苏清瑶与汐澈刚完成潮汐音柱的防御调试，灵汐分院的能量监测仪就发出刺耳的蜂鸣。屏幕上，学院外围的空间坐标突然涌现出成片的红色光点，如同漆黑宇宙中骤然亮起的恶意星火。“是机械虫群！数量至少十万只，正以超光速向学院逼近！”汐澈法杖顶端的灵汐水晶剧烈闪烁，投射出虫群的全息影像——那些机械虫通体漆黑，外壳布满锯齿状的利刃，尾部喷射着淡蓝色的能量火焰，正是暗械联盟的标志性武器“噬能虫”。
苏清瑶立刻接通公共通讯频道，声音带着罕见的急促：“各分院注意！暗械联盟发动突袭，噬能虫群即将抵达，立刻启动一级防御预案！”频道里瞬间传来各分院院长的回应，紧接着，创世星核广场的预警灯塔爆发出刺眼的红光，六大分院的能量屏障同时升起，在学院上空交织成一张巨大的七彩防护网。
林凡此时正在生命之树旁与姜晓莹、冯旭平检查防护网的能量节点，接到警报后立刻跃上冯旭平早已备好的“重甲机甲”。机甲的驾驶舱内，全息星图已标注出虫群的行进路线，冯旭平的手指在操控面板上翻飞，调出所有安保舰队的部署情况：“暗星舰队和星环舰队已在学院外围形成第一道防线，但噬能虫数量太多，估计撑不过二十分钟。”姜晓莹将一块镶嵌着地脉之心碎片的能量石插入机甲的能量接口：“这能为机甲提供额外的地脉能量，森叶院长已经带领森灵学员启动‘生命藤盾’，在防护网内侧构建第二道屏障。”
机甲腾空而起的瞬间，林凡看到生命之树的枝干快速延伸，无数藤蔓缠绕着发光的叶片，在防护网下方编织成密不透风的绿色屏障，共情花在藤蔓间快速绽放，释放出能安抚心神的能量波动。苏清瑶的光影能量已覆盖整个学院外围，在防护网表面勾勒出层层叠叠的光纹，形成“光影折射阵”——当年在光影遗址，正是这阵法让他们躲过了暗影残魂的追击。
“轰！”第一波噬能虫撞上防护网，剧烈的撞击让整个学院都轻微震颤。防护网表面的光纹与藤盾同时亮起，将虫群撞击产生的能量吸收转化，一部分反哺给防护网，一部分滋养着生命之树。但噬能虫的可怕之处很快显现，它们开始用尾部的能量火焰喷射防护网，同时用锯齿外壳疯狂啃噬，不少藤蔓被烧断，光纹也出现了细微的裂痕。“它们在吞噬防护网的能量！”冯旭平的额头渗出冷汗，监控屏显示防护网的能量储备正以每分钟3%的速度下降，“再这样下去，最多四十分钟防护网就会破裂！”
林凡突然想起苏清瑶之前提到的“潮汐音柱”：“清瑶！启动潮汐音柱的高频共振模式！噬能虫的外壳虽然坚硬，但内部的能量核心对高频声波敏感！”通讯器里传来苏清瑶的回应：“已经启动！但需要三分钟时间蓄力，而且音柱会消耗大量潮汐能量！”林凡立刻下令：“晓莹，用生命之树的能量为音柱补充动力；旭平，带我去虫群的指挥中枢，暗械联盟肯定有母虫控制虫群，只要摧毁母虫，虫群就会失控！”
冯旭平操控机甲突破虫群的包围圈，机甲的肩部炮台不断喷射能量弹，在虫群中炸开一道道缺口。沿途，林凡看到星环舰队的“织线战舰”正用能量织线缠绕成片的虫群，将它们困在半空；森灵学员操控着会喷射腐蚀性汁液的“腐叶虫”，配合机械分院的“自爆机器人”，清理着漏网的噬能虫。姜晓莹的声音在通讯器里不断传来：“生命能量已接入潮汐音柱，蓄力进度70%……90%……蓄力完成！”
“嗡——”六道潮汐音柱同时发出震耳欲聋的声波，淡蓝色的声波带着规律的共振频率扩散开来。前方的噬能虫群瞬间陷入混乱，不少虫子的外壳开始破裂，内部的能量核心暴露在外，发出滋滋的声响。苏清瑶的光影能量适时跟上，将声波笼罩的区域照亮，让冯旭平精准锁定了虫群中央那只体型是普通噬能虫十倍的母虫——它的外壳呈暗金色，背部有三根巨大的能量天线，正不断释放着控制信号。
“就是它！”冯旭平操控机甲举起右臂的巨型能量炮，炮口汇聚着金色的源纹能量和绿色的地脉能量。林凡将镌刻笔按在机甲的能量核心上，将自身的本源能量全部注入：“用‘共生炮’！这是我们唯一的机会！”能量炮发出耀眼的光芒，一道金色与绿色交织的能量束直奔母虫而去。母虫似乎察觉到危险，立刻释放出大量小型噬能虫组成护盾，但在共生炮的威力下，护盾如同纸糊般破碎，能量束精准命中母虫的能量天线。
母虫发出一声尖锐的嘶鸣，背部的天线轰然断裂，身体剧烈抽搐起来。失去控制的噬能虫群瞬间陷入疯狂，开始相互攻击。就在众人以为危机解除时，冯旭平的机甲突然失控，操控面板上的指示灯全部变红：“不好！机甲被暗械联盟的远程程序入侵了！”机甲不受控制地朝着创世星核飞去，速度越来越快，肩部的能量炮也开始自动充能，炮口对准了星核的核心能量舱。
“是‘机械寄生程序’！”姜晓莹的声音带着焦急，“上次机械分院的锻造炉失控就是因为这个程序，它能通过能量波动入侵机械装置！”林凡立刻试图用源纹能量切断程序连接，但寄生程序的入侵速度极快，机甲的操控权已完全丧失。苏清瑶突然出现在机甲前方，她的光魂印记爆发出前所未有的光芒，双手结出复杂的光纹：“林凡，用源纹能量保护机甲驾驶舱！我用‘光影封印术’暂时冻结机甲的能量系统！”
金色的源纹能量在驾驶舱周围形成屏障，苏清瑶的光影能量如锁链般缠绕住机甲，机甲的动作逐渐变得缓慢。但光影封印术的消耗极大，苏清瑶的脸色很快变得苍白，光魂印记的光芒也开始黯淡。“清瑶！别硬撑！”林凡大喊着，突然想起冯旭平机甲上的应急手动装置——那是当年两人一起改装的，为的就是防止程序入侵。他不顾机甲的剧烈震颤，伸手去够驾驶舱侧面的手动摇杆。
就在这时，母虫突然用尽最后一丝力气，朝着机甲发射了一枚黑色的能量弹。“小心！”姜晓莹操控着生命藤条瞬间延伸，在机甲前方形成一道厚厚的藤盾。能量弹击中藤盾的瞬间，藤盾轰然破碎，但也为林凡争取了宝贵的时间。他终于抓住了手动摇杆，猛地向后一拉，机甲的引擎发出刺耳的轰鸣声，硬生生改变了飞行轨迹，擦着创世星核的能量舱飞过，撞在旁边的山体上。
冯旭平立刻打开驾驶舱，将有些眩晕的林凡扶了出来。苏清瑶也虚弱地降落在两人身边，光魂印记的光芒微弱得几乎看不见。姜晓莹快步赶来，将三瓶生命汁液递给他们：“快喝了，能快速恢复能量。”远处，失去母虫控制的噬能虫群已被各分院的联合部队清理干净，暗械联盟的残余战舰也在星环舰队的追击下仓皇逃窜。
但危机并未完全解除。冯旭平从机甲的损坏部件中取出一枚微型芯片，接入检测仪后，屏幕上显示出一段加密信息。苏清瑶用光影能量破解密码后，一段冰冷的机械音响起：“林凡，这次只是警告。创世星核的能量不属于你们这些低等文明的共生废物，三天后，我们会启动‘星核吞噬计划’，让机械文明重新统治宇宙！”信息播放完毕，芯片瞬间自爆，只留下一缕黑色的烟雾。
三天时间转瞬即逝。这三天里，学院的所有人都在紧锣密鼓地准备着。冯旭平修复了所有受损的机甲和战舰，在创世星核周围布设了“机械干扰网”，能屏蔽任何远程程序入侵；姜晓莹和森叶将生命之树的根系延伸至星核的能量舱下方，形成“生命能量循环系统”，为星核提供额外的能量支撑；苏清瑶则与汐澈一起，将潮汐音柱和光影符文结合，打造出“共振防御阵”，能将外来攻击的能量转化为防御能量；林凡则带着镌刻笔，在星核的核心能量舱刻下了最古老的“源纹守护阵”——这是他从源纹文明的古籍中找到的终极防御阵法，需要消耗大量本源能量。
第三天深夜，学院外围的空间突然扭曲，一艘巨大的暗械战舰缓缓浮现，战舰的外形如同一只巨大的机械蜘蛛，腹部的能量舱散发着不祥的黑色光芒。战舰的主炮开始充能，一道黑色的能量束直奔创世星核而去。“启动所有防御阵！”林凡大喊着，将本源能量注入源纹守护阵，金色的光芒从星核表面爆发出来。
黑色能量束击中防护网的瞬间，共振防御阵立刻启动，将一部分能量转化为淡蓝色的潮汐能量和金色的光影能量，反哺给防护网；生命藤盾则吸收了另一部分能量，让生命之树的叶片更加翠绿；源纹守护阵则牢牢挡住了剩余的能量冲击，金色的光纹与黑色能量剧烈碰撞，发出震耳欲聋的声响。冯旭平操控着所有战舰同时开火，能量弹如同流星雨般砸向暗械战舰，却被战舰表面的能量屏障挡了下来。
“他们的目标是星核的能量舱！”苏清瑶突然发现，暗械战舰的主炮正在调整角度，瞄准了星核能量舱的薄弱部位——那里正是当年林凡刻下共生纹的地方。她立刻飞向能量舱，用光影能量在薄弱部位构建屏障，却被战舰发射的次级能量弹击中，身体重重摔在地上。林凡看到这一幕，双眼通红，不顾姜晓莹的阻拦，手持镌刻笔冲向暗械战舰：“我去摧毁他们的主炮！你们守住星核！”
“等等！我跟你一起去！”冯旭平操控机甲追上林凡，机甲的背部展开一对能量翅膀，“当年在地球遗迹，我们就是一起突破的，这次也一样！”姜晓莹将一枚能量玉佩抛给林凡：“这是用生命之树和地脉之心共同炼制的，能保护你的本源能量！”苏清瑶也强撑着站起身，释放出所有的光影能量，在林凡和冯旭平前方开辟出一条通道：“我用光影能量干扰他们的雷达，你们趁机靠近！”
林凡和冯旭平顺着光影通道快速靠近暗械战舰，机甲的肩部炮台不断开火，吸引战舰的注意力。林凡则借助机甲的掩护，跳到战舰的外壳上，用镌刻笔在外壳上刻下“源纹爆破阵”。就在阵法即将完成时，战舰内部突然冲出几名穿着机械战甲的暗械战士，手中的能量刀朝着林凡砍来。冯旭平立刻挡在林凡身前，用机甲的手臂挡住攻击，机甲的外壳被砍出一道深深的裂痕：“快走！我来挡住他们！”
林凡咬紧牙关，将最后一笔刻完，源纹爆破阵爆发出耀眼的金色光芒，战舰的主炮瞬间被炸毁。失去主炮的暗械战舰开始慌乱，冯旭平趁机操控机甲将林凡拉回学院，姜晓莹和苏清瑶立刻用生命能量和光影能量为两人治疗。暗械战舰见大势已去，释放出大量烟雾，准备仓皇逃窜，却被突然出现的灵汐分院舰队拦住了去路——汐澈带着灵汐学员驾驶着“潮汐战舰”，用潮汐能量形成漩涡，将暗械战舰困在其中。
“暗械联盟，你们的统治梦该醒了！”林凡站在创世星核的顶端，手持镌刻笔，将本源能量注入源纹守护阵。金色的光纹扩散开来，将暗械战舰完全笼罩，战舰表面的能量屏障逐渐破碎。各分院的舰队同时开火，暗械战舰在密集的攻击下轰然爆炸，化作宇宙中的一团烟火。