话说大衍王朝东南有云梦故郡，郡西三百里耸立苍梧山。此山终年云气缭绕，时有鸾鹤清唳，樵夫偶见崖壁间芝草丛生、金光隐现，然攀援至顶辄迷途，乡人皆言山中有仙家禁制。山下清河畔有寒门子弟姓柳名元，字子澄，幼失怙恃，独居茅屋三椽，以采药伐薪为生。其人年方弱冠，眉目疏朗，每于月夜抱膝望峰，心向往之。
是岁仲春，柳元入深山采百年黄精。忽遇黑风摧木，暴雨如倾，慌不择路间跌入幽壑。醒时但见星斗垂野，身卧青石，四周古木参天，竟不识归途。正彷徨间，忽见东北角紫气氤氲，循之而行，得入一洞。初极狭，复行百步，豁然开朗：瑶草奇花灼灼生辉，玉泉叮咚泻于石罅，中有白玉平台，上卧一具仙骸，青衣如新，掌中托赤玉宝匣。
柳元整衣叩拜曰：“小子误入仙府，惊扰清修，伏乞恕罪。”言毕，忽见仙骸化作流萤万点，空中留书云：“吾乃玉虚宫弃徒玄玑子，昔年盗取《太霄紫府真经》叛出师门，遭九天雷劫重伤于此。今兵解在即，留道统待有缘。匣中真经须以心血祭之，然修行此功必遭玉虚宫追剿，福祸自择。”柳元思量片刻，再拜曰：“匹夫无罪，怀璧其罪。然仙缘难再，岂可畏祸而止？”遂咬指滴血于匣。
赤玉匣顿放毫光，化作流光没入眉心。霎时海量经文奔涌灵台：《太霄紫府真经》凡九重天，修紫府元婴，炼太霄神雷，至大成可掌生生造化。另有《九转炼器诀》《九遁符法》诸般秘术。柳元依经中导引法盘膝，感天地灵气如潮涌来，初时经脉如刀割，三个周天后渐入佳境，竟直达炼气三层。
忽闻洞外雷声大作，有厉喝震谷：“玄玑子逆徒！速交出真经！”柳元暗惊，依真经中“龟息匿形术”藏于石缝。但见两道剑光破空而至，青袍修士各持罗盘搜寻。年轻者皱眉：“师兄，气息至此而绝。”年长者冷笑：“必是那叛徒设下禁制，待我以‘破障神瞳’观之。”目运金光扫视，柳元只觉如烈火灼身，危急间默运新得真气，竟与洞中残留玄玑子气息共鸣。
年长者忽讶异：“怪哉，似有玄玑子兵解余韵。”二人细查良久，终驾剑光离去。柳元汗透重衫，方知仙路险恶。遂于洞中苦修三月，达炼气圆满，乃取洞中遗留寒铁，依炼器诀铸青钢剑一柄，采玉髓制简易符箓，方小心出洞。
归村时惊觉已过三载，邻人皆以为葬身兽腹。柳元隐去仙缘，仍以采药为生，暗里修炼不辍。某日售药至郡城，见城主府榜文：征修士探黑风洞除妖，赏灵石百颗。柳元心念微动，忽闻香风袭人，一翠裳女子执罗扇指点榜文：“这般微末道行也敢揭榜？”柳元观其气乃筑基修士，揖道：“在下虽浅薄，愿尽力为民除害。”女子掩口笑：“倒是个憨人，不如与我等组队？”
遂结识翠裳女修苏瑗，及其师兄赵凛——金阙宫外门弟子，筑基中期修为。三人入黑风洞，原是一窝狼妖作祟。赵凛祭金砖法器纵横披靡，苏瑗以幻术困妖，柳元暗中施展太霄雷法初阶“掌心雷”，竟瞬杀狼王。赵凛疑曰：“柳道友雷法刚正玄奥，似非散修手段？”柳元虚应乃祖传秘术。
当夜调息时，柳元忽感怀中毒针，苏瑗冷笑现身：“师兄疑你身怀异宝，交出雷法可留全尸！”原二人乃邪修假扮，专劫落单修士。柳元急运“星遁符”逃窜，重伤遁入迷雾崖。追兵将至，忽见崖底隐现古碑，以真元激之竟现秘境入口！
此乃千年药园，禁制残缺而灵药遍生。柳元采得紫阳参疗伤，服玉髓芝冲关，七日间突破筑基，更得园中心玉碑传承——上古体修秘法《八荒撼世诀》。出关时恰逢二邪修搜寻至此，柳元怒发雷法，辅以新得体术，苦战毙赵凛。苏瑗泣求饶命，道出乃受“毒龙上人”指派，此獠乃金丹邪修，专夺人根基炼丹。
柳元毁其修为离去，然已种祸根。此后五年隐姓埋名，化名游历各州。某日于南海坊市购得残破丹鼎，竟内蕴“离火真精”，依真经重炼为本命法宝“紫霄鼎”。又遇拍卖会争执：金丹散修胁迫少女售卖家传宝图。柳元暗以雷法惊走恶徒，救下少女白芷。
白芷乃前朝太史令之后，献祖传“天星秘境图”为报。此图关系化神遗宝，惹得各方觊觎。未几，“毒龙上人”率徒追至，原来苏瑗早种追踪秘术。恶战间柳元不敌金丹神威，正危急，忽有青衣女修御琴而来，一曲《碧海潮生》逼退群邪。
女修自号云梦阁主，感柳元身怀正宗雷法却非玉虚门人，邀往云梦泽小住。其间柳方知世间有“一宫三宗”四大正道领袖，玉虚宫居首。云梦阁主点拨：“太霄真经虽妙，然缺失炼神篇，道友神识不及同阶，易遭幻术所乘。”遂赠《冰心诀》补全缺陷。
柳元修行渐臻筑基圆满，忽心血来潮，卜得白芷有难。原毒龙上人掳之欲炼“人元丹”，柳元怒闯枯骨岛。一路破万魂幡、斩四魔使，终在丹室见毒龙上人正开炉炼丹。恶战间丹炉爆裂，柳元借机以紫霄鼎收护白芷，全力催动太霄神雷。天威煌煌，竟引动金丹雷劫提前降临！
原来《太霄真经》霸道无匹，早该结丹。此刻内外雷劫交攻，柳元九死一生。恰在道基将毁时，怀中所藏天星图忽放清辉，显化周天星斗大阵护住心脉。遂凝紫金丹丸，丹成一品，生先天神通“破妄金瞳”。毒龙上人反遭雷劫重创，被柳元以新悟“雷化剑丝”之术斩灭元神。
救回白芷后，柳元于海外潜修结丹境界。某日忽收云梦阁主飞剑传书：“玉虚宫查知真经下落，遣刑堂长老前来，速避！”柳元急遁，仍被三道剑光截住。为首白须老道冷喝：“孽障！交出玄玑子所盗真经！”柳元辩解乃机缘所得，老道拂尘化千丝缚来：“叛徒传承，格杀勿论！”
正力竭时，忽有天外仙音缥缈：“玉虚宫好大威风！”但见云辇降下，华盖下女仙雍容。老震惊拜：“瑶光元君！您怎...”女仙轻笑：“玄玑子本吾师弟，当年盗经实为助我疗伤。今既择明主，这段因果由我了结。”掷还玉简予老道：“此乃《太上丹诀》补偿，回去禀报掌教，此事已了。”
瑶光元君转视柳元：“小子福缘不浅，竟得师弟认可。然真经后续功法需玉虚秘境洗炼，汝可愿承玄玑子之名入我门下？”柳元思忖良久，拜曰：“愿持本心求大道。”元君颔首，赐令牌令其三年后往玉虚宫赴试。
此后柳元携白芷游历，偶入南荒古巫族圣地。适逢邪派攻打祭坛，柳元助守时得大巫祝青眼，许其参悟“祖巫祭碑”。竟得雷之祖巫残念传授《都天神雷御法》，与太霄真经互补，雷威倍增。白芷亦觉醒祖传星辰体，拜入天机宗。
三年期至，柳元赴玉虚宫。各路天才云集，考验重重：闯幻魔路、悟道碑林、斗法天台。柳元以都天神雷败尽强敌，更于碑林悟得《太霄真经》缺失的“炼神篇”，补全功法。终被瑶光元君收为亲传，敕封“神霄子”。
然风波未止。魔道魁首幽冥殿主觊觎都天神雷，联合妖皇设局困柳元于葬神渊。苦战间柳元意外触动上古仙阵，跌入时空裂隙，见洪荒景象：巨巫撑天，妖圣啸月，更有金乌坠地化汤谷。于时空乱流中得东皇太一残念传《太阳真火诀》，火雷相济修为暴涨。
及破界回归，已过十载。幽冥殿竟趁机攻破云梦阁，掳瑶光元君欲炼万魂幡。柳元怒率玉虚宫修士反攻，于堕龙原布都天神煞大阵。决战时妖皇亲临，柳元祭太阳真火化九日横空，又以太霄神雷衍化雷狱，终斩妖皇于剑下。幽冥殿主自爆元神，柳元护师重伤，却因祸得福融合火雷本源，元婴初成。
瑶光元君疗伤时道出秘辛：玄玑子当年盗经实为阻止玉虚宫主修炼“无情道”而灭世。现今宫主即将出关，恐生灵涂炭。柳元遂联合三宗，于玉虚峰布周天星辰大阵。宫主出关果已斩尽尘缘，欲化神州为无情界域。最终决战中，柳元借白芷星辰之力接引洪荒星辉，融合太霄神雷、太阳真火、都天神煞，终破无情道域。
然宫主临死反扑，引爆仙器。危急时刻，柳元怀中那枚玄玑子所遗赤玉匣突现，原是其师祖早埋后手，化护界仙阵保全苍生。经此一役，柳元悟得造化真谛，放弃飞升仙界，于苍梧山开宗立派，融汇百家道传，号“神霄仙宗”。终成一代道祖，留下万世传奇。
正是：凡胎偶入仙家洞，雷火双修大道成。荡魔诛邪平乱世，开宗立派号神霄。由来造化钟心处，不在天宫在人间。