米季纳镇，希罗娜等人全力对战阿尔宙斯，就连当吉祥物的米可利阿戴克跟在辅助的卡露乃负责的超能力队伍也加入起来！大辅眼看情况很是不利对大家说道：“情况对我们很不利，阿尔宙斯的实力实在是太强了，光是这样根本撑不住杨辉小智几人回来，我们也必须加入进去！”大大辅大小嘉儿太一素娜启人留姬拓也小泉大淑乃大树宁宁炎可风希亚几人同意点头！大小大辅嘉儿太一素娜淑乃拿出d3机跟跟暴龙机数码机同时大喊：“v仔兽迪路兽亚古兽比丘兽，究极进化；拉拉兽进化！”两只胜利暴龙兽凤凰兽究极v龙兽圣龙兽向日葵兽出现！拓也小泉也拿出武装暴龙机同时大喊：“融合进化，火龙兽；喷射风灵兽！”火龙兽喷射风灵兽出现！大树宁宁也拿出自己的暴龙机联合大喊：“咆哮兽，弩炮兽，星星兽们，麻雀兽数码合体！”咆哮兽x5就此提前出现！启人留姬对视一眼放出基尔兽妖狐兽同时大喊：“网络进化！”红莲骑士兽沙古牙兽出现，大到是有些尴尬，因为周围都是同伴，他根本不好下手给上一拳！青少女嘉儿挥出一二个圆球大喊：“上吧，骑士球！”阿尔法兽等十二位皇家武士出现，加上在场的红莲骑士兽，皇家骑士兽全员罕见到齐！青少女嘉儿笑呵呵的对大说道：“好了，面对这十二位你就可以没有任何顾虑的随便找一个挥拳揍去吧！”十二位皇家武士心里虽然骂骂咧咧的，但也没有说什么；大毫不犹豫的就向剑皇兽挥拳得到数码密码后让自己的亚古兽进化成为大地暴龙兽与向日葵兽站在一起！大小大辅嘉儿拿出神光棒变身成为迪迦卡蜜拉特利迦卡露蜜拉！炎可风希亚同时一个翻身跳跃同时大喊：“奥特合体！”分尸狂魔艾斯奥特曼出现与迪迦直盯着阿尔宙斯的角或其它位置，一个仿佛在思考怎么断角，另一个在寻找分尸位置；这让阿尔宙斯也忍不住打了个冷颤，对于这两个奥特战士的暴行它也是知道的，当即就对自己施展了更多的防御招式，以防万一被断角或分尸，虽然它只是一个分身，但也是有思想的！阿尔法兽离迪迦远一些喊道：“这是我们第一次在另一个异世界战斗，绝对不能丢了皇家武士团的脸！”其他皇家武士都点头同意，不过唯一尴尬的就是启人与基尔兽合体的红莲骑士兽尴尬地与自己的女朋友沙古牙兽站在其中不知道该怎么说？
就在皇家武士准备战斗的时候金甲龙兽突然对阿尔法兽奥米加兽红莲骑士兽一本正经的喊道：“大哥，大嫂，红姐，你们好！”而这一幕把准备战斗的大伙搞得一脸懵逼，阿尔法兽奥米加兽一脸愤怒的盯着金甲龙兽，红莲骑士兽一脸尴尬的看了一眼沙古牙兽没有发怒才松了口气盯着金甲龙兽，到是阿尔宙斯一脸若有所思地看了艾斯一眼吃瓜看着，仔细观察就能发现阿尔宙斯眼里净是吃瓜者才有的热情！反应过来的金甲龙兽一脸尴尬说道：“那个，我说我其实是被控制才说出那样的话，你们相信嘛？”红莲骑士兽沙古牙兽火龙兽喷射风灵兽跟最早去杨辉世界的大伙点头相信并且全部看向空中飞着的艾斯，艾斯摸了摸后脑急忙向阿尔宙斯发动攻击，阿尔宙斯当然当然是发动自己的招式阻挡，艾斯见状也不气馁，直接使出一招光之锯人的成名技——巨大光之电锯，就向阿尔宙斯发起猛攻！阿尔宙斯急忙使出守住防御起来暗自吐槽起来：“果然是分尸狂魔的继承者，都一样喜欢分尸暴力，要不是我反应快，早就被分尸了！”这时阿尔宙斯感觉自己的角有危险急忙一闪发现迪迦也不知不觉在什么时候来到自己身边要断自己的角！阿尔宙斯也决定认真一下使出自己的专属招式：制裁光砾！艾斯看到这招感受到里面的威力心里暗叫：“遭了！”然后将巨锯分成小锯防守，迪迦卡蜜拉特利迦卡露蜜拉皇家武士训练家跟神奇宝贝也是一样，甚至金甲龙兽也不断使出无数导弹才与大家勉强守住消耗了大量体力，而就在这时里面有两个耀眼的倩影正驾驶着一辆摩托车不断穿梭于大家身边，其中的小春在莉可驾驶着摩托车到达大家身边时将复活草扔进神奇宝贝或数码宝贝口中，本来还累得不行的神奇宝贝数码宝贝被复活草的那个恢复能力以及苦味激得连忙活过来吐了复活草！火龙兽还对莉可小春建议：“莉可小春，你们要不还是使用神奇泉水吧！”莉可摇头回答：“要是你们不想事后被被徐雅教训就还是先以复活草为主！”火龙兽喷射风灵兽红莲骑士兽沙古牙兽想起徐雅只能默默认怂！也慈看到莉可驾驶的摩托车惊讶喊道：“那不是太乐巴戈斯的形态转换模式嘛！这个小姑娘居然轻松就能驾驶了？！”素娜无奈说道：“这很难嘛，在杨辉的世界里，我们还经常被吉普车撞；哦，现在已经变成装甲车啦，驾驶技术也是万能手表里签到奖励的其中一个，难道莉可没有告诉过你这位冠军嘛？看来莉可真的还是一个宅女！”莉可红着脸对万能手表咳嗽一声说道：“素娜姐，我听得到；还有，我早就不是宅女了，我还经常跟着你们一起被徐雅训练呢；只不过还没有告诉我所在帕底亚地区的人罢了！”素娜笑嘻嘻说道：“等你什么时候获得咕咕咪，也就是小点的认可成为闺蜜再说吧，小宅女！”莉可直接无语！一旁的小遥无语吐槽起来：“真是的，现在正对抗阿尔宙斯，保护米季纳镇呀，她们还有心情说笑；哎，真羡慕她们的好心态！”小霞也点头说道：“好了，我们也要努力，好歹我们也是小光她们的前辈，第一、二代的女主，可不能输了气势！”原来徐雅还把小霞小遥也给带到，在知道小智小光可以去另一个世界后，小智也把一切告诉了两女，小霞小遥也知道了自己第一二代女主的身份！小遥同意与小霞一起指挥自己最强的伙伴全力以赴，阿尔宙斯见状也加大力度不断猛攻，就连迪迦卡蜜拉特利迦卡露蜜拉艾斯也开始有些能量不足！薰子看了一眼万能手表惊讶喊道：“现在连小智那边也有些不太顺利！”大家一听惊讶起来？
小智这里的的确确陷入困难，原因出在希娜身上，原来希娜的青梅竹马克宾就是奇辛的后代；因为克宾根本不相信自己的祖先就是造成现在这场危机的凶手，所以拜托希娜相信自己祖先奇辛一次，希娜也终于选择相信自己青梅竹马；所以大家刚一到达克斯与阿尔宙斯约定时间的世界就与奇辛相遇，奇辛指挥自控制的神奇宝贝开始攻击，杨辉徐雅小智小光小刚琉琪亚小望科拿渡渡鸟希娜急忙避开后其他人都急忙离开寻找达克斯，只有希娜选择留了下来，并且将未来正在发生的一切告诉了奇辛；小智小光几人终于找到被囚禁的达克斯解救出来，奇辛在知道一切后果然还是跟原剧情的一样调换了生命宝玉，将假的生命宝玉交给希娜！两人在前往遗迹的路上杨辉突然出现喊道：“站住，希娜，你就连调查一下眼前生命宝玉的警惕性也没有嘛！”希娜刚要解释杨辉就将她手里的假生命宝玉夺下扔在地面砸碎大吼起来：“真正的生命宝玉是阿尔宙斯用自己的力量制作出来，根本就不可能会被那么轻易砸碎！”说完又给奇辛一拳让奇辛吃疼的将怀里真正的生命宝玉掉落下来被渡渡鸟接住，希娜看到这一幕震撼不已，也终于真正相信了小智几人的话！奇辛气愤填膺大吼起来：“你们知道什么？没有了生命宝玉，这个城镇就会变回荒无人烟的一片焦土，根本就没有人可以继续生存下去；席多蓝恩，青铜钟，将生命宝玉夺回来！”被控制的席多蓝恩跟青铜钟只能被迫对渡渡鸟杨辉发动攻击！杨辉躲着也很气愤大吼起来：“别说的那么好听，你只不过是想利用生命宝玉的力量支配这个城镇的土地，野心家罢了！”这时的小智小光小望琉琪亚小刚科拿达克斯也终于赶了过来，席多蓝恩又一次发动攻击的一瞬间打飞希娜往外面的深渊掉落！就在在希娜一脸惊恐的时候一个身影突然飞来抱住了她喊道：“不要紧吧，已经没事了！”希娜一脸惊讶与感动的看着面前的少年喊道：“小智！”小智将希娜带到达克斯身边后与小光杨辉徐雅对视一眼后一脸愤怒的盯着奇辛！渡渡鸟与科拿阿姨也终于发挥出自己身为四天王的实力将席多蓝恩与青铜钟的控制装置破坏掉，小智小光杨辉徐雅四人也将奇辛狠狠地教训了一顿，已经认清奇辛真面目的希娜看着被殴打的奇辛并没有心软，小刚小望琉琪亚渡渡鸟科拿阿姨也将剩下被控制的神奇宝贝解救出来，并且解决掉奇辛设置的陷阱，奇辛与他的所有亲信全部被控制住！
不久阿尔宙斯终于出现来到遗迹，达克斯也终于按照约定将生命宝玉还给了阿尔宙斯；而同一时刻，古代米季纳镇全部恢复成为荒无人烟的状态！希娜有些担忧走到达克斯身边问起：“这样可以嘛？没有问题吧？”达克斯摇头笑着回答：“未来阿尔宙斯会愤怒就是作为过去的我们弥留下来的过错造成的，现在我们只不过是回归原样罢了；而且，只从跟你们相遇后我终于明白过来，只有与神奇宝贝共同努力，互相尊重，一定能让现在荒无人烟的米季纳未来更加镇生机勃勃！虽然不知道会花上多长时间？不过我们一定会努力的！”小智走来回答达克斯：“未来你们凭借自己与神奇宝贝互相互相合作，共同的努力的确将米季纳镇重新变得生机勃勃；而且，这一次是靠你们自己的双手一步一步创造出来的！”达克斯听了很是欣慰与安心回答：“是嘛！谢谢你！”阿尔宙斯这时也终于注意到不是这个时代的小智几人疑惑盯着小智问道：“你是？”小智很是激动回答：“我叫做小智！”阿尔宙斯透过小智几人看到未来被围攻，既要防止迪迦断角，又要提防随时分尸的艾斯，历练一群训练家演戏的自己；未来的阿尔宙斯若有所思地回应让过去的阿尔宙斯看到自己原本应该经历的两个不同历史，也知晓了后来小智几人可以通过穿梭门到杨辉徐雅世界的经历！阿尔宙斯看着小智几人认真回答：“我只能给你们一次机会，未来你们能否通过我的测试就要看你们自己的努力！”杨辉徐雅一听顿时明白过来笑了笑杨辉回答：“我们知道了，我相信大家一定会通过测试的！”阿尔宙斯响起未来被围攻的自己咳嗽一声说道：“那个测试只能是这里选中的四人参加！”于是阿尔宙斯擅自为未来的自己做主选出参加人员小智小光杨辉徐雅四人，然后将消息传送给了未来的自己后离开！四人沉默许久后小智苦笑着问杨辉徐雅：“哪个，你们没事吧？”只见徐雅立刻兴奋起来大喊道：“太好了，终于有机会能与阿尔宙斯比试一场，实在是太让人期待！”希娜笑了笑若有所思的看着小智；其实阿尔宙斯不只是选择测试人员，也偷偷向希娜传递了一个信息！不久感觉到历史改变的帝牙卢卡将小智几人在达克斯的祝福中回到未来！看到小智几人回来的阿尔宙斯立刻装做刚反应过来盯着小智喊道：“小智，一次机会！三个小时以后，通往测试的通道就会出现！”说着就离开，还偷偷使出小偷技能从小智背包里顺走几瓶神奇泉水，徐雅小智小光等去过杨辉世界的人跟杨辉徐雅所有感应的面面无语地盯着离开的阿尔宙斯；三个小时以后，传送门出现，小智小光在花子彩子一脸担忧与期待中与杨辉徐雅一起进入了传送门！