跨宇宙能量枢纽的战舰改造区，“黑暗探查号” 的本源能量防护模块已完成 60% 的涂层改造，泛着淡金色光芒的空间稳定涂层均匀覆盖在模块表面，与之前融入的本源核心区能量碎片相互呼应，让战舰的抗风暴能力提升了数倍。陈玄站在改造平台上，手中把玩着那枚淡金色的碎片，指尖能清晰感受到碎片传递出的微弱能量感应 —— 这股感应与黑暗深渊方向的联系越来越紧密，显然始祖意识备份已距离第三枚碎片越来越近。他低头看了眼改造进度表，距离远古黑暗封印破碎还有二十天，而战舰改造仍需十天才能完成，若不能尽快拿到第三枚碎片，等他们抵达本源核心区时，很可能已错失打开能量屏障的最佳时机。
“陈玄，雾隐矿脉传来紧急信号！开采小队遭遇‘深渊守护者’袭击，机械兵已损失五台，空间结晶的开采设备也被摧毁，小队正被困在矿脉深处，请求紧急支援！” 苏璃的声音带着急促，银镯上的通讯画面显示，矿脉外围的暗黑色能量中，一道巨大的身影正疯狂攻击小队的防御护罩，护罩的能量条已降至 30%，随时可能破碎。
“深渊守护者？” 陈玄心中一沉，立刻放下手中的碎片，“这绝不是巧合！始祖意识备份很可能通过碎片感应，知道我们在开采空间结晶，故意派守护者袭击，阻止战舰改造！暗影使者，随我乘坐应急战舰前往支援；苏璃，你留在枢纽，继续监督战舰改造，同时用银镯解析深渊守护者的能量特性，为我们提供远程支援；时空守护者，加强对黑暗深渊中层的监测，一旦发现始祖意识备份的动向，立刻通知我们！”
半小时后，应急战舰驶离枢纽，向雾隐矿脉疾驰而去。舰桥内，苏璃的声音通过通讯器传来：“银镯检测到，深渊守护者的能量与深渊衍生生物同源，但强度是其五倍，且具有‘能量吸收能力’，能吞噬普通的净化能量，转化为自身的攻击能量！它的弱点在胸口的‘能量核心晶’，只有用平衡能量与本源碎片能量的融合能量，才能彻底摧毁核心晶！”
暗影使者释放暗影能量，在战舰周围构建双层隐蔽层：“雾隐矿脉被暗黑色的‘雾隐能量’笼罩，这种能量会干扰探测仪的信号，我们需要在抵达矿脉前，关闭战舰的主动探测，依靠被动感应接近，防止被守护者提前发现。”
两小时后，应急战舰抵达雾隐矿脉外围 —— 矿脉隐藏在一片巨大的小行星带中，暗黑色的雾隐能量如浓雾般笼罩着整个区域，即使在战舰内部，也能感受到能量带来的压抑感。“被动感应检测到，深渊守护者在矿脉深处的‘结晶矿洞’外，正持续攻击开采小队的防御护罩，小队的能量储备最多只能支撑半小时！” 少年的声音带着紧绷，屏幕上的被动感应图显示，守护者的体型约五十米，周身环绕着暗黑色的能量，胸口的能量核心晶泛着刺眼的红色光芒。
“我们从矿脉的侧后方绕过去，趁守护者攻击护罩时，从背后发起突袭！” 陈玄做出决断，应急战舰缓缓调整航向，向矿脉侧后方飞去。当距离结晶矿洞还有一公里时，陈玄与暗影使者纵身跃出战舰，平衡能量与暗影能量在周身形成防护层，悄无声息地穿过雾隐能量，向守护者靠近。
此时，深渊守护者正高举巨大的黑色能量锤，准备向防御护罩发起最后一击 ——“平衡能量?突袭！” 陈玄突然从背后发起攻击，金黑能量刃直刺守护者的能量核心晶。守护者察觉身后的攻击，急忙侧身躲避，能量刃擦过它的肩膀，在黑色鳞片上留下一道深深的裂痕，暗黑色的能量从裂痕中泄漏。
“吼 ——” 守护者发出一声愤怒的嘶吼，转身挥舞能量锤，向陈玄袭来。“暗影能量?束缚！” 暗影使者释放暗金色的能量锁链，缠绕住守护者的四肢，暂时限制它的行动。“就是现在！攻击核心晶！” 陈玄纵身跃起，光剑凝聚平衡能量与本源碎片能量的融合能量，金黑光芒暴涨，再次向核心晶刺去。
守护者突然爆发强大的能量，挣脱能量锁链的束缚，同时胸口的核心晶释放出一道巨大的黑色能量波，向陈玄袭来。“平衡能量?双生屏障！” 陈玄构建一道金黑屏障，挡住能量波的攻击，屏障表面泛起剧烈涟漪，却始终没有破碎。暗影使者趁机绕到守护者的身后，暗影能量凝聚成尖刺，刺入守护者的背部，守护者的动作瞬间停滞。
陈玄抓住机会，光剑再次刺向核心晶 ——“咔嚓” 一声，核心晶破碎的瞬间，守护者发出一声凄厉的嘶吼，身体开始快速透明，最终化为暗黑色的能量消散。可就在守护者消散的同时，一道淡金色的碎片从它的核心晶位置析出，悬浮在半空中 —— 正是第三枚本源核心区能量碎片！
“第三枚碎片！我们找到了！” 陈玄兴奋地伸手抓住碎片，可刚触碰到碎片，一股强烈的意识冲击突然袭来 —— 碎片中藏有 “深渊意识印记”，正试图入侵他的意识，让他成为深渊势力的傀儡！“小心！碎片中有意识印记！” 陈玄立刻将平衡能量注入碎片，金黑能量顺着碎片快速流动，意识印记的冲击被暂时压制，却并未彻底消失。
“开采小队已安全！但空间结晶的开采设备被摧毁，短期内无法继续开采，我们需要从其他矿脉调配空间结晶！” 暗影使者的声音传来，开采小队的防御护罩已解除，幸存的机械兵正开始清理矿脉周围的雾隐能量。
陈玄将第三枚碎片放入净化能量容器，与之前获取的碎片放在一起 —— 三枚碎片相互靠近时，突然爆发出淡金色的光芒，光芒中浮现出一幅模糊的星图，星图上标注着本源核心区能量屏障的具体位置，以及 “碎片能量同步开启” 的字样。“星图显示，能量屏障在本源核心区的‘本源之海’外围，需要将三枚碎片的能量同步注入屏障的三个能量节点，才能打开屏障！” 苏璃的声音带着兴奋，银镯正快速解析星图的细节，“但第三枚碎片中的意识印记，很可能会在同步时干扰能量输出，导致同步失败，甚至引发屏障爆炸！”
陈玄深吸一口气，心中清楚，清除意识印记是当前最紧迫的任务 —— 他将三枚碎片交给苏璃：“返回枢纽后，立刻用七大核心的纯净能量，尝试清除第三枚碎片中的意识印记；同时加快空间结晶的调配，务必在战舰改造完成前，获取足够的结晶，确保改造不被延误！”
应急战舰带着开采小队与第三枚碎片，向跨宇宙能量枢纽疾驰而去。舰桥内，陈玄凝视着容器中的三枚碎片，心中满是感慨 —— 从破解黑暗星云迷阵，到摧毁始祖能量晶，再到如今获取三枚碎片，每一步都充满了危险与挑战，而这，只是前往本源核心区的前奏。他能预感到，接下来的旅程，将会面临更强大的敌人与更严峻的考验，但为了跨宇宙的和平，他别无选择，只能勇往直前。
在黑暗深渊的中层，始祖意识备份正悬浮在一片废墟之上，他能清晰感受到第三枚碎片的能量波动消失，取而代之的是陈玄团队的能量信号。“陈玄，你竟然拿到了第三枚碎片！” 始祖的意识中充满了愤怒，“但你以为这样就能打开能量屏障吗？本源之海深处，还藏着‘本源守护兽’，它会将所有闯入者化为能量，成为本源之力的一部分！你永远也别想拿到本源之力！” 始祖的意识向黑暗深渊的核心区域返回，他要提前做好准备，在陈玄团队抵达本源核心区时，给予他们致命一击。
跨宇宙能量枢纽内，苏璃已开始用七大核心的纯净能量，尝试清除第三枚碎片中的意识印记 —— 淡金色、绿色、银白色等七种能量环绕着碎片，缓慢渗透进碎片内部，暗黑色的意识印记在纯净能量的冲刷下，逐渐变淡，却始终顽强地抵抗着。“意识印记的强度远超预期，需要持续净化二十四小时，才能彻底清除！” 苏璃的声音带着疲惫，银镯的光芒也变得微弱，“但好在空间结晶的调配已完成，预计明天就能送达枢纽，不会影响战舰改造的进度。”
陈玄站在净化平台旁，看着逐渐变淡的意识印记，心中的紧迫感也随之缓解 —— 只要能在战舰改造完成前清除印记，他们就能按时前往本源核心区，打开能量屏障，获取本源之力。他抬手看了眼改造区的方向，“黑暗探查号” 的轮廓在灯光下逐渐清晰，仿佛已做好准备，迎接即将到来的本源核心区之旅。
当第二天的第一缕宇宙光透过枢纽的观测窗时，空间结晶准时送达，战舰改造再次加速；第三枚碎片中的意识印记也在七大核心能量的持续净化下，彻底消失。