穿梭舰在“时之齿轮”坐标的指引下，驶入一片被量子迷雾笼罩的星域。林婉看着星图上不断扭曲的空间节点，因果锚上的瘟疫孢子纹路愈发清晰，仿佛在呼应某种古老的召唤。而在虹桥医链的废墟深处，沉睡的星孩突然睁开双眼，善恶双体融合后的混沌能量在其周身流转，形成一个微型宇宙的雏形。
“检测到空间波动与星孩的能量频率一致！”秦逸的银针在空中划出复杂卦象，却在接触迷雾的瞬间发出刺耳的嗡鸣。当穿梭舰突破最后一层屏障，眼前的景象令众人窒息——一座由齿轮与基因链交织而成的巨型装置悬浮在星核之心，装置中央的水晶棺内，沉睡着一个与星孩容貌相同的存在，他的胸口处镶嵌着一枚刻满《太素仙医录》禁术的齿轮。
“那是...星孩的‘原型体’？”林婉的晶化右手不受控制地颤抖，初代道侣的残片在锚刃中疯狂涌动。就在此时，虚数空间组织的神秘主宰现身，他摘下齿轮面具，露出与水晶棺中如出一辙的面容：“欢迎来到真相的核心，林医生。从宇宙诞生之初，你们就都是棋盘上的棋子。”
神秘主宰挥动手臂，齿轮装置开始运转，时空被切割成无数碎片。星孩的混沌能量从虹桥医链冲天而起，化作一道光柱连接装置。善体与恶体的意识在光柱中显现，展开激烈对峙。善体的光芒温柔而治愈，他轻声道：“停止这场争斗吧，用我的力量治愈所有伤痛。”而恶体的黑暗中带着愤怒：“他们从未停止过伤害！唯有毁灭，才能终结不平等！”
林婉与秦逸试图冲入光柱调解，却被神秘主宰设下的因果锁链困住。锁链上刻满他们的过往——医罪审判的血泪、虹桥医链的覆灭、以及无数因基因歧视而消逝的生命。“看到了吗？”主宰冷笑着，“你们的每一次反抗，都在推动我们的计划。星孩的善恶抉择，将决定宇宙是迎来新生...还是彻底归零。”
望舒突然挣脱束缚，他的基因烙印与星孩的混沌能量产生共鸣。少年摸索着走向光柱，盲眼中泛起奇异的光芒：“我...能听见他们的声音。善与恶不是对立，而是平衡的两面。”他的笛声响起，带着安抚与包容的韵律，竟让善体与恶体的争斗出现短暂停滞。
然而，虚数空间组织的舰队突然从时空裂缝中涌出，他们发射的归墟炮弹直击星孩的能量光柱。恶体的意识感受到攻击，愤怒彻底爆发，黑暗能量如潮水般扩散，所到之处，空间开始坍缩。善体试图阻止，却被恶体的力量压制：“你总是天真地相信救赎！看看这些刽子手，他们值得原谅吗？”
“值得。”林婉的声音穿透混乱。她挣脱因果锁链，将《基因宣言》高举过头顶：“因为仇恨只会滋生新的仇恨！初代道侣的遗愿，是让每个生命都有选择的权利，而不是用暴力定义对错！”她的话让星孩的能量产生震颤，善体与恶体的身影开始模糊。
神秘主宰见状，启动齿轮装置的核心程序。水晶棺中的原型体苏醒，他的手掌按在装置上，整个星域开始逆向运转。时间回溯的力量中，林婉看到了更可怕的真相——初代道侣正是为了阻止这个“宇宙重置计划”，才创造了星孩。而虚数空间组织，从始至终都在利用他们的反抗，来激活最终装置。
“星孩，做出选择吧。”主宰的声音充满蛊惑，“要么用毁灭终结一切，要么看着你的朋友们在时间逆流中消失。”光柱中的善恶双体缓缓靠近，他们的能量开始融合，形成一个全新的意识。林婉、秦逸和望舒握紧武器，准备迎接未知的结局。而在宇宙的各个角落，所有生命体都感受到了这场抉择带来的震颤——命运的齿轮，正在发出最后的轰鸣。