南方灾区的重建工作，在格物院“标准化+以工代赈”的模式下，如火如荼地进行着。一片片“格物新村”拔地而起，清理出的田地里，晚稻和各类速生蔬菜顽强地探出新绿，曾经被绝望笼罩的土地上，重新焕发出勃勃生机。陈野这把“粪勺”，似乎真的将淤泥掏成了沃土，将灾难掏成了新生。
然而，就在这看似一切向好之际，一片不祥的阴云，伴随着夏日潮湿闷热的气候，悄然笼罩了刚刚缓过一口气的灾区。
最先发现异常的是胡青带领的医药组。他们在巡诊过程中，陆续接到报告，荆州下辖的几个刚刚完成清淤、开始恢复生产的乡镇，出现了大规模的腹泻、呕吐、高热症状，发病急，传播快，尤其是集中在使用了新挖掘的浅层水井作为水源的村落。
“公爷，情况不对！”胡青带着一身药味，急匆匆找到正在视察一个新村落建设进度的陈野，脸色凝重，“不是普通的受凉或者吃坏肚子，症状很统一，高热不退，上吐下泻，严重的已经出现脱水抽搐！而且，集中在几个水源地相近的村子，像是有传染性！”
陈野正拿着一块标准化墙体构件跟老鲁讨论能不能再减轻点重量，闻言眉头立刻皱了起来：“传染？确定吗？不是喝了脏水闹的？”
“卑职初步排查，发现即便是烧开的水，饮用后仍有发病者。而且，发病者之间多有接触史。更蹊跷的是，”胡青压低声音，“我们按照《防疫须知》处理了尸体和污染源，按理说不该这么快出现这种规模的疫情。卑职怀疑……水源可能在被清理后，又受到了某种持续的污染。”
“持续的污染？”陈野眼神一凛，“带老子去看看！”
在胡青的带领下，陈野来到了疫情最严重的清水乡（名字此刻充满了讽刺）。乡里的临时医疗点已经人满为患，痛苦的呻吟声和孩童的哭闹声不绝于耳。空气中弥漫着消毒石灰和呕吐物混合的刺鼻气味。看到陈野到来，乡正和几个老者如同看到救星，跪地哭诉。
“国公爷！救命啊！这瘟神……瘟神又来了！”
“刚开始还好好的，水也清了，房子也盖了，地也种了，怎么突然就……就倒下一大片啊！”
陈野没空安抚他们，直接让胡青带他去查看新挖的水井。井水看起来清澈，但凑近了能闻到一丝若有若无的、不同于泥土腥味的怪异气味。
“取样！立刻用你们那套法子检验！”陈野对胡青下令，同时扭头对赵虎说，“去，把沈括、李明远也叫来！让他们带着附近的水文地质资料！”
很快，沈括和李明远赶到，铺开了清水乡周边的地图和水文记录。
“公爷，根据记载，清水乡地下水源丰富，但地质结构较为复杂，有多条地下暗河交汇。”沈括指着地图上的标记，“洪水带来的大量污染物，可能渗透到了深层地下水系，或者……在某些我们尚未察觉的断层或溶洞中形成了污染源，持续不断地释放毒素。”
胡青那边的初步检测结果也出来了，脸色更加难看：“公爷，水样中发现了……一种从未见过的微小生物，数量极多！在显微镜下（格物院医药组配备了简易版本）能看到它们快速游动！很可能就是这东西在作祟！”
“微小生物？”陈野凑到显微镜前，眯着眼看了半天，只看到一些密密麻麻蠕动的小点，“就这玩意儿能让这么多人病倒？”
“千真万确！”胡青语气肯定，“卑职翻阅古籍，有类似‘蛊毒’、‘瘴气’致病的记载，或许就是此类微小生物所致！它们可能通过水源传播，也可能通过病人呕吐物、排泄物污染环境后，经由蚊虫鼠蚁再次传播！”
情况瞬间变得清晰而严峻。这不是简单的卫生问题，而是一场由未知病原微生物引发的、可能通过水源和接触多种途径传播的瘟疫！传统的隔离、消毒手段，恐怕难以完全阻断！
“妈的！刚赶走洪水这头明狼，又来了瘟疫这只暗鬼！”陈野骂了一句，但眼神却异常冷静。他这把“粪勺”，看来不光要掏淤泥，还得学会消毒杀菌了！
他立刻将临时指挥部前移到了清水乡，开始了新一轮的部署，这一次，对手是看不见摸不着的瘟神。
“第一，严格隔离，切断传播！胡青！”
“卑职在！”
“立刻划定疫区！清水乡及周边出现病例的村落，许进不许出！所有发病者集中隔离治疗，密切接触者单独观察！调拨所有库存的纱布（格物院纺织组产物）和防水油布，搭建标准的隔离帐篷，垃圾、排泄物必须深埋或焚烧！参与救治和管控的人员，必须佩戴口罩（用多层纱布和棉絮简单制作），接触病人后必须用酒精（高度蒸馏酒）洗手！”
“是！”
“第二，水源管控，寻找源头！沈括、李明远！”
“学生在！”“下官在！”
“你们的数据组，给老子全力分析疫区水文地质资料！结合胡青发现的这种‘微小生物’的习性（如果需要，就现场抓几只老鼠或者蚊子研究它们是不是携带者），给老子推算出最可能的污染源头区域！哪怕是地下暗河、废弃矿洞，也得给老子找出来！”
“是！”
“第三，特效药物，全力攻关！胡青，医药组全员转向！既然知道了是‘小虫子’作怪，就给老子想办法弄死它们！用咱们已知的所有药材试验，看看哪种煮出来的水或者提取的精华，能杀灭水里的这些玩意儿！还有，研究怎么提升病人自身的抵抗力，对症治疗的方子也要优化！”
“卑职领命！”
“第四，舆论引导，稳定人心！刘明远（远程）！”
“下官在！”
“以朝廷和格物院的名义，发布安民告示！如实说明疫情，但更要强调我们已经找到病因，正在全力防治！严禁散布谣言，蛊惑人心！告诉百姓，相信格物院，相信朝廷，乱跑乱闹只会死得更快！”
“明白！”
“第五，物资保障，全面支援！鲁大锤！”
“俺在！”
“你的工坊，再转个型！全力生产口罩、隔离帐篷、消毒用的喷壶（利用气压原理），还有……大量烧制胡青他们需要的医疗器皿，比如那种带刻度的玻璃瓶！要快！”
“没问题公爷！”
格物院这台万能机器，再次高速切换模式，从重建转向防疫灭瘟。
清水乡及周边被迅速封锁，士兵和差役在外围设立警戒线。内部，胡青带着医药组的人，穿着简陋的防护，冒着被感染的风险，日夜不停地救治病患，记录病情，试验药物。隔离区内，秩序虽然紧张，但在格物院吏员的组织下，并未出现大的混乱。
沈括和李明远带着人，扛着测量仪器，几乎将疫区周边翻了个底朝天，结合水样检测和数据模型，最终将污染源锁定在距离清水乡五里外的一处废弃的铅锌矿洞。洪水倒灌入矿洞，溶解了里面的有害矿物，又通过复杂的地下裂隙网络，污染了清水乡的地下水系。
胡青那边，经过无数次试验，发现用特定比例煎煮的黄连、黄芩等药材，对水中的“微小生物”有较好的杀灭效果，同时，用补气固本的人参、黄芪等药材辅助治疗，能显着提升重症病人的存活率。
然而，最大的挑战来自于人心。尽管有安民告示，但随着疫情持续，死亡人数的增加，以及被隔离的不便，恐慌和谣言还是在部分灾民中蔓延开来。
有人传言这是“龙王爷降罪”，因为格物院动了河堤，惹怒了水神；有人说是朝廷不管灾民死活，要放弃他们；甚至有人暗中串联，想要冲击隔离区，逃往他处。
这天夜里，陈野正在临时指挥所研究胡青送来的最新药方，赵虎急匆匆进来汇报：“公爷，不好了！清水乡东头聚集了上百号人，拿着锄头棍棒，嚷嚷着要冲卡子出去！带头的是个跳大神的巫婆，说只要用童男童女祭祀河神，瘟疫自消！”
“祭祀河神？童男童女？”陈野眼中寒光一闪，勐地站起身，“妈的！真是作死！走！”
他带着赵虎和一小队护卫，立刻赶到东头隔离卡口。只见那里火把通明，上百名情绪激动的灾民围在那里，与守卡的士兵推搡对峙。一个穿着花花绿绿、脸上涂满油彩的老巫婆，正站在一块大石头上，手舞足蹈，尖声叫嚷：“……河神发怒！需用至纯童男女祭祀，方能平息！格物院逆天而行，必遭天谴！冲出此地，方能活命！”
在她的煽动下，人群骚动加剧，眼看就要失控。
陈野分开人群，走到最前面，冷冷地盯着那巫婆。
巫婆看到陈野，先是一惊，随即更加卖力地尖叫：“就是他！这个镇国公！触怒河神！他是瘟神派来的！”
陈野没理她，而是转向躁动的人群，声音不大，却清晰地压过了所有嘈杂：
“祭祀河神？用孩子？老子看你们是昏了头！”
他指着那巫婆：“她说什么你们就信什么？她那么能通神，怎么不让她自己去河里跟河神唠唠？看她能不能活着爬上来？”
人群一阵骚动。
陈野继续道：“老子告诉你们，瘟疫的元凶，不是河神，是水里有看不见的‘小虫子’！格物院的胡神医，已经找到了杀灭它们的药方！清水乡里面，每天都有病好的人被送出来！你们现在冲出去，把病带到别处，害死更多的人，那才是真正的造孽，要下十八层地狱！”
他让人抬过来一个刚刚从疫区康复、还有些虚弱的年轻汉子，对众人说：“看看他！三天前还躺在隔离区等死，喝了胡神医的药，现在能站着说话了！这就是格物院的法子！信格物院，还是信那个装神弄鬼的老妖婆，你们自己选！”
那康复的汉子也哑着嗓子道：“乡亲们……别犯糊涂……格物院的药……真的管用……”
事实胜于雄辩。看到活生生的康复者，又听到陈野条理清晰的分析，大部分灾民冷静了下来，看向那巫婆的眼神充满了怀疑和愤怒。
那巫婆见势不妙，还想狡辩，陈野对赵虎使了个眼色。赵虎会意，一个箭步上前，如同拎小鸡般将巫婆从石头上拎了下来，从她怀里搜出了几包可疑的粉末和几锭来历不明的银子。
“大家看看！这就是她所谓的‘神通’！用迷药和银子蛊惑人心！”陈野将证据示众，“把她押下去，仔细审问，看看是谁在后面指使！”
真相大白，人群彻底平息，羞愧地散去。
经此一役，疫区的秩序彻底稳定下来。格物院的防治措施得以顺利推行。污染源矿洞被找到并封堵，新的、安全的水源被开辟，胡青优化的药方在大量临床验证后，效果显着，死亡率大幅下降。
一个月后，清水乡疫情被成功扑灭。当最后一批隔离者解除观察，走出隔离区时，阳光正好，洒在这片历经磨难的土地上。
陈野站在高处，看着劫后余生、相互搀扶着走向新家园的百姓，对身边的胡青等人说道：
“瞧见没？瘟神再厉害，也怕咱们这讲科学、讲实在的‘粪勺’！以后编《天工录》，得再加个《防疫驱瘟篇》，把这次的经验教训都写进去！”
胡青等人郑重地点点头。
南方的天空，终于彻底放晴。格物院这把“粪勺”，在掏完了淤泥、定住了波涛之后，又成功地进行了一次大规模的“消毒杀菌”，将瘟神的暗影，彻底从这片土地上驱散。