新那美克星的硝烟尚未散尽，圣辉方舟的警报再次撕裂宁静。智能系统的红光疯狂闪烁：“检测到四星球能量信号消失！分别为贝吉塔行星遗迹、卡利克2星、亚德拉特星以及地球的卫星月球！”悟空手中的仙豆“啪嗒”掉落，金色瞳孔中满是震惊——这几颗星球，要么承载着重要记忆，要么隐藏着神秘力量。
贝吉塔的银色纹路瞬间暴涨，他死死盯着星图上消失的光点：“贝吉塔行星...那些残骸怎么会突然...”话未说完，一道熟悉又令人作呕的笑声从宇宙广播中传来。弗利萨的身影出现在方舟的投影屏幕上，他身披暗金色长袍，胸口镶嵌着从混沌星核提取的宝石，身后悬浮着四座星球的微型投影——正是消失的四星球，此刻正被暗物质锁链缠绕。
“好久不见啊，亲爱的战士们。”弗利萨的尾巴轻轻摆动，嘴角勾起残忍的弧度，“看到你们惊慌失措的表情，真是让我愉悦。这几颗星球，不过是我新计划的开胃菜。接下来...”他的目光突然转向某个方向，“该轮到一个特别的人登场了。”
布尔玛正在胶囊公司实验室调试新设备，突然，整座建筑被暗紫色光芒笼罩。她还没来得及反应，一道暗物质触手已穿透墙壁，将她卷向空中。“放开我！”布尔玛挣扎着，手中的激光枪射向触手，却只激起一阵火花。实验室外，胶囊公司的防御系统在神秘力量面前如同虚设，无数弗利萨军团的机械士兵涌入。
“布尔玛！”特兰克斯的怒吼声从远处传来。少年变身超级赛亚人，蓝色气焰冲天而起，光剑斩向机械士兵。但敌人数量太多，暗物质能量不断修复着被破坏的机械躯体。就在特兰克斯即将突破重围时，弗利萨的投影出现在他面前，随手一挥，一道暗物质屏障将他弹飞。
“想救你母亲？”弗利萨的声音充满戏谑，“那就告诉你们的伙伴，带着圣辉方舟的创世熔炉，独自来贝吉塔行星遗迹。否则，我会让布尔玛看着地球...一颗接着一颗，在她眼前爆炸。”投影消失的瞬间，布尔玛也被暗物质漩涡吞噬，只留下特兰克斯绝望的怒吼在实验室回荡。
圣辉方舟内，众人陷入沉默。悟空握紧拳头，指甲深深掐进掌心：“弗利萨这家伙，居然用布尔玛当人质！”贝吉塔的身体微微颤抖，银色纹路因愤怒而扭曲，他转身走向飞船操控台：“我现在就去！就算是陷阱，我也要把布尔玛救回来！”
悟饭拦住贝吉塔：“贝吉塔叔叔，冷静！这明显是圈套。弗利萨想要创世熔炉，肯定在行星遗迹布下了天罗地网。”比克点头补充：“而且，他夺取那四颗星球，一定有更大的阴谋。月球上封印着古老的力量，亚德拉特星藏着空间秘术，卡利克2星...据说有能改变现实的传说道具。”
影和萤驾驶宇宙船赶来，萤的第三只眼泛起光芒：“我探测到，四星球上都安装了混沌共振器。一旦启动，能引发连锁反应，将方圆星系都拖入混沌维度。”她的声音带着恐惧，“弗利萨...他要创造一个只属于自己的混沌宇宙。”
经过激烈讨论，众人制定计划。悟空、贝吉塔、悟饭三人前往贝吉塔行星遗迹营救布尔玛，同时摧毁共振器；比克带领天津饭、克林等人分别前往其他三颗星球，阻止混沌装置启动。圣辉方舟则由影和萤操控，在后方支援并随时准备接应。
贝吉塔行星遗迹上，曾经辉煌的赛亚人故乡如今只剩断壁残垣。暗物质笼罩着整个星球，弗利萨坐在由混沌能量构成的王座上，怀中的布尔玛被能量锁链束缚。“欢迎来到死亡之地，赛亚猴子们。”弗利萨抬手示意，无数混沌生物从地底涌出，“想要人？用创世熔炉来换！”
悟空和贝吉塔同时发动攻击，金色龟派气功与银色终极闪光轰向弗利萨。但敌人早有准备，暗物质屏障轻松挡下攻击。悟饭则寻找着混沌共振器的位置，紫金色光刃不断斩杀阻拦的怪物。战斗陷入胶着时，弗利萨突然按下手中的控制器，贝吉塔行星开始剧烈震颤——他竟要炸毁整颗星球，连同所有人一起埋葬！
另一边，比克在亚德拉特星与弗利萨的机械军团激战。他的魔贯光杀炮不断发射，却发现混沌装置被多重防护罩包裹。天津饭和饺子配合使用四妖拳，试图找到装置弱点；克林则用如意棒吸引火力，湛蓝色气焰在战斗中愈发耀眼。而在卡利克2星，悟天和特兰克斯变身超级赛亚人，对抗着能操控幻象的混沌守卫，寻找传说中的现实改写道具...
整个宇宙的命运，此刻系于一线。战士们能否在弗利萨的阴谋得逞前，救出布尔玛，摧毁混沌装置？而隐藏在暗处的真正危机，才刚刚露出冰山一角。