在一个小村庄里，有一位名叫怀娘的女子，她生下了一对奇异的双胞胎——先是一个健康的男婴乐山，紧接着却是一个神秘的蛋。这个蛋的出现，让满屋的人惊愕不已，纷纷认为它是不祥之兆，劝怀娘夫妇将其丢弃。但怀娘母性的光辉让她坚决留下了这个未知的生命。
第二日，蛋奇迹般地破裂，一条青色小蛇破壳而出，迅速爬向怀娘，仿佛在寻找母亲的温暖。尽管怀娘心中有些畏惧，但她还是温柔地让小青蛇不要靠近。小青蛇似乎能听懂人话，真的就停下了脚步。而怀娘的丈夫，对蛇有着天生的恐惧，想要将其丢弃到野外。但怀娘舍不得，夫妻俩最终决定将它养在家里的水缸中。
随着时间的流逝，小青蛇越长越大，通人性且温顺，从不到村里闲逛吓人，也不伤害村民。而哥哥乐山则调皮捣蛋，经常闯祸，还常常把责任推到蛇弟身上。蛇弟虽然不会说话，只能默默承受，但它从不怨恨哥哥，依然与他亲密无间。
有一天，乐山闯下大祸，打碎了村里的观音瓷像。父母极为愤怒，乐山害怕之下，再次将责任推给了蛇弟。父亲怒不可遏，抡起锄头砍断了蛇弟的尾巴。怀娘心疼地为它包扎伤口，而蛇弟只是痛苦地望着乐山，仿佛在诉说着无声的委屈。这次，父亲决定再也无法容忍蛇弟留在家里，等它伤好后，夫妇俩将它带到了村后的山林。
蛇弟离开后，乐山深感愧疚，向父母坦白了真相。但父母只是沉默不语。几年后，父亲重病去世，家里陷入困境。就在这时，蛇弟竟然带着猎物悄悄出现在家门口，帮助怀娘维持生计。从此，蛇弟每周都会送来猎物，怀娘用这些猎物换来的钱供乐山读书。
转眼间，乐山长大成人，要进京赶考。他依依不舍地告别母亲和蛇弟，踏上了求学之路。而蛇弟则继续守护着母亲，等待着哥哥的归来。
然而，乐山科考落榜后，在京城做起了生意，并渐渐取得了成功。但他一直不敢回家面对母亲，直到两年后，他才带着银子踏上归途。不料，途中遭遇强盗抢劫，银子被抢，生命危在旦夕。
就在这时，林中阴风阵阵，一条巨大的青蛇猛然窜出，吓退了强盗。乐山一看，正是蛇弟！他激动万分，知道是蛇弟来救他了。蛇弟见到哥哥也很开心，不停扭动身体表达着喜悦。
乐山问蛇弟是不是母亲让它来找自己的，蛇弟点点头。乐山又说自己现在银子被抢不想回家想在京城继续做生意等明年赚了钱再回家，蛇弟却不肯离开，眼睛紧紧盯着乐山脖梗上的玉坠。乐山明白蛇弟的意思，取下玉坠交给它让它带回去给母亲报平安。
蛇弟含着玉坠高兴地回家了。怀娘见到玉坠以为乐山平安无事心里很高兴，可是当蛇弟不会说话无法回答她乐山何时回家时她又担心起来。她不知道的是此时的乐山正在回家的路上。
而蛇弟因为无法解释清楚玉坠的来历和乐山的归期被怀娘误会以为它伤害了乐山悲痛欲绝之下选择了自杀来证明自己的清白。怀娘得知真相后更加悲痛欲绝她为自己冤枉了蛇弟而悔恨不已。
当乐山带着金银珠宝意气风发地回到家乡时却看到了满头白发、瘦弱不堪、神情呆滞的母亲和蛇弟的墓碑。他悲痛欲绝向母亲讲述了这几年的经历也得知了蛇弟的遭遇。他跪在蛇弟的墓前痛哭流涕诉说着自己的愧疚和思念。
就在这时奇迹发生了！一缕青烟从墓穴中升起蛇弟的尸体顿时化作了尘土。仿佛在告诉乐山它已经原谅了他也安息了。怀娘也哭着向蛇弟道歉请求它的原谅。这一刻母子俩终于释怀了。
乐山为了纪念蛇弟重新修整了它的墓穴并立下了一块碑文：“蛇弟虽异类，却具人心；一生愁苦，默默承受；善良品性，永存人间。”而怀娘也在儿子的陪伴下渐渐走出了失去蛇弟的阴影重新开始了新的生活。