新伊甸城的重建工作彻底完成，城市上空悬浮着巨大的量子防护罩，宛如璀璨的穹顶。街道上，人们忙碌而有序地生活，欢声笑语取代了曾经的警报声。但陈临等人不敢有丝毫松懈，他们在城市深处建立了“守界者中枢”，时刻监测着各个时空的波动。
这天，林夏在实验室里突然发现异常。监测终端上，原本平静的时空图谱中，出现了密密麻麻的黑色斑点，如同霉菌般在各个平行时空交界处蔓延。“这些斑点的能量波动...和观测者残留的气息一模一样！”她立刻联系陈临和周岩。
陈临赶到时，黑色斑点已经开始扩散，在空气中形成肉眼可见的黑色纹路。他握紧断剑，剑身却没有像以往那样产生共鸣，反而微微震颤，仿佛在畏惧什么。初代守界人的声音突然在他脑海中响起：“这是观测者留下的‘量子烙印’，它们在等待合适的时机，重新编织命运之网。”
与此同时，在宇宙边缘的“暗潮空间站”，艾丽娅也遇到了麻烦。她的飞船上，所有电子设备开始不受控制地闪烁，屏幕上反复出现一行诡异的符号。当她试图破解这些符号时，一个半透明的人影从阴影中浮现——那是一个身着黑色长袍、面部模糊的神秘人，周身环绕着与黑色斑点相同的气息。
“星盗女王，你以为帮助守界者就能摆脱命运？”神秘人的声音冰冷而空洞，“那些星渊结晶的碎片，早已在你体内种下了因果之种。”话音未落，艾丽娅感觉体内有一股力量在涌动，她的机械义肢开始不受控制地变形，逐渐被黑色物质覆盖。
周岩在执行巡逻任务时，发现了一处诡异的时空裂隙。裂隙中传出熟悉的机械齿轮转动声，还有隐约的低语：“棋手？不过是自以为是的蝼蚁...”他小心翼翼地靠近，突然从裂隙中伸出无数荆棘状的能量触手，将他缠住。这些触手与曾经在时空裂隙中出现的能量组织如出一辙，且带着更强的腐蚀力。
陈临和林夏赶到时，周岩已经陷入昏迷，身上的战甲被腐蚀出大片破洞。林夏立刻将他接入医疗舱，却发现常规治疗手段根本无法阻止黑色物质的蔓延。“这和观测者的量子诅咒不同，更像是...”她调出数据对比，脸色变得苍白，“更像是某种全新的力量，正在改写他的生物分子结构。”
就在这时，守界者中枢的警报声大作。各个时空监测点传来消息：不同平行时空里，陆续出现了与神秘人相似的存在。它们有的化作城市中的普通居民，暗中散播黑色能量；有的直接出现在时空裂隙中，试图扩大裂隙范围。而在这些异常事件发生的地方，都出现了刻有诡异符号的黑色石碑，石碑上的纹路与艾丽娅飞船上的符号完全一致。
陈临意识到，这一次的危机比想象中更加棘手。观测者残留的力量似乎与某种未知存在结合，创造出了全新的威胁。他召集守界者中枢的所有成员，展开紧急会议。“我们需要弄清楚这些黑色石碑的来历，还有那个神秘人的身份。”陈临说着，调出了收集到的所有石碑影像，“或许，答案藏在某个被我们忽略的平行时空里。”
林夏突然想起机械先知留下的最后一段影像。她快速检索实验室的数据库，终于找到一段之前因损坏而未能完全解析的片段。画面中，机械先知面对的黑色物质突然凝聚成一个模糊的人形，与如今出现的神秘人极为相似。“在星渊结晶的核心...隐藏着比观测者更古老的存在...”机械先知的声音断断续续，“它是...秩序与混沌之外的...”影像再次中断。
就在众人陷入沉思时，城市外围传来巨大的爆炸声。透过监控画面，他们看到一座悬浮建筑被黑色能量吞噬，从中走出数十个身披黑袍的身影，为首的正是那个神秘人。他抬起手，黑色能量如潮水般涌向新伊甸城，量子防护罩在接触到能量的瞬间发出刺目红光，开始剧烈震荡。
“持剑者们，准备迎接真正的命运考验吧。”神秘人的声音在整个城市上空回荡，“你们以为终结了观测者的轮回，就能获得自由？在绝对的‘终焉之力’面前，一切反抗都是徒劳...”
陈临握紧断剑，双色光芒重新亮起：“不管是什么力量，我们绝不会再让它操控世界！”随着他的一声令下，守界者们纷纷出动，新一场关乎多元宇宙存亡的战斗，就此拉开帷幕...