按照朱由校的设想，皇明学院应仿照后世大学而建。他自己将亲自担任院长，往后每一位皇帝，都将是学院的真正负责人。
这并非挂名虚职，而是实打实的院长，需亲自过问学院事务，负起管理之责。
学院的设立必须分门别类，农业归农业，医学归医学，不掺杂旁类知识。
他目前最缺的，就是顶尖人才。
像宋应星这样横跨多门学科的全能型人物，是千万人中难觅一个。他根本不敢奢望，大明还会再出一个宋应星。
徐光启同样是人中龙凤，但他更偏向于军事领域，尤其在火器和大炮方面的造诣无人能及。他虽在其他方面也有涉猎，但并非主流。
学院将分为六个部分：文学、农学、医学、工学、商学和军学。
设立军学的目的是为了培养军中参谋，为参谋司输送大量通晓军事的文人。这些参谋不仅要懂得打仗，还要熟悉各地地形与气候。
“从皇明学院毕业的学生，依然可以参加科举。若家中贫困，可根据情况免除赋税，直到学业完成。”
但这还不够，朱由校接着说出了一句让众人心惊的话。
“如果不愿参加科举或者未能通过，只要通过朕和学院的考核，一样可以入仕为官。”
“尤其是那些学习工农的学子，朕知道他们大多不擅长文章，不管是科举还是常规考试，对他们来说都异常艰难。”
“所以朕给他们另开一扇门，他们无需担心毕业后找不到出路，只要真有本事，朕都会按他们的能力安排职务。”
“如果毕业后表现优异，或者做出重大贡献，朕同样可以赐予官职，甚至封妻荫子！”
皇帝话音落下，三位大臣目瞪口呆。
陛下这次，真是下了狠心。
若将这些政策昭告天下，他们简直不敢想象会引发多大的震动。
天下多少读书人寒窗苦读，不就是为了当官？尤其那些士绅家庭，毕生所求，就是能穿上官服、坐上公堂。
又有多少人被科举这道门槛拦在门外？
现在有了这样一条路，哪怕不走科举也能当官，这对天下读书人来说，无疑是一场狂风暴雨般的冲击。
一旦公布，东林书院拿什么比？
他们整天品评人物、议论朝政，说到底，不就是因为科举无望，想借名气谋个仕途？
朱由校就是要用这招，一锤打碎这些书院的根基，让它们从此一蹶不振。
“陛下，如果真这么做，朝廷压力会非常大。百官恐怕也会反对，尤其是东林书院的那些文人，说不定会借题发挥，煽动舆论。”
“阁老太谨慎了，陛下刚刚亲征得胜，声望正隆，他们不敢轻举妄动。”
王在晋看得清楚，如今的皇帝虽然年纪轻，但有军功加身，那些只会纸上谈兵的人，翻不起什么风浪。
皇上与神宗皇帝不同，绝不会容忍任何势力动摇根本。皇上行事步步为营，这些顾虑早就纳入了考量之中。
“大司马果然老练，一语道破关键！”
看到皇上神情从容，徐光启也稍稍安心。
“眼下最紧要的事，是确定六门学科的主管与讲师人选。文学方面朕已有想法，至于主管之位，三位师傅可有合适人选？”
三人一时语塞。
当世的大儒、声望卓着的老先生不是没有，但多数与皇上对头有些瓜葛，自然不能用。
元辅王象乾沉思片刻，忽然眼前一亮，双手一击，拱手说道：
“陛下，臣有一人选，最为合适！”
“谁？”
“保定府人士，孙奇逢。”
王象乾继续说道：
“此人自幼被誉为神童，在士林中威望极高。他为人正直，虽与东林党人有往来，但不过是泛泛之交。此人堪当此任！”
朱由校一听这名字，有些陌生。
心中不免怀疑，这样的人靠不靠谱？怎么以前没听说过？
“他是哪年中的进士？现在是什么官职？”
“陛下，他早年本有意科举，但七、八年间双亲相继离世，守孝耽误了考试。”
“如今守孝早已结束多年，他也年近四十，可他对功名并不上心，也不愿为官，一直在民间讲学。”
“到如今，仍是一介布衣。”
听来这人倒有些特别，不把功名利禄放在眼里，或许是真正有抱负之人。王象乾不会轻易举荐，能得他如此推崇，想必确有真才实学。
“那就由内阁拟旨，尽快召他进京，朕要亲自召见！”
王象乾应声：“遵旨！”
接着，朱由校又宣布了其余五科主管人选。
工学与农学由宋应星统管，眼下无人可用，只能他一肩挑两任。
军学由王在晋负责，医学则由太医李长文主管，他是李时珍的孙子，医术自然胜过常人。
商学最为棘手，目前缺乏合适人选，只能暂时搁置。皇上自身也非商道出身，将来还需从商界挑选能人。
最后，朱由校任命内阁次辅徐光启担任学院教育总管，负责统筹六科日常事务，调配资源，并监督各科基础建设与执行情况。
朱由校手下这帮主官阵容堪称顶尖，除了文学主官孙奇逢还没敲定，其他几位哪一个不是手握要职，地位显赫？
主官虽已落定，可真正头疼的是教学人选。
农学与工学尤其难搞，因为这些学科讲求实际操作与技术积累，不是靠读书就能掌握的。
换句话说，有手艺的不懂理论，懂理论的又缺乏实践经验。连王象乾都感到无奈，束手无策。