大古队员驾驶夏洛克车巡逻时，发现一个举止古怪、穿着礼帽燕尾服的男人——查理迦。
此人声称要“购买活的怪兽”，并径直找向圆谷制作公司，点名要见已故的特摄之神圆谷英二导演。
在被工作人员告知“想见英二导演得去1965年”后，查理迦竟在广场上打开神秘手提箱，操作一番后开启了一个时空漩涡并踏入其中消失不见。
大古将这一匪夷所思的事件汇报后，连同泽井总监在内的众人都感到困惑不已。
遵循命令，大古再次来到广场调查，却被时空漩涡吸入，穿越到了1965年。他误入圆谷制片厂，被忙碌的圆谷一导演误认为是迟到的助手“长野”，阴差阳错地参与了《奥特q》的拍摄。
期间，大古的GUtS队服引起了工作人员注意，其标志被认为“很适合作为对抗怪兽的组织标志”。大古在片场发现了查理迦的踪迹，追击途中，却与真正的助手长野撞个正着，两人面貌的相似令双方都惊愕不已。
与此同时，编剧金城哲夫正为剧本焦头烂额。深夜，圆谷英二导演向他展示了珍藏的奥特之星，并讲述了与来自m78星云的奥特曼相遇的往事，以及将怪兽亚那加基封印在龙森湖的秘辛。
这番话点燃了金城哲夫的灵感，也恰好被暗中窥探的查理迦听去。
查理迦立刻前往龙森湖，唤醒了亚那加基。这头“宇宙第一凶暴怪兽”开始大肆破坏。大古见状，毅然变身迪迦奥特曼迎战！然而，亚那加基极其强悍，竟一度吸收迪迦的能量，使迪迦陷入危机。
千钧一发之际，在片场默默关注战斗的圆谷英二导演，心中涌起强烈的信念，他握紧奥特之星，默默为迪迦加油。
这份源自人类对“英雄”最纯粹的信赖与渴望，化作了一道穿越时空的光芒！
奇迹发生，初代奥特曼的身影在光芒中降临！他将自己的部分能量赋予迪迦，两位光之巨人并肩作战，最终联手击败了亚那加基。查理迦见势不妙，仓皇逃离。
迪迦与奥特曼相互致意后飞向天际，夜空中，奥特之星的光芒愈发璀璨。
然而，苏小蕊其实早已暗中跟随查理迦穿越到了1965年。在奥特曼离开后，她堵住了正准备溜走的查理迦。
“宇宙怪兽商人查理迦先生，对吧？”苏小蕊把玩着手中不知何时顺来的查理迦的怪兽收纳胶囊，“谈谈？比如，你收集活体怪兽的真正目的？”
查理迦想反抗，却发现自己所有的超能力在苏小蕊面前都如同儿戏。想逃跑，周围的空间却被无形的力量封锁。
在苏小蕊的“友好”询问下，他不得不吐露实情：他游历各个时空，收集强大的怪兽，是为了在某个宇宙黑市上卖出高价，或组建自己的怪兽军团。
“想法很‘商业’。”苏小蕊笑了笑，眼神却让查理迦不寒而栗，“不过，你的商业模式对各个时空的生态平衡威胁太大了。这样吧，你的这些‘商品’，我没收了，作为你试图扰乱历史的代价。”
查理迦眼睁睁看着自己辛辛苦苦收集的怪兽被苏小蕊一个个没收走，心都在滴血，却敢怒不敢言，只能哀叹：“可恶！这下真是血本无归了！”
苏小蕊带着“战利品”，随手撕裂空间回到了现代tpc基地，留下查理迦在1965年的风中凌乱。
而在1965年，圆谷英二导演对金城哲夫说：“看吧，金城君，故事里不能缺少英雄。因为无论在任何时代，人们都需要光。” 不久后，一部名为《奥特曼》的电视剧正式开拍，编剧：金城哲夫，导演：圆谷一，监制：圆谷英二。一个传奇，就此开启。
大古也安全返回现代，他将这段奇妙的经历深藏心底。他终于明白，迪迦的光，不仅仅属于现在，更与过去的英雄传承一脉相承。
接连数日，大古被同一个噩梦纠缠：天空被无尽的黑暗吞噬，巨大的触手撕裂城市，文明的火光在绝望的哀嚎中逐一熄灭。这不再是单纯的梦境，而是光之基因对迫近终极黑暗的预警。噩梦，开始现实化。
太平洋深处，新西兰海域的海水剧烈翻涌，一座巨大的、布满古老铭文的遗迹——露露耶，破开万顷波涛，浮出水面。紧接着，一声刺破云霄的尖啸响起，一头形如巨鸟、面目狰狞的怪兽——佐加，从遗迹中冲天而起，直扑最近的城市！
佐加，超古代文明的毁灭者，邪神加坦杰厄的先锋。它以惊人的超高速飞行，所过之处，火球如雨，将现代化的都市瞬间化为火海。tpc派出的侦察机在其面前不堪一击，被轻易击落。
GUtS紧急出动，但即便是性能卓越的飞燕一号和二号，在佐加绝对的速度优势面前也显得笨拙，大古驾驶的战机更是在激战中被击落。胜利队首次遭遇如此惨败，被迫暂时撤退。
在基地，气氛凝重到极点。大古和丽娜奉命驾驶搭载了麦格斯动力系统的“白雪号”执行高风险追击任务。临行前，苏小蕊通过加密通讯，向大古揭示了那段被尘封了三千万年的真相：
“大古，迪迦的力量，并非凭空而来。他原本，是超古代时期的黑暗巨人领袖。在当时的地球警备队长幽怜的感召下，他选择了光明的道路，并封印了曾经的同伴，才成为了现在的光之巨人。
你的内心，既继承了光，也潜藏着对黑暗的记忆。正因如此，你才能如此深刻地感知到加坦杰厄的苏醒。不要恐惧你的过去，要坚信你此刻所选择的道路。”
这震撼的真相让大古心潮澎湃，但也更加坚定了他战斗的决心。
白雪号与佐加在平流层展开了惊心动魄的追逐。丽娜凭借高超的驾驶技术险险避开佐加的攻击，大古看准时机，发射超强尖峰弹命中目标，佐加受伤后企图逃向宇宙，大古毅然变身迪迦奥特曼，切换为空中型，与白雪号协同作战。
一场在云海之上的极速对决展开，迪迦以精准的手掌光箭击碎了佐加的右翼，使其哀嚎着坠落在蒙古草原。
重伤的佐加展现出惊人的凶性，它竟撕掉自己另一只残翅，以决死的姿态冲向迪迦！疯狂的近身搏斗中，佐加一度压制了迪迦，甚至让他的计时器开始闪烁。
危急关头，迪迦切换至强力型，以绝对的力量扭转战局，一记狂暴的回旋投摔将佐加重重砸在地上！
佐加做最后挣扎，连续发射火球，却被迪迦徒手抓住并反弹回去。最终，迪迦汇聚全身能量，迪拉修姆光流奔涌而出，将这只“烧尽大地的邪恶之翼”彻底湮灭。
战斗结束，精疲力尽的大古解除变身。丽娜从白雪号上冲下来，紧紧抱住了他。在生死边缘走了一遭后，所有的担忧、恐惧和长久以来积压的情感再也无法抑制。
“大古，不要再一个人承担所有了，我很害怕害怕失去你！”丽娜的泪水浸湿了大古的肩膀。
大古回抱着她，轻声而坚定地说：“对不起，丽娜，以后不会了。我们一起面对。”
这一刻，两人的心终于毫无保留地贴在了一起。
大古和丽娜驾驶着白雪号，奉命紧急返回tpc远东总部。
然而，当他们飞临日本上空时，眼前的景象让两人心脏骤停——天空不再是熟悉的蔚蓝，而是被一种浓稠、令人窒息的黑雾所笼罩。
阳光被彻底吞噬，大地提前陷入深夜，只有远处城市零星的人造灯火，如同狂涛中的孤舟，摇曳欲灭。
“大古，这个世界，到底怎么了？”丽娜的声音带着颤抖，紧紧握着操纵杆，“我们真的能赢吗？”
大古凝视着下方被黑暗侵蚀的家园，目光坚定如炬：“别说傻话，丽娜。这算什么命运？我们一定要改变它！只要我们还活着，只要心中还有光，就绝不放弃！”
丽娜从大古的眼神中汲取了力量，重重地点了点头，将白雪号的动力推至极限，冲向那被黑雾漩涡笼罩的tpc总部。