然而，这一切却引起了太医院某些太医的嫉妒。他们一直自恃清高，如今一个小小医馆竟得如此殊荣，心中很是不甘。于是，他们暗中收集医馆所谓的“把柄”，向皇帝进谗言，称医馆虽有良方，但行事作风颇为散漫，恐有损皇家威严。
皇帝听闻后，决定亲自调查。他微服来到医馆，看到的却是忙碌而有序的景象，医者们对待病人不分贵贱，悉心救治。还有许多穷苦之人在此免费得到医治。皇帝大为感动，回宫后严惩了那些搬弄是非的太医。
此事过后，医馆名声更盛。清婉也因此受到皇帝更多敬重，皇帝还下旨让宫中御医定期到医馆学习交流。清婉则继续钻研医术，她将医馆中的病例整理成册，以便后人借鉴。而那些心怀嫉妒之人再也不敢轻易招惹医馆，医馆在清婉等人的努力下，不断发展壮大，真正成为造福天下百姓的仁德之所。
随着医馆日益兴盛，前来求医之人越来越多，甚至不少外邦人也慕名而来。清婉意识到可以借此机会传播中医文化，便挑选了一些精通外语的学徒，专门接待外邦患者，并向外邦人讲解中医理论。
一日，一位身份尊贵的外邦公主身患怪病，本国医生皆束手无策。听闻清婉医馆之名，特来求诊。清婉仔细诊断后，开出独特药方。经过一段时间治疗，公主康复如初。外邦国王大喜，送上诸多奇珍异宝，并请求清婉前往他们国家传授医术。清婉考虑再三后拒绝，但表示愿意接收外邦弟子前来学医。
此事传扬开后，医馆更是声名远播。国内其他医馆纷纷效仿清婉医馆的经营模式和医德理念。清婉并未藏私，反而主动分享经验，整个医疗行业风气为之一新。皇帝得知后，更加赞赏清婉，不仅赏赐有加，还赐下一块牌匾，上书“仁心妙手，济世医馆”，从此清婉医馆名垂青史。清婉的医馆愈发兴旺，她的名声也传遍四海。不久后，邻国发生一场大瘟疫。该国君主派人来恳请清婉前去救助。清婉深知此去艰难，但医者仁心，还是带着几个得力徒弟踏上行程。
到达邻国后，清婉发现这里疫情远比想象严重。但她毫不退缩，运用自己精湛的医术，结合当地药材资源，迅速制定出应对方案。她指挥众人熬制药汤，分发药物，同时教导当地人防疫知识。
在清婉的努力下，瘟疫渐渐得到控制。邻国上下对清婉感恩戴德，欲封她为国师，清婉婉拒。回国之时，皇帝亲自出城迎接。清婉带回许多异国的草药种子，在医馆后面开辟药园种植。此后，清婉将此次抗疫经验整理成书，全国医者人手一本。清婉医馆的地位越发崇高不可撼动，传承数代而不衰，始终秉持着最初的仁德之心，成为中医史上一座不朽的丰碑。多年以后，清婉已至暮年。她将医馆事务逐渐交给最得意的弟子打理。一日，她坐在医馆的院子里晒太阳，回忆起往昔种种。这时，一位年轻女子前来拜访。女子自称是当年那位被治好怪病的外邦公主的后人。原来，外邦那边又出现一种罕见病症，公主的后人听闻清婉医馆的传奇，特来寻求解决之道。尽管清婉身体已不如从前，但仍耐心听女子讲述病情症状。她翻出多年积累的医书病案，凭借着丰富的经验，给女子指出一个方向，推荐了几种可能有效的药材与疗法。女子感激涕零，带着清婉给予的希望回去尝试。不久之后，传来消息，按照清婉所说，病症得以治愈。清婉听到这个消息，脸上露出欣慰的笑容。在她临终之际，她嘱咐弟子们要永远坚守医馆的仁德传统，无论面对何种困难与诱惑。而后，清婉安详离世，但她的名字和她所代表的医馆精神永远流传世间，后世医者无不以她为楷模。