在余懋学的上疏之后，朱载坖当即作出反应，以构陷重臣出位妄言为由，将余懋学下诏狱严审，同时陆绎、朱应桢也很快将余懋学的相关档案送到了朱载坖的案头。余懋学确实是被张居正处理过的，因为他认为张居正是权臣，所以之前上疏弹劾过张居正，当然张阁老的心胸本来就不是那么开阔，当然狠狠的收拾了一下他，将他落职，也就是直接罢官，而弹劾他的正是时任右佥都御史劳堪，这个梁子确实是很大。
余懋学直到张居正去世，才在张四维等人等人的上疏之下重新被启用，这次自然是新仇旧恨一起算了，将劳堪、张居正全部弹劾了，朱载坖将余懋学下诏狱之后，内阁辅臣照例上疏申救，被朱载坖予以申斥，而在内阁申救不成之后，这些官员们则是继续上疏。
下一个英雄好汉是保定同知丘云章，他也上疏弹劾张居正，同时认为余懋学无罪，他是明目张胆的报私仇了，其实原因很简单，他父亲是丘橓，是徐阁老的打手之一，嘉靖二十九年进士，授行人，擢刑科给事中，弹劾南京兵部尚书的张时彻和严嵩党羽。
作为徐阁老的好狗，丘橓咬人这方面还是很有天赋了，丘橓劾由严嵩进者顺天巡抚徐绅等五人，世宗为黜其三。迁兵科都给事中。劾南京兵部尚书李遂、镇守两广平江伯陈王谟、锦衣卫指挥魏大经咸以贿进，大经下吏，陈王谟革任。已又劾罢浙江总兵官卢镗。但是在嘉靖末年，丘橓有点找不到北了，之前俺答犯宣大，总督杨选被逮。及寇退，丘橓偕其僚陈善后事宜，指切边弊。
其实就是想投机，这次嘉靖没有惯着他，赏了他廷杖六十，罢职为民。等到徐阁老上位，丘橓自然是行情好了，在徐阶的推荐之下，丘橓先后担任都察院河南道掌道御史，这可是个肥缺，在之前主要是负责配合吏部进行京察，然后又调任吏部考功司郎中，负责文官的考察，然后是吏部文选司郎中，负责文官的考选，有小冢宰之称，是朝廷公认的四大肥差之一。
然后被调任南京大理少卿，原因很简单，徐阁老卸任了，继任的李春芳、高拱等人自然不会对他有什么好感，不过也没有怎么过于为难他，只是将他调任南京，等到张居正上位，他满以为他的好日子来了，毕竟张居正是徐阶的政治继承人，他当然是想投靠张居正这个新任首辅，但是没想到张居正对于丘橓的态度就是一个字：滚。
张居正对于丘橓的观感极为不好，主要有两个原因，第一就是丘橓是言官出身，而高拱、张居正对于言官势力都是极为警惕的，高拱和张居正的一个核心的观点就是省议论，也就是言官都闭嘴，少扯些有的没的，而丘橓还想复制自己给徐阶当狗的经历，但是很显然，张阁老不需要狗，他需要的能干活的牛马，另外一个问题，就是丘橓自己了，既然想抱张阁老的大腿，起码应该把张居正的喜好摸清楚嘛，结果这个丘橓对于张居正的喜好和痛点是全然不知。
丘橓被张居正所讨厌的直接原因就是拖欠地方税款“数百十金”。虽然这个数字不大，但是对于张居正来说是绝对不能容忍的，因为朝廷彼时正在推行清丈田亩和清理欠粮，丘橓这么干，无疑是在和朝廷对着干，由此可见丘家在当地的人缘有多差了，丘橓好歹也是混过文选郎中的人，按理说在官场上应该是有很大能量的，毕竟他也曾经是徐阶的心腹，再加上也曾经做到过少卿这个位置，级别并不算低。
正常情况拖欠一些税粮，地方官府肯定是能遮掩就帮他遮掩的，毕竟与人方便与己方便，大明朝的官员们在这点上想的很清楚，像丘橓这样直接被地方官府点名题参的，说明两个问题，第一就是丘家在当地民愤极大，地方官府都不愿袒护，第二就是丘橓的人缘实在是太差了，不管是地方督抚，布按二司还是府州县官员，他们也算得罪的差不多了，不然地方官府不会这样指名题参的。
张居正对于这种人自然是深恶痛绝，不仅将丘橓罢官，甚至将他儿子也一道罢官，回家闲住，这就使得丘家对于张居正是切齿痛恨的，所以这次弹劾张居正，丘云章首当其冲，弹劾张居正专权罔上，厉行苛政，擅作威福，蔑祖宗法。对于丘云章的奏疏，朱载坖看过之后御批道：“叫内阁拟来重处！”
对于朱载坖的御批，申时行等人是很头疼，朱载坖的意思是很明确的，就是要重处丘云章，但是现在议论纷纷，内阁也要考虑影响，申时行等人希望尽量大事化小小事化了，所以申时行密疏奏称：“臣等仰惟陛下天纵聪明，乾刚独运。即今朝廷政事，各衙门章奏，无一件不经御览。无一事不出圣裁。些许小臣，不知妄言，原无损于皇上圣德。陛下明并日月，量同天地。区区小臣，不足以亵雷霆之威。”
申时行再次化身混凝土搅拌机，试图和稀泥，但是朱载坖并没有给申时行这个机会，朱载坖命令陆绎准备驾贴，逮捕丘云章，原本驾贴由刑科出具，作为执行逮捕、处决等司法行动的凭证，须秉承皇帝旨意使用，厂卫及地方衙门凭此行事，但是朱载坖命令司礼监将驾贴送内阁，要内阁副署用印之后再送刑科，朱载坖的意思是很清楚的，内阁在这件事情上想耍滑头，绝不可能。
逮捕丘云章的驾贴是你内阁副署并且签字用印的，朱载坖要的就是内阁的这个态度，一旦内阁副署用印，就不仅仅是朱载坖命令厂卫拿人了，而是经过内阁同意的行动，这也就代表了内阁的意思，文渊阁内，一众阁臣们面对这张小小的驾贴，不禁面面相觑。