万界联邦在清除洪荒界混沌隐患的过程中，发现混沌海深处存在一道“超大型空间裂缝”——此裂缝由混沌之主与林尘此前的战斗引发，裂缝中不断涌出新的混沌气，甚至有低阶混沌生物通过裂缝进入洪荒界，若不及时修复，将成为新的混沌污染源，威胁整个多元宇宙的空间稳定。
作为联邦唯一达到混元境的修士，林尘（混元境初期）亲自牵头修复工作。此次行动，苏瑶（太阴境大圆满）、洪岩（盘古境大圆满）、玄空（合道境大圆满）等核心成员全部随行——苏瑶负责用太阴力稳定裂缝周边的混沌气、洪岩负责用盘古力加固空间结构、玄空负责用佛元净化裂缝中的混沌生物，而林尘则需借助太初鼎的“空间本源修复功能”，引导宇宙本源之力填补裂缝。
临行前，太初鼎再次进化，解锁“混元空间修复模式”，可精准定位裂缝的空间节点，辅助林尘控制本源之力的输出。同时，联邦还从各体系抽调二十名合道境大圆满修士，组成“空间防御阵”，为修复过程提供安全保障。
抵达混沌海深处，众人被空间裂缝的规模震撼——裂缝长达千丈，宽数十丈，内部漆黑一片，紫黑的混沌气如潮水般涌出，裂缝周边的空间因不稳定产生扭曲，甚至有修士的道力被空间乱流吞噬。苏瑶立刻释放太阴境大圆满的净化力，银白的光罩笼罩住裂缝周边，暂时压制了混沌气的扩散；洪岩则引动盘古境大圆满的力量，凝聚“盘古空间盾”，加固扭曲的空间结构。
林尘手持太初鼎，飞到裂缝正前方，启动混元空间修复模式——鼎身释放出淡金的空间本源光，精准扫描裂缝的每一个节点。扫描结果显示，裂缝深处存在“空间本源断层”，需注入大量宇宙本源之力才能填补，而这需要林尘突破当前境界，提升对本源之力的掌控精度。
“所有人全力维持防御，我要冲击混元境中期！”林尘向众人下达指令，随后运转“混元真经”至极限，引动自身的混元境初期道力与太初鼎中的空间本源之力融合。在引导本源之力注入裂缝的过程中，他需同时应对三重挑战：一是裂缝中混沌气的反向侵蚀、二是空间乱流对道力的干扰、三是本源之力注入时的反噬。
混沌气不断冲击林尘的道力屏障，空间乱流导致本源之力的输出轨迹出现偏差，而本源之力的反噬更是让他的道果产生剧烈震荡。就在此时，苏瑶通过双生羁绊将太阴力传递给林尘，洪岩与玄空也释放自身的法则之力，形成“三元辅助阵”，帮助林尘稳定道力、修正本源之力的轨迹。
在众人的辅助下，林尘逐渐掌控了本源之力的输出节奏，他开始尝试将本源之力与裂缝的空间节点精准对接。对接过程中，他突然领悟到“混元为核，以核统空间”的真谛——丹田内的混元境初期道纹开始吸收周围的空间本源与多元法则之力，逐渐凝聚出更深层次的道纹。
当最后一个空间节点被本源之力填补，裂缝开始缓慢闭合时，林尘体内的道果突然爆发出强光——混元境初期道纹彻底转化为“混元境中期纹”，周身萦绕的混元力形成淡金的空间光罩，能自主修复周边的小型空间裂缝，对宇宙本源之力的掌控精度提升十倍，气息正式突破混元境初期，达到“混元境中期”！
突破后的林尘修复效率大幅提升，他引动混元境中期的力量，配合太初鼎将剩余的空间本源之力注入裂缝。半个时辰后，超大型空间裂缝彻底闭合，周边的混沌气被苏瑶与玄空联手净化，空间乱流也在洪岩的盘古力压制下消失。
为防止裂缝再次出现，林尘在闭合处设置了“空间本源监测阵”，一旦空间稳定性下降，阵法将自动发出预警，并释放混元力进行初步修复。此次修复不仅解决了混沌海的空间隐患，还让林尘对混元法则的理解更深一层，为后续应对黑袍人复活后的终极决战奠定了基础。
返回混元圣地后，林尘召开联邦核心会议，宣布混沌海空间裂缝修复完成，并将此次突破过程中领悟的“空间本源掌控术”传授给核心成员，帮助他们提升对空间法则的理解。会议最后，林尘强调：“黑袍人虽未彻底复活，但我们的准备必须更充分，唯有不断突破自身，才能守护多元宇宙的和平。”
随着林尘突破混元境中期，万界联邦的整体实力迎来新的飞跃，而混沌海空间裂缝的修复，也标志着联邦混沌隐患清零计划在洪荒界取得阶段性胜利，为后续清理剩余混沌隐患、迎接终极决战铺平了道路。