就是王者的军队，目的在于宣扬威望和德行，让百姓安定。看看刘秀夺取关中的做法，就是用的这个道理啊。这多好啊！
刘秀又下诏让邓禹回来，说：“千万不要和陷入绝境的敌人硬拼！赤眉军没有粮食了，自然会往东来。我们以饱待饥，以逸待劳，轻而易举就能打败他们，这不是各位将领需要担心的事。不要再随便进兵了！”
刘秀任命伏隆为光禄大夫，又派他去见张步，封张步为东莱太守，还让他和新任命的青州牧、郡守、都尉一起往东去。还下诏让伏隆可以自行任命县令、县长以下的官员。
十二月戊午日，刘秀下诏，那些被王莽断绝封国的宗室列侯，都恢复他们原来的封国。
三辅地区发生了严重的饥荒，出现了人吃人的现象，城郭都空了，野外到处都是白骨。幸存的百姓常常聚集在一起建立营寨自保，各自坚壁清野。赤眉军抢不到东西，就打算往东回去，他们还有二十多万人，但是一路上不断有人散去。刘秀派破奸将军侯进等人驻扎在新安，建威大将军耿弇等人驻扎在宜阳，截断赤眉军的归路，还告诫各位将领说：“如果贼寇往东跑，就带领宜阳的军队到新安会合；如果贼寇往南跑，就带领新安的军队到宜阳会合。”冯异和赤眉军在华阴相遇，双方对峙了六十多天，打了几十仗，冯异收降了赤眉军的将领和士兵五千多人。
评论
这段历史生动展现了刘秀政权建立初期面临的复杂局面。各方势力在关中地区混战，赤眉军烧杀抢掠、挖掘皇陵，行径令人发指，不仅破坏社会秩序，更失民心。邓禹虽前期有功，但面对赤眉、延岑之乱及地方豪强割据，逐渐力不从心。刘秀果断调整策略，选派冯异替代邓禹，并给予其明确且合理的战略指导，体现出刘秀卓越的领导才能与战略眼光。冯异不负所托，以树立威信的方式招降盗贼，践行刘秀“安民”理念。同时，刘秀对邓禹的召回及对赤眉军的战略部署，展现出其冷静理智，懂得把握时机、以逸待劳。而对张步的招抚以及对宗室列侯的政策，也是刘秀稳定局势、巩固政权的重要举措。在这乱世之中，刘秀凭借一系列举措逐步整合各方力量，为实现全国统一与稳定奠定基础，其统治智慧值得深入研究。