南宋年间，杭州城外的清平镇，本是山清水秀、物产丰饶之地，百姓们安居乐业。可最近，镇上却发生了一系列离奇之事。
先是镇东头的王老汉家，一夜之间，家中所有值钱的物件不翼而飞，只留下一地凌乱的脚印。紧接着，镇西头的李寡妇也遭遇了同样的事情，她辛苦积攒多年的首饰和银两全都不见了。一时间，镇上人心惶惶，大家都怀疑是出了江洋大盗。
这日，镇上的大户赵员外也慌慌张张地跑到镇衙报案。原来，赵员外家中藏着一件祖传的宝贝——一枚散发着奇异光芒的夜明珠。这夜明珠不仅价值连城，据说还有辟邪驱鬼的神奇功效。可就在昨晚，夜明珠也失踪了，而且赵员外发现，窃贼似乎是从他家后院的一口古井中钻进来的，因为井边有明显的攀爬痕迹。
县令得知此事后，立刻派衙役们四处搜查，可几天过去了，一点线索都没有。百姓们议论纷纷，都觉得这窃贼神通广大，说不定是个妖怪。
灵隐寺的济公和尚听闻了此事，心中觉得蹊跷。他虽整日疯疯癫癫，却有着一双能看穿世间邪祟的慧眼。于是，济公摇着破扇，哼着小曲，来到了清平镇。
济公先是在镇上四处打听情况，然后又来到赵员外家查看那口古井。他围着古井转了几圈，口中念念有词，突然眼睛一亮，似乎发现了什么。
原来，济公察觉到这古井中有一股妖气弥漫。他断定，这窃贼并非普通人类，而是一只修炼成精的井妖。这井妖不知从何处得知了夜明珠的消息，便想将其据为己有，借助夜明珠的灵力提升自己的修为。
济公决定在晚上收服这只井妖。他让赵员外准备了一些雄黄酒、桃木剑和符咒，又让几个胆大的村民在古井周围埋伏起来。
夜幕降临，明月高悬。济公手持桃木剑，口中念念有词，将符咒贴在古井的井口上。不一会儿，古井中突然传来一阵低沉的咆哮声，紧接着，一股黑色的妖气从井中喷涌而出。
井妖化作一个黑影，从井中飞了出来。它张牙舞爪，口中喷出一股毒雾，朝着济公扑来。济公不慌不忙，拿起雄黄酒朝着黑影泼去。雄黄酒洒在黑影上，发出“滋滋”的声响，黑影痛苦地扭曲起来。
井妖见雄黄酒对它有克制作用，便改变策略，化作一道黑烟，想要逃走。济公早有防备，他挥舞着桃木剑，口中念动咒语，一道金光从剑尖射出，将黑烟笼罩住。黑烟在金光中挣扎着，却始终无法逃脱。
就在济公准备将井妖彻底收服时，突然从旁边窜出一个人影。这人影手持一把匕首，朝着济公刺来。济公侧身一闪，躲过了这一击。他定睛一看，原来是镇上的一个无赖，名叫张三。
原来，这张三早就觊觎赵员外的夜明珠，他得知井妖偷走了夜明珠后，便想趁机从井妖手中抢走宝贝。他见济公要收服井妖，生怕宝贝落入济公之手，便想先下手为强。
济公看着张三，冷笑着说：“你这无赖，不思悔改，还想抢夺宝贝，今日贫僧就一并收拾了你！”说罢，济公将桃木剑一挥，一道剑气朝着张三射去。张三吓得连忙躲闪，却不小心摔倒在地。
此时，井妖趁机想要再次逃脱。济公岂能让它得逞，他从怀中掏出一个破布袋，口中念念有词，然后将布袋朝着井妖扔去。布袋瞬间变大，将井妖吸了进去。济公收紧袋口，将布袋系在腰间。
接着，济公又逼问张三夜明珠的下落。张三见大势已去，只好如实交代。原来，井妖将夜明珠藏在了一个隐蔽的山洞里。济公让张三带路，来到了那个山洞。
在山洞中，济公果然找到了那颗散发着奇异光芒的夜明珠。他将夜明珠交还给赵员外，赵员外感激涕零，拿出重金想要酬谢济公。济公却摆了摆手说：“贫僧行侠仗义，不为钱财，只愿这清平镇能恢复往日的安宁。”
从那以后，清平镇再也没有发生过离奇的盗窃案，百姓们又过上了安居乐业的生活。而济公和尚也继续着他的云游之旅，在世间留下了更多惩恶扬善的传奇故事。