（起自乙酉年[公元25年]，止于丙戌年[公元26年]，共计二年。）
世祖光武皇帝上之上 建武元年（乙酉，公元25年）
春季，正月， 方望和安陵人弓林共同拥立前汉定安公刘婴为天子，聚集党羽数千人，占据临泾县。更始帝（刘玄）派遣丞相李松等人率军击败他们，将方望、弓林全部斩首。
邓禹率军抵达箕关，击败河东郡都尉，进而包围了安邑城。
赤眉军的两支队伍在弘农郡会合。更始帝派遣讨难将军苏茂率军抵抗；苏茂军大败。赤眉军于是大规模集结，便以万人为一营，共设三十营。三月， 更始帝派遣丞相李松与赤眉军在{艹务}乡交战，李松等人大败，战死三万多人。赤眉军于是转向北进，到达湖县。
蜀郡功曹李熊劝说公孙述应该称帝。夏季，四月， 公孙述登上帝位，国号“成家”，年号“龙兴”；任命李熊为大司徒，弟弟公孙光为大司马，公孙恢为大司空。越巂郡的任贵占据本郡投降了公孙述。
萧王刘秀在元氏县进击尤来、大枪、五幡等部农民军，追击到北平县，连续击败他们；又在顺水（徐水）北岸交战，萧王乘胜轻率冒进，反而被敌军打败。萧王自己跳下高岸，遇到骑兵突击部队的王丰下马将马让给萧王，萧王才勉强得以逃脱。溃散的士兵退守范阳县据守。军中不见萧王踪影，有人说他已经战死，将领们不知如何是好，吴汉说：“大家努力！萧王哥哥的儿子（刘章、刘兴）在南阳，何愁没有主公！”众人仍感恐惧，过了几天才安定下来。敌军虽然战胜，但慑于萧王的威名，乘夜撤退。萧王大军再次追击到安次县，接连交战，击败敌军。敌军退入渔阳郡，所过之处大肆掳掠。强弩将军陈俊向萧王建议说：“敌军没有辎重，应该命令轻骑兵绕到敌军前面，让百姓各自坚壁清野以断绝他们的粮食来源，就可以不战而歼灭敌人了。”萧王同意，派遣陈俊率领轻骑兵飞速赶到敌军前方，看到有坚固完好的堡垒，就下令坚守；对散布在田野的百姓，则趁机收掠保护起来。敌军到达后，一无所获，于是溃散败逃。萧王对陈俊说：“困住这些贼寇的，是将军的计策啊。”
冯异写信给李轶，向他陈述利害祸福，劝他归附萧王；李轶知道长安（更始政权）已经危在旦夕，但因为曾参与杀害刘演（刘伯升），内心不安，于是回信说：“我李轶本来和萧王最先谋划复兴汉朝，现在我守卫洛阳，将军您镇守孟津，都占据着关键位置，这是千载难逢的机会，希望我们能同心协力（‘思成断金’）。请向萧王详细转达我的心意，我愿意进献愚策来辅佐国家安定百姓。”李轶自从与冯异通信后，就不再与冯异交战争锋，因此冯异得以向北攻取天井关，攻克上党郡的两座城池，又南下攻取河南郡成皋县以东的十三个县，投降的民众有十多万。武勃率领一万多人攻打那些叛变的县城，冯异在士乡亭下与武勃交战，大败武勃军，斩杀武勃；李轶紧闭城门不救武勃。冯异见李轶的诚意有效，便将情况详细报告了萧王。萧王回复冯异说：“李季文（李轶）为人狡诈多变，别人难以抓住他的要害。现在将他的书信转告各郡太守和都尉，让他们警惕防备。”大家都奇怪萧王为何要公开李轶的书信；朱鲔听说此事后，果然派人刺杀了李轶。从此洛阳城中人心背离，很多人投降了萧王。
朱鲔听说萧王北上征讨而河内郡兵力空虚，便派遣部将苏茂、贾强率领三万多人渡过巩河（洛河巩县段），进攻温县；朱鲔亲自率领数万人进攻平阴县，以牵制冯异。告急文书传到河内郡，寇恂立即集结军队急速出发，并传令所属各县发兵到温县城下会合。军吏们都劝谏说：“现在洛阳敌军渡过黄河，前后不断。应该等各路大军全部集结完毕，再出兵迎战。”寇恂说：“温县，是河内郡的屏障，失去温县，郡城就守不住了。”于是火速奔赴温县。第二天早晨，两军交战，恰逢冯异派来的援军以及各县的军队及时赶到，寇恂命令士兵登上城头擂鼓呐喊，大声喊道：“刘公（刘秀）大军到了！”苏茂的军队听到喊声，阵势动摇。寇恂乘机率军冲击，大败苏茂军。冯异也渡过黄河攻击朱鲔，朱鲔败走；冯异和寇恂追击到洛阳城下，绕城一周后返回。从此洛阳震动惊恐，白天也紧闭城门。
冯异、寇恂向萧王呈送捷报，将领们入营祝贺，乘机请求萧王称帝。将军南阳人马武首先进言说：“大王您虽然坚持谦逊退让，但如何对得起宗庙社稷呢！应该先登上帝位，然后再商议征伐之事。现在这样，谁是贼人（指更始帝）而您却要奔走攻击呢？”萧王吃惊地说：“将军怎么说出这种话！该杀头了！”于是率军返回蓟城。又派遣吴汉率领耿弇、景丹等十三位将军追击尤来等部农民军，斩首一万三千多级，一直穷追到浚靡县才返回。溃散的贼寇逃入辽西、辽东，被乌桓、貊人（高句丽等）劫掠殆尽。都护将军贾复在真定与五校农民军交战，身受重伤。萧王大惊道：“我之所以不让贾复单独领兵，就是因为他轻敌。果然如此，我损失了一员名将！听说他的妻子怀有身孕，如果生下女儿，我的儿子娶她；如果生下儿子，我的女儿嫁给他；不要让他为妻子儿女担忧。”贾复的伤不久痊愈，在蓟城追上萧王，两人相见非常高兴。大军回到中山国，将领们再次请求萧王称帝；萧王仍不答应。走到南平棘县，将领们又坚决请求；萧王还是不同意。将领们将要退下时，耿纯上前说：“天下的士大夫们，离别亲属，抛弃家乡，追随大王在刀箭之间出生入死，他们的心思本来就是希望攀龙附凤（追随明主），以实现自己的志向罢了。现在大王拖延时间，违背众人意愿，不登帝位，我担心士大夫们的希望断绝，计谋用尽，就会产生离去的念头，不愿长久地自寻苦吃了。众人一旦离散，就很难再聚合了。”耿纯的话非常诚恳真切，萧王深受感动，说：“我将考虑这件事。”
大军行至鄗县，萧王召见冯异到鄗县，询问四方的动静。冯异说：“更始帝必定失败，忧虑宗庙社稷的重任落在大王肩上，您应当听从众人的建议！”这时，恰逢儒生强华从关中捧着《赤伏符》来见萧王，符上说：“刘秀发兵捕不道，四夷云集龙斗野，四七之际火为主。”（刘秀起兵讨伐无道，四方各族如云聚集，群雄如龙争斗于郊野，四七二百二十八汉朝中兴，火德之主当运）。群臣趁机再次上奏请求。六月，己未（二十二日）， 萧王在鄗县南郊即皇帝位（是为光武帝）；改年号（为建武），大赦天下。
邓禹包围安邑城，几个月未能攻下。更始帝的大将军樊参率领数万人，从大阳县渡过黄河，准备攻打邓禹。邓禹在解县以南迎击，斩杀了樊参。王匡、成丹、刘均集结十余万军队，再次一同进攻邓禹，邓禹军作战不利。第二天，癸亥（二十六日）， 王匡等人因为这天是“六甲穷日”（古代以干支纪日，癸亥是六十甲子的最后一天，被认为不宜出兵），没有出战，邓禹因此得以重新整顿军队。甲子（二十七日）， 王匡出动全部军队进攻邓禹。邓禹命令军队不得轻举妄动，等敌军到达营垒下时，才传令各将领击鼓并进，大败敌军。王匡等都败逃，邓禹追击斩杀了刘均和河东太守杨宝，于是平定了河东郡。王匡等人逃回长安。
张卬与将领们商议说：“赤眉军早晚就要到了，我们不久将被消灭，不如抢掠长安，然后向东逃回南阳；事情如果不成功，就再入湖池中做强盗！”于是共同入宫，劝说更始帝；更始帝发怒不答应，没人敢再说话。更始帝派王匡、陈牧、成丹、赵萌驻守新丰，李松驻军槀城，以抵抗赤眉军。张卬、廖湛、胡殷、申屠建与隗嚣密谋，打算在立秋日举行貙膢祭祀（一种祭祀）时共同劫持更始帝，以实施他们先前（抢掠东归）的计划。更始帝得知消息，托病不出，召张卬等人入宫，准备将他们全部诛杀，只有隗嚣称病未入宫，并召集门客王遵、周宗等率兵自卫。更始帝犹豫不决，张卬、廖湛、胡殷怀疑有变故，便冲了出去。只有申屠建还在宫中，更始帝斩杀了申屠建，派执金吾邓晔率兵包围隗嚣的宅第。张卬、廖湛、胡殷率兵烧毁宫门，冲入宫中激战，更始帝大败。隗嚣也突围，逃回天水。第二天清晨，更始帝向东逃奔到新丰赵萌那里。更始帝又怀疑王匡、陈牧、成丹与张卬等同谋，便一同召见他们；陈牧、成丹先到，当即被斩杀。王匡恐惧，率军进入长安，与张卬等人会合。
赤眉军进抵华阴县，军中有一位齐地的巫师，常常击鼓跳舞祭祀城阳景王（刘章），巫师狂言道：“景王大怒说：‘应当做天子，为什么当贼！’”有嘲笑巫师的人就会生病，军中一片惊动。方望的弟弟方阳劝说樊崇等人道：“现在将军您拥有百万大军，西向皇帝都城（长安），却没有称号，被人称为一群贼寇，不能长久。不如拥立一位刘姓宗室，挟持正义进行征伐，以此号令天下，谁敢不服从！”樊崇等人认为有理，而巫师的预言更加频繁。大军前进到郑县，便共同商议说：“如今迫近长安，而鬼神如此示意，应当寻求刘氏后裔共同尊立为帝。”
在此之前，赤眉军经过式县时，掳掠了前式侯刘萌的儿子刘恭、刘茂、刘盆子三人随军。刘恭从小学习《尚书》，跟随樊崇等人在洛阳投降了更始帝，被封为式侯，担任侍中，留在长安。刘茂和刘盆子留在军中，归属右校卒史刘侠卿，负责放牛。等到樊崇等人想拥立皇帝时，在军中寻找城阳景王的后裔，找到七十多人，其中只有刘茂、刘盆子以及前西安侯刘孝血缘最近。樊崇等人说：“听说古时候天子统率军队称‘上将军’。”于是写了“上将军”三个字的木片作为符信。又把两个未写字的木片放在竹筒中，在郑县北郊设立坛场，祭祀城阳景王，所有三老、从事（赤眉军各级头领）都参加大会。让刘盆子等三人站在中间，按年龄大小顺序抽取木片。刘盆子年龄最小，最后抽，却抽中了符信；将领们都向他称臣跪拜。刘盆子当时十五岁，披散头发，光着脚，穿着破旧衣服，紧张得满面通红流汗，看见众人跪拜，害怕得想哭。刘茂对他说：“把符信藏好！”刘盆子却立即咬断符信，扔掉了。赤眉军拥立刘盆子为帝后，任命徐宣为丞相，樊崇为御史大夫，逢安为左大司马，谢禄为右大司马，其余人都被任命为九卿或将军。刘盆子虽然被立为皇帝，但早晚仍要拜见刘侠卿，时常想跑出去跟放牛娃玩耍；刘侠卿生气地制止他，樊崇等人也不再问候探视他。秋季，七月，辛未（初五）， 光武帝派使者持节任命邓禹为大司徒，封酂侯，食邑一万户；邓禹当时年仅二十四岁。又商议选任大司空，光武帝因《赤伏符》上有“王梁主卫作玄武”的话（预言王梁将像玄武水神守护卫国一样辅佐他），丁丑（十一日）， 任命野王县令王梁为大司空。光武帝又想依据谶文任命平狄将军孙咸代理大司马，众人都不高兴。壬午（十六日）， 任命吴汉为大司马。当初，更始帝任命琅邪人伏湛为平原太守。当时天下起兵，只有伏湛安然自若，安抚百姓。他的门下督（属官）密谋为他起兵，伏湛将其逮捕处斩。于是官吏百姓信赖归向他，平原郡得以保全。光武帝征召伏湛为尚书，让他负责审定旧的典章制度。又因为邓禹西征，任命伏湛为司直（代理丞相府事务），代理大司徒的职务。光武帝每次外出征伐，常留伏湛镇守都城。
邓禹从汾阴县渡过黄河，进入夏阳县。更始政权的左辅都尉公乘歙率领他的部众十万，与左冯翊的军队在衙县共同抵抗邓禹；邓禹再次击败并赶走了他们。
宗室刘茂在京县、密县一带聚集部众，自称厌新将军，攻下颍川、汝南郡，部众达十余万人。光武帝派骠骑大将军景丹、建威大将军耿弇、强弩将军陈俊攻打他。刘茂前来投降，被封为中山王。
己亥（疑误，或为七月某日）， 光武帝到达怀县，派遣耿弇、陈俊驻军五社津，防备荥阳以东地区；派吴汉率领建义大将军朱祜等十一位将军，在洛阳包围朱鲔。八月， 光武帝前进到河阳县。
李松从槀城率军返回，跟随更始帝与赵萌一同在长安攻打王匡、张卬。连战一个多月，王匡等败逃，更始帝迁居长信宫。赤眉军到达高陵县，王匡、张卬等开城迎接投降，于是联合赤眉军共同进攻长安东都门。李松出城交战，被赤眉军生擒。李松的弟弟李况是城门校尉，打开城门将赤眉军放了进来。九月， 赤眉军进入长安。更始帝单人匹马逃走，从厨城门逃出长安。式侯刘恭因为赤眉军拥立了他的弟弟（刘盆子），便将自己绑起来囚禁在诏狱；听说更始帝败逃，才出狱，去见定陶王刘祉。刘祉替他除去刑具，一同到渭水河滨追随更始帝。右辅都尉严本，担心放走更始帝会被赤眉军诛杀，便将更始帝挟持到高陵县，自己率兵守卫，实际上是包围了他。更始帝的将相都投降了赤眉军，只有丞相曹竟不肯投降，手持宝剑格斗而死。
辛未（疑误，或为十月某日）， 光武帝下诏封更始帝为淮阳王；官吏百姓有敢杀害他的，罪同大逆；将其押送官府的封为列侯。
当初，宛城人卓茂，宽厚仁慈，谦恭爱人，性情恬淡坦荡，乐守圣贤之道，朴实而不浮华，行为在清正与随和之间，自少年到老年，从未与人争执过，家乡的亲朋故旧，虽然品行才能与卓茂不同，却都爱慕他，与他交往甚欢。汉哀帝、平帝年间担任密县令，爱民如子，举善行以教化百姓，口无恶言，官吏百姓亲近爱戴他，不忍心欺骗他。曾有人告发一个亭长接受了他赠送的米肉，卓茂问：“是亭长向你索要的，还是你有事托他办而接受的，或者是你平常出于情意送给他的？”那人说：“是我主动送给他的。”卓茂说：“你送给他，他接受了，为什么还要告发呢？”那人说：“我私下听说贤明的君主，能让百姓不畏惧官吏，官吏不向百姓索取。现在我畏惧官吏，所以才送他东西；官吏既然最终接受了，所以我来报告。”卓茂说：“你是个不懂事理的人啊！人之所以能聚居在一起而不混乱，不同于禽兽，是因为有仁爱礼义，懂得互相敬重。你偏偏不想修身，难道能远走高飞，不在人间生活吗！官吏只是不应当依仗权势强行索取罢了。亭长一向是个好官，逢年过节送他一点东西，这是礼节。”那人说：“如果这样，法律为什么禁止呢？”卓茂笑着说：“法律设立的是大的原则，礼义则顺应人情。现在我用礼义来教导你，你一定没有怨恨；如果用法律来惩治你，你该怎样举动呢！一门之内，小错可以责罚，大错可以诛杀。你回去好好想想吧。”当初，卓茂到密县上任时，废除了一些不合理的制度，官吏百姓嘲笑他，邻城的人听说后也都讥笑他没有才能。河南郡为此另外设置了代理县令；卓茂并不介意，照常处理政事。几年后，教化大行，道不拾遗；升任京部丞（司隶校尉属官），密县的老少都流泪送别。等到王莽摄政，卓茂因病辞官回家。光武帝即位后，首先访求卓茂，卓茂当时已七十多岁。甲申（九月某日）， 光武帝下诏说：“名声冠于天下，就应当受到天下的重赏。现在任命卓茂为太傅，封褒德侯。”
臣司马光评论说：孔子说“举荐善行来教导百姓，即使能力不足也能得到劝勉”，所以舜帝举用了皋陶，商汤举用了伊尹，而不仁的人就远离了，这是因为有德行的缘故。光武帝刚即位的时候，群雄竞逐，天下大乱，那些能摧坚陷阵的猛将，有权谋诡辩的策士，正被世人看重，而光武帝却能选用忠厚之臣，表彰奉公守法的官吏，从平民中提拔他们，安排在朝廷重臣的首位，这正符合他能够光复汉室、长久享有帝位的原因，就在于他懂得什么是首要任务并抓住了根本。
将领们包围洛阳几个月，朱鲔坚守不降。光武帝因为廷尉岑彭曾经是朱鲔的校尉，派他前去劝降。朱鲔在城上，岑彭在城下，向他陈述成败得失。朱鲔说：“大司徒（刘演）被害时，我曾参与谋划，又劝谏更始帝不要派遣萧王（刘秀）北伐，我确实自知罪孽深重，不敢投降！”岑彭返回，详细报告光武帝。光武帝说：“办大事的人不计较小怨。朱鲔现在如果投降，官职爵位都可以保全，更谈不上诛杀惩罚了！黄河水在此为证，我决不食言！”岑彭又去告诉朱鲔，朱鲔从城上放下绳索说：“如果真讲信用，可乘此绳上来。”岑彭上前抓住绳索就要攀上。朱鲔见他确有诚意，就答应投降。辛卯（十月某日）， 朱鲔把自己反绑起来，和岑彭一起到河阳县晋见。光武帝亲自解开他的绑绳，召见了他，又让岑彭连夜送他回洛阳城。第二天早晨，朱鲔和苏茂等率领全部部众出城投降。光武帝任命朱鲔为平狄将军，封扶沟侯；后来担任少府，爵位世代相传。光武帝派侍御史河内人杜诗安抚洛阳。将军萧广纵容士兵横行暴虐，杜诗警告劝谕仍不改正，于是将萧广处死。杜诗回朝后，将情况奏报。光武帝召见了他，赐给他棨戟（一种仪仗），于是提升重用他。
冬季，十月，癸丑（十八日）， 光武帝进入洛阳，临幸南宫，于是定都洛阳。
赤眉军发布文书说：“圣公（刘玄）投降的，封为长沙王；超过二十天，就不再接受投降。”更始帝派刘恭请求投降，赤眉军派将领谢禄前往受降。更始帝跟随谢禄，袒露上身，向刘盆子献上皇帝玺绶。赤眉军让更始帝坐下，安置在庭院中，准备杀掉他；刘恭、谢禄替他求情，未能获准，于是将更始帝拉了出去。刘恭追着喊道：“我已经竭尽全力了，请让我先死！”拔剑就要自刎。樊崇等人急忙一起救下他。于是赦免了更始帝，封为畏威侯。刘恭又坚决请求，更始帝最终得以被封为长沙王。更始帝常依靠谢禄居住，刘恭也保护他。
刘盆子住在长乐宫，三辅地区的郡县、营寨首领派使者前来进贡，赤眉军士兵总是中途抢夺，还多次残暴地掠夺官吏百姓，因此各地又重新坚守堡垒。百姓不知该归附谁，听说邓禹的军队乘胜独能攻克地方且军纪严明，都望风携家带口迎接邓禹的军队，投降的人每天数以千计，部众号称百万。邓禹每到一处，总是停车竖起符节来慰劳归附的百姓，父老、儿童，垂发少年、白发老人挤满在他的车下，无不感动喜悦，于是邓禹名震关西。各位将领和豪杰都劝邓禹直接攻打长安，邓禹说：“不能这样。现在我们人数虽多，但能打仗的士兵少，前方没有可依靠的粮草储备，后方没有转运供给的粮道；赤眉军刚刚攻占长安，财物粮食充足，锋芒锐不可当。盗贼群居，没有长远的打算，财物粮食虽然多，但变故万端，岂能坚守呢！上郡、北地、安定三郡，地广人稀，粮食丰饶，牲畜众多，我们暂且让军队在北道休整，就地取粮养兵，以观察赤眉军的弊端，然后才能设法对付。”于是率军北上到达栒邑县，所到之处，各营堡郡县都打开城门归附。
光武帝派遣岑彭攻打荆州地区的各路贼寇，攻下犨县、叶县等十余城。十一月，甲午（疑误，或为十一月某日）， 光武帝到达怀县。
梁王刘永在睢阳称帝。
十二月，丙戌（二十二日）， 光武帝返回洛阳。
三辅地区的百姓苦于赤眉军的暴虐，都同情更始帝，想偷偷救他出来；张卬等人深感忧虑，派谢禄将更始帝勒死。刘恭连夜前往，收殓埋葬了他的尸体。光武帝下诏命邓禹将更始帝安葬在霸陵。中郎将宛城人赵熹将要出武关，在路上遇到更始帝的亲属，全都赤身露足，饥饿困顿，赵熹竭尽自己的财物粮食接济他们，护送他们前行。宛王刘赐听说后，将他们迎回故乡。
隗嚣回到天水，又重新聚集部众，恢复旧业，自称西州上将军。三辅地区的士大夫为避乱大多归附隗嚣，隗嚣倾心结交，像平民一样与他们交往；任命平陵人范逡为师友，前凉州刺史河南人郑兴为祭酒（学官之长），茂陵人申屠刚、杜林为治书（文书官），马援为绥德将军，杨广、王遵、周宗以及平襄人行巡、阿阳人王捷、长陵人王元为大将军，安陵人班彪等人为宾客，由此名震西州（陇右地区），威名传到崤山以东。马援年轻时，因家庭用度不足辞别哥哥马况，想到边郡去垦田放牧。马况说：“你有大才，应当晚成。好工匠不把未雕琢的玉石给人看（意谓大器晚成），暂且按你的喜好去做吧。”于是马援到北地郡垦田放牧。他常对宾客说：“大丈夫立志，处境越穷困，意志应当越坚定；年纪虽老，志气应当越壮。”后来拥有数千头牲畜，数万斛粮食，不久又叹息道：“凡是经营财产，贵在能赈济施舍，否则就是守财奴罢了！”于是把全部家产分给了亲朋故旧。听说隗嚣礼贤下士，就去投奔他。隗嚣非常敬重马援，与他一起筹划决策。班彪，是班穉的儿子。
当初，平陵人窦融世代在河西地区做官，了解当地的风土人情，他与更始帝的右大司马赵萌关系很好，私下对兄弟们说：“天下安危尚未可知。河西地区富庶，以黄河为屏障，张掖属国（汉朝安置归附少数民族的地区）有精兵万骑，一旦形势危急，封锁黄河渡口，足以自守，这是保留家族血脉的好地方！”于是通过赵萌请求前往河西。赵萌向更始帝推荐窦融，任命他为张掖属国都尉。窦融到任后，安抚结交豪杰，怀柔招纳羌人、胡人，很得他们的欢心。这时，酒泉太守安定人梁统、金城太守库钧、张掖都尉茂陵人史苞、酒泉都尉竺曾、敦煌都尉辛肜，都是州郡的人才，窦融都与他们交好。等到更始政权失败，窦融与梁统等商议说：“如今天下大乱，不知该归附谁。河西地区孤立地处在羌人、胡人中间，如果不同心协力，就不能自守；我们权力均等，力量相齐，又无法统率，应当推举一人为大将军，共同保全河西五郡，观察时局变化。”商议既定，但各自谦让。按地位次序，共同推举梁统；梁统坚决推辞，于是推举窦融代理河西五郡大将军职务。武威太守马期、张掖太守任仲都是孤立没有党援的，窦融等人就共同写信通知他们，二人立即交出印绶离职。于是任命梁统为武威太守，史苞为张掖太守，竺曾为酒泉太守，辛肜为敦煌太守。窦融仍居住在张掖属国，兼任都尉职务照旧；设置从事，监察五郡。河西地区民俗质朴，而窦融等人的施政也宽厚平和，上下相亲，一片安定富庶的景象。他们修整兵马，练习作战射箭，设置烽火台，羌人、胡人侵犯边塞，窦融总是亲自率领各郡军队救援，每次都能如期而至，屡次击败敌人。后来羌人、胡人都敬畏归附，内地躲避战乱和饥荒的流民前来归附的络绎不绝。
王莽当政时，天下人都思念汉朝的恩德，安定郡三水县人卢芳居住在左谷中，诈称自己是汉武帝的曾孙刘文伯，说：“我的曾祖母，是匈奴浑邪王的姐姐。”常用这话在安定一带欺骗迷惑人们。王莽末年，卢芳与三水属国的羌人、胡人一同起兵。更始帝到长安后，征召卢芳担任骑都尉，让他镇守安抚安定以西地区。更始政权失败后，三水的豪杰共同拥立卢芳为上将军、西平王，派使者与西羌、匈奴结亲和好。匈奴单于认为：“汉朝中途断绝，刘氏后裔来归附，我也应当像当年呼韩邪单于（归附汉朝）那样拥立他，让他尊奉我。”于是派句林王率领数千骑兵迎接卢芳兄弟进入匈奴，拥立卢芳为汉帝，任命卢芳的弟弟卢程为中郎将，率领匈奴骑兵回到安定郡。
光武帝因为关中尚未平定，而邓禹久不发兵进攻长安，写信责备他说：“司徒（邓禹），是尧；逃亡的贼寇（赤眉），是桀。长安的官吏百姓惶惶不安无处可归，应该及时进兵讨伐，镇守安抚西京（长安），维系百姓的心。”邓禹仍然坚持之前的意见，另外攻打上郡各县，再征集兵员，转运粮食，回到大要县。积弩将军冯愔、车骑将军宗歆共同守卫栒邑县，二人争权互相攻打，冯愔于是杀了宗歆，并乘机回军袭击邓禹，邓禹派使者向朝廷报告。光武帝问使者：“冯愔所亲近的人是谁？”使者回答：“是护军黄防。”光武帝估计冯愔、黄防两人不能长久和睦，势必互相冲突，于是回复邓禹说：“将来逮捕冯愔的，必定是黄防。”于是派尚书宗广持符节前往招降。一个多月后，黄防果然抓住冯愔，率领部众归降请罪。更始帝的将领王匡、胡殷、成丹等也都到宗广处投降，宗广和他们一起东归洛阳；走到安邑县，王匡等人半路又想逃跑，宗广将他们全部处斩。冯愔叛变时，曾率军西向天水；隗嚣迎击，在高平县将其打败，缴获了他的全部辎重。于是邓禹以皇帝的名义派遣使者持符节任命隗嚣为西州大将军，能够全权处理凉州、朔方的事务。
腊日（腊祭日），赤眉军举行盛大宴会奏乐，酒还未喝，群臣就互相争吵起来；士兵们竟各自翻墙进入皇宫，劈开宫门，抢夺酒肉，互相杀伤。卫尉诸葛穉听说后，率军入宫，格杀一百多人，才安定下来。刘盆子惶恐不安，日夜哭泣，左右侍从官都很怜惜他。
光武帝派遣宗正刘延攻打天井关，与田邑连战十余回合，刘延无法前进。等到更始政权灭亡，田邑派使者请求投降；光武帝当即任命他为上党太守。光武帝又派谏议大夫储大伯持符节征召鲍永；鲍永不知更始帝是死是活，心存疑虑不肯听从，囚禁了储大伯，派使者骑马飞奔到长安，探听虚实。
当初，光武帝跟随更始帝在宛城时，娶了新野县阴氏的女儿阴丽华。这一年，派使者迎接阴丽华和光武帝的姐姐湖阳公主、妹妹宁平公主一同到洛阳；封阴丽华为贵人。更始帝的西平王李通先前娶了宁平公主，光武帝征召李通担任卫尉。
当初，更始帝任命王闳为琅邪太守，张步占据琅邪郡抗拒他。王闳劝降了赣榆等六个县，聚集兵力与张步交战，未能取胜。张步接受了刘永的官号后，在剧县训练军队，派将领攻掠泰山、东莱、城阳、胶东、北海、济南、齐郡，全部攻下。王闳力量不敌，便到剧县会见张步。张步陈列大军接见他，发怒道：“我有什么罪，你先前攻打我那么厉害！”王闳手按宝剑说：“我奉朝廷命令，而你却拥兵抗拒。我攻打的是贼寇，有什么厉害可言！”张步起身跪拜道歉，设宴款待，待为上宾，让王闳掌管琅邪郡事务。
世祖光武皇帝上之上 建武二年（丙戌，公元26年）
春季，正月，甲子朔（初一）， 发生日食。
刘恭知道赤眉政权必定失败，秘密教弟弟刘盆子交还皇帝玺绶，练习说辞让的话。等到正月初一大会群臣时，刘恭首先说：“各位共同拥立我的弟弟为帝，恩德确实深厚！即位将近一年，天下混乱日益严重，实在不足以成就大事，恐怕死了也无益于事，希望能让他退位做一个平民，再另求贤德智慧的人，请各位仔细考虑！”樊崇等道歉说：“这都是我们的过失。”刘恭再次坚决请求，有人说：“这难道是式侯（刘恭）你的事吗？”刘恭惶恐起身离去。刘盆子于是下床解下玺绶，叩头说：“如今设置了天子却仍然像贼寇一样行事，四方怨恨，不再信任归向，这都是因为拥立了不适当的人所致。希望让我保全性命，给贤圣让路！如果一定要杀我来推卸责任，我也无法逃避一死！”于是痛哭流涕。樊崇等及参加大会的数百人，无不哀怜他，于是都离开座位叩头说：“臣等无状，辜负了陛下，从今以后，不敢再放纵了！”于是一同抱起刘盆子，给他佩上玺绶；刘盆子哭喊，不得已。散会出宫后，将领们各自紧闭营门自守。三辅地区一致称颂天子聪明，百姓争相返回长安，街市里巷又拥挤起来。但二十多天后，赤眉军将士又跑出营门，照旧大肆抢掠。
刁子都被他的部曲杀害，余党与各路贼寇在檀乡会合，号称檀乡贼，侵扰魏郡、清河郡。魏郡大吏李熊的弟弟李陆图谋反叛，迎接檀乡贼入城，有人将此事报告了魏郡太守颍川人铫期。铫期召见李熊质问，李熊叩头认罪，表示愿和老母亲一同赴死。铫期说：“如果当官还不如当贼快乐，你可以和老母亲一起去投奔李陆！”派官吏送他出城。李熊出城，找到李陆，准备带他到邺城西门；李陆不胜惭愧感激，自杀以向铫期谢罪。铫期叹息，按礼仪安葬了他，恢复了李熊的官职。于是魏郡的人都敬服铫期的威信。光武帝派吴汉率领王梁等九位将军在邺城东的漳水河畔进击檀乡贼，大败贼军，十余万人全部投降。又派王梁和大将军杜茂率军安抚魏郡、清河郡、东郡，扫平各处营堡，三郡变得清平安静，边境道路畅通无阻。
庚辰（十七日）， 光武帝封所有功臣为列侯；梁侯邓禹、广平侯吴汉都享有四个县的食邑。博士丁恭提出异议说：“古时分封诸侯不过百里之地，强干弱枝，这是治国之道。现在分封四个县，不符合古代制度。”光武帝说：“古时候亡国都是因为无道，未曾听说因功臣封地多而灭亡的。”阴乡侯阴识，是贵人阴丽华的哥哥，因军功应当增加封邑，阴识叩头辞让说：“天下刚刚平定，将帅中有功劳的人很多，我作为后宫的亲属，仍然增加爵位食邑，无法昭示天下。这样做是为了外戚受赏，而让将士们计较功劳。”光武帝听从了他的意见。光武帝让将领们各自说出所向往的封地，众人都指出富庶的县份；只有河南太守颍川人丁綝请求封在自己的故乡。有人问他原因，丁綝说：“我能力微薄，功劳又小，能封为乡亭侯就很优厚了！”光武帝满足了他的愿望，封他为新安乡侯。光武帝命郎中魏郡人冯勤主持分封诸侯事宜。冯勤衡量功劳大小轻重，国土远近，土地肥沃贫瘠，使受封者等级有序，没有人不满意不服气。光武帝认为他有才能，尚书省的事务都让他总揽。按旧例：尚书郎由尚书令史按年资递补，光武帝开始用孝廉担任尚书郎。
在洛阳建立高帝（刘邦）祭庙，四季合祭汉高祖、太宗（文帝）、世宗（武帝）；在宗庙右边建立社稷坛；在城南设立郊祀天地的场所。
长安城中粮食耗尽，赤眉军收拾装载金银财宝，纵火焚烧宫室、街市里巷，肆意烧杀抢掠，长安城中再也没有行人；于是率军西行，号称百万大军，从南山起辗转掠夺城邑，进入安定、北地二郡。邓禹率军向南到达长安，驻军昆明池，拜谒祭祀高帝祭庙，收集西汉十一位皇帝的神主牌位，送往洛阳；并巡视西汉诸帝陵园，设置官兵守护。
真定王刘杨制造谶语说：“赤九之后，瘿杨为主。”（赤帝九世之后，有瘿瘤的人为主）。刘杨脖子上有瘿瘤，想以此迷惑民众；并与绵曼县的盗贼勾结。光武帝派遣骑都尉陈副、游击将军邓隆征召他，刘杨紧闭城门不让他们进城。光武帝又派前将军耿纯持符节巡视幽州、冀州，沿途慰劳王侯，并密令他逮捕刘杨。耿纯到达真定，住在驿站，邀请刘杨见面。耿纯的母亲是真定宗室之女，所以刘杨对他不疑心，而且仗着自己人多势众，而耿纯神态安详，便带着随从官员前去见耿纯；刘杨的兄弟则带着轻装士兵在门外等候。刘杨进门，见到耿纯，耿纯以礼相待，乘机邀请他的兄弟们都进来，然后关闭房门，将他们全部诛杀，随即率兵而出。真定全城震惊恐怖，无人敢轻举妄动。光武帝怜悯刘杨的阴谋尚未发动就被诛杀，又封他的儿子为真定王。
二月，己酉（十六日）， 光武帝到达修武县。
鲍永、冯衍确知更始帝已死，才发布丧讯，放出储大伯等人，封存好印绶，遣散全部军队，用布巾包头（平民装束）到河内郡投降。光武帝召见鲍永，问：“你的部队在哪里？”鲍永离开座位叩头说：“我效忠更始帝，却不能保全他，实在惭愧，所以不敢率部众来求取富贵，已经全部遣散了。”光武帝说：“你的话很大气。”但心里不高兴。不久鲍永因立了战功被任用，冯衍却被废弃不用。鲍永对冯衍说：“从前汉高祖赦免季布的罪过，诛杀丁固（背叛项羽投靠刘邦，后因教唆彭越谋反被杀）的功劳；如今遇到圣明的君主，还有什么可忧虑的呢！”冯衍说：“有个人挑逗邻居的妻子，年长的唾骂他，年轻的回应他。后来她们的丈夫死了，这个人娶了那个年长的。有人问他：‘那不是唾骂你的人吗？’他说：‘在别人身上我希望她回应我，在自己身上我希望她唾骂别人！’天命难以预料，做人的道理却容易遵守。坚守道义的臣子，还怕死亡吗！”
大司空王梁多次违背皇帝的诏命，光武帝大怒，派遣尚书宗广持符节到军中就地处斩王梁；宗广用囚车将王梁押送京城。到达洛阳后，光武帝赦免了他，任命他为中郎将，到北方的箕关驻守。
壬子（十九日）， 任命太中大夫京兆人宋弘为大司空。宋弘推荐沛国人桓谭担任议郎、给事中。光武帝命桓谭弹琴，喜爱他弹奏的复杂音调。宋弘听说后，不高兴；等桓谭从宫中出来时，宋弘身穿朝服坐在府上，派官吏召桓谭来。桓谭到了，宋弘不给他座位就责备他，并且说：“是自己改正，还是要我依法检举你呢？”桓谭叩头认错；过了很久，宋弘才让他离开。后来光武帝大会群臣，让桓谭弹琴。桓谭看见宋弘，失去常态。光武帝感到奇怪，问宋弘原因，宋弘于是离开座位脱帽谢罪说：“我推荐桓谭，是希望他能用忠诚正直引导君主。而他却让朝廷沉溺于靡靡之音（郑声），这是我的罪过。”光武帝脸色一变，向他道歉。湖阳公主新近守寡，光武帝和她一起谈论朝臣，暗中观察她的心意。公主说：“宋弘的威仪容貌、道德器量，群臣无人能及。”光武帝说：“我正考虑这事。”后来宋弘被召见，光武帝事先让公主坐在屏风后面，对宋弘说：“谚语说‘地位显贵了就换朋友，财富多了就换妻子’，这是人之常情吗？”宋弘说：“我听说贫贱时结交的朋友不可忘记，共患难的妻子不可抛弃（‘贫贱之知不可忘，糟糠之妻不下堂’）。”光武帝回头对公主说：“事情不成了！”
光武帝讨伐王郎时，彭宠派遣精锐骑兵帮助作战，转运粮食，前后不断。等到光武帝追击铜马军到蓟城时，彭宠自恃功劳，期望很高；光武帝对他的接待未能满足他的期望，因此心怀不满。等到即位后，吴汉、王梁，都是彭宠派遣去的将领，一同位列三公，而唯独彭宠没有加官，他更加怏怏不乐，叹息道：“像这样，我应当被封王。只是陛下把我忘了吗！”当时北方州郡破败残破，而渔阳郡还算完整，有旧时设置的铁官，彭宠用铁器交易谷物，积蓄珍宝，日益富强。幽州牧朱浮，年轻有才华，想整顿风气教化，收揽士人之心，征召州中有名望的宿儒以及王莽时俸禄二千石的旧官吏，都安置在幕府中，并调拨各郡大量粮食赡养他们的妻子儿女。彭宠认为天下尚未平定，战争刚刚开始，不应过多设置官员消耗军需物资，不服从朱浮的命令。朱浮性情骄矜急躁，自以为是，彭宠也倔强好胜，两人的嫌隙怨恨日益加深。朱浮多次在光武帝面前谗毁彭宠，密奏彭宠大量聚集军队粮食，意图难以预测。光武帝却故意泄露消息让彭宠知道，以此胁迫震慑他。到这时，光武帝下诏征召彭宠，彭宠上书，请求与朱浮一同被征召；光武帝不准。彭宠更加自疑。他的妻子一向刚强，不能忍受这种压抑屈辱，坚决劝他不要接受征召，说：“天下尚未平定，四方各自称雄。渔阳是个大郡，兵马最为精锐，为什么要因别人的谗言诬告，就放弃这里离开呢！”彭宠又和自己亲信的官员商议，大家都怨恨朱浮，没有一个劝他去洛阳的。光武帝派彭宠的堂弟子后兰卿去劝说他。彭宠趁机扣留了子后兰卿，于是发兵反叛，任命将帅，自己率领二万多人，到蓟城攻打朱浮。又因为自己和耿况都有大功而恩赏同样微薄，多次派人邀请引诱耿况。耿况不接受，斩杀了他的使者。
延岑再次反叛，包围南郑。汉中王刘嘉兵败逃走。延岑于是占据汉中，进军武都郡；被更始帝的柱功侯李宝击败，延岑逃往天水郡。公孙述派将领侯丹攻取南郑。刘嘉收罗散兵数万人，任命李宝为相，从武都郡南下攻打侯丹，失利，率军返回河池县、下辨县，又与延岑接连交战。延岑向北败走，进入散关，到达陈仓；刘嘉追击，打败了他。公孙述又派将军任满从阆中南下攻取江州，向东占据扞关，于是全部占有益州之地。
辛卯（疑误，或为三月某日）， 光武帝返回洛阳。
三月，乙未（初二）， 大赦天下。
更始帝在南方尚未投降的将领还有很多。光武帝召集将领们商议军事，用文书拍地说：“郾城兵力最强，宛城次之，谁去攻打他们？”贾复不假思索地回答说：“我请求攻打郾城。”光武帝笑着说：“执金吾（贾复）去攻打郾城，我还有什么可忧虑的！大司马（吴汉）应当去攻打宛城。”于是派遣贾复攻打郾城，攻克了它；守将尹尊投降。贾复又向东攻打更始帝的淮阳太守暴汜，暴汜投降。
夏季，四月， 虎牙大将军盖延督率驸马都尉马武等四位将军攻打刘永，将其击败；于是将刘永包围在睢阳城中。原更始将领苏茂反叛，杀死淮阳太守潘蹇，占据广乐城并向刘永称臣；刘永任命苏茂为大司马、淮阳王。
吴汉攻打宛城，宛王刘赐带着更始帝的妻子儿女到洛阳投降；光武帝封刘赐为慎侯。光武帝的叔父刘良、族父刘歙、族兄刘祉都从长安来到洛阳。甲午（疑误，或为四月某日）， 封刘良为广阳王，刘祉为城阳王；又封哥哥刘演的儿子刘章为太原王，刘兴为鲁王；更始帝的三个儿子刘求、刘歆、刘鲤都封为列侯。
邓王王常投降，光武帝见到他非常高兴，说：“我见到王廷尉（王常曾任更始廷尉），就不担忧南方了！”任命他为左曹（官名），封山桑侯。
五月，庚辰（十九日）， 封族父刘歙为泗水王。
光武帝因为贵人阴丽华性情温柔宽厚，想立她为皇后。阴贵人因为郭贵人（郭圣通）生有儿子，始终不肯答应。六月，戊戌（初七）， 光武帝立贵人郭氏为皇后，立她生的儿子刘强为皇太子；大赦天下。
丙午（十五日）， 封泗水王刘歙的儿子刘终为淄川王。
秋季， 贾复南下攻打召陵县、新息县，平定了两地。贾复的部将在颍川杀人，颍川太守寇恂将其逮捕，关进监狱。当时国家初创，军营中人犯法，大多互相包容，寇恂却将这个部将在街市上处死。贾复认为这是耻辱，班师经过颍川时，对左右说：“我和寇恂同为将帅，却被他陷害，今天我见到寇恂，一定要亲手用剑杀了他！”寇恂得知他的计划，不想和他见面。寇恂姐姐的儿子谷崇说：“我是将领，可以带剑侍立在您身旁。万一有变故，足可以抵挡。”寇恂说：“不能这样。从前蔺相如不怕秦王却屈服于廉颇，是为了国家啊。”于是命令所属各县准备丰盛的食物，储备美酒，执金吾（贾复）的军队进入颍川境内，每人都得到两个人的酒食。寇恂出城在道上迎接，然后自称有病返回。贾复想率兵追赶，但将士们都喝醉了，只好过去。寇恂派谷崇将情况报告光武帝，光武帝于是征召寇恂。寇恂到达洛阳，被引见；当时贾复已在座，想起身回避。光武帝说：“天下尚未平定，两虎怎能私下相斗！今天我替你们调解。”于是两人坐在一起极尽欢乐，然后同乘一辆车出宫，结成好友才离开。
八月， 光武帝亲自率领众将征讨五校农民军。丙辰（二十七日）， 到达内黄县，在b111阳（疑为地名）大败五校军，收降其部众五万人。
光武帝派遣游击将军邓隆协助朱浮讨伐彭宠。邓隆驻军潞县南，朱浮驻军雍奴县，派官吏向朝廷奏报军情。光武帝看到文书后大怒，对那个官吏说：“两营相隔百里，这种形势怎么能相互救援！等你回去，北面的军队（邓隆军）必定已经败了。”彭宠果然派遣轻装部队袭击邓隆军，大败邓隆军；朱浮距离太远，无法救援。
盖延包围睢阳几个月后，攻克了它。刘永逃到虞县，虞县人反叛，杀了他的母亲、妻子；刘永与部下数十人逃奔谯县。苏茂、佼强、周建集结三万余人救援刘永；盖延与他们在沛县西交战，大败敌军。刘永、佼强、周建逃到湖陵据守，苏茂逃回广乐；盖延于是平定了沛、楚、临淮三郡。
光武帝派太中大夫伏隆持符节出使青州、徐州二州，招降各郡国。青州、徐州的各路盗贼听说刘永被打败，都惶恐不安，请求投降。张步派他的属官孙昱跟随伏隆到朝廷上书，进献鳆鱼（鲍鱼）。伏隆，是伏湛的儿子。
堵乡人董在宛城反叛，捉住南阳太守刘粦。扬化将军坚镡进攻宛城，攻克了它；董逃回堵乡。
吴汉巡行南阳各县，所过之处多有侵扰暴行。破虏将军邓奉请假回新野县探亲，对吴汉掠夺他的家乡十分愤怒，于是反叛，击败吴汉的军队，占据淯阳县，与各路贼寇联合。
九月，壬戌（初四）， 光武帝从内黄县返回洛阳。
陕县贼寇苏况攻破弘农郡，光武帝派景丹前去征讨。适逢景丹去世，改派征虏将军祭遵攻打弘农、柏华、蛮中等地贼寇，全部平定。
赤眉军打算西上陇地，隗嚣派将军杨广迎击，打败赤眉军；又追击到乌氏县、泾阳县之间，再次击败赤眉军。赤眉军到达阳城、番须地区时，遭遇大雪，山谷都被雪填满，士兵很多被冻死。于是又折返回来，挖掘西汉各皇帝的陵墓，盗取其中的珍宝。凡是用金缕玉衣装殓的，尸体大都还栩栩如生，贼兵于是侮辱了吕后的尸体。邓禹派兵在郁夷县攻打赤眉军，反而被打败。邓禹于是撤出长安到达云阳县。赤眉军又进入长安。延岑驻扎在杜陵县，赤眉军将领逢安进攻他。邓禹趁逢安的精兵在外，率军袭击长安；恰逢谢禄的援军赶到，邓禹军战败逃走。延岑攻击逢安，大败逢安军，杀死十多万人。廖湛率领十八万赤眉军进攻汉中王刘嘉；刘嘉在谷口县与廖湛交战，大败赤眉军，刘嘉亲手杀死廖湛，于是到云阳县筹集粮食。刘嘉妻子的哥哥新野人来歙，是光武帝姑母的儿子。光武帝命邓禹招降刘嘉，刘嘉通过来歙到邓禹营中投降。李宝态度傲慢，邓禹将他斩杀。
冬季，十一月， 任命廷尉岑彭为征南大将军。光武帝在大会群臣时指着王常对大家说：“这个人率领下江诸将辅佐汉室，心志如金石般坚定，真是忠臣啊！”当天，任命王常为汉忠将军，派他和岑彭率领建义大将军朱祜等七位将军讨伐邓奉、董。岑彭等先攻打堵乡，邓奉率军救援。朱祜战败，被邓奉俘虏。
铜马、青犊、尤来等部的残部共同拥立孙登为天子。孙登的将领乐玄杀死孙登，率领部众五万余人投降。
邓禹自从冯愔叛变后，威名有所损害，又缺乏粮食，多次作战失利，归附他的人日益离散。赤眉军、延岑军在三辅地区暴乱，各郡县的世家大族各自拥兵自守，邓禹不能平定。光武帝于是派偏将军冯异代替邓禹讨伐他们，亲自送冯异到黄河南岸，告诫冯异说：“三辅地区遭受王莽、更始之乱，又加上赤眉、延岑的暴虐，百姓生灵涂炭，无处依靠倾诉。将军现在奉命讨伐叛逆，凡营堡投降的，将其首领送到京城洛阳；遣散小民，让他们回家耕田种桑；摧毁营垒，使他们不能再聚集起来。征伐不一定非要夺取土地、屠杀城池，关键在于平定叛乱、安抚百姓而已。将领们并非不善于战斗，但喜好掳掠。你本来就善于驾驭官吏将士，要常常告诫自己，不要给郡县百姓造成痛苦！”冯异叩头接受命令，率军西进，所到之处传播威望信誉，很多盗贼投降。
臣司马光评论说：从前周朝人歌颂周武王的恩德说：“铺时绎思，我徂惟求定。”（意谓宣扬文王之德，我前往伐纣只为求得安定）。是说王者的军队，其志向在于传播威望恩德安抚百姓而已。看光武帝之所以能夺取关中，用的就是这个原则。这难道不美好吗！
光武帝又下诏征召邓禹回洛阳，说：“千万不要同穷途末路的敌人争一时之高低！赤眉军没有粮食，自然会向东而来。我军以饱食等待饥饿，以安逸等待疲劳，折断马鞭就能抽打他们（形容轻易取胜），这不是各位将领忧虑的事。不得再轻率进军！”
光武帝任命伏隆为光禄大夫，再次出使张步那里，任命张步为东莱太守，并和新任命的青州牧、太守、都尉一同东行。诏令伏隆可以自行任命县令、县长以下的官吏。
十二月，戊午（初一）， 光武帝下诏，凡是被王莽废除的刘氏宗室列侯，都恢复原来的封国。
三辅地区发生严重饥荒，出现人吃人的现象，城郭空无一人，白骨覆盖田野，幸存下来的百姓往往聚集成营寨堡垒，各自坚壁清野。赤眉军掳掠不到东西，于是率军东归，部众还有二十多万，沿途又不断逃散。光武帝派遣破奸将军侯进等驻守新安县，建威大将军耿弇等驻守宜阳县，以拦截赤眉军的归路，命令将领们说：“贼寇如果向东逃跑，可率宜阳部队与新安部队会合；贼寇如果向南逃跑，可率新安部队与宜阳部队会合。”冯异在华阴县与赤眉军相遇，相持六十多天，交战数十次，收降赤眉军将领士兵五千多人。