漱芳斋内，小燕子心急如焚。她在房间里来回踱步，满脑子都是永琪被禁足的模样和皇阿玛反常的举动。柳青柳红带来的线索成了她唯一的希望，可那位知晓古井秘密的老太监，却深藏在皇宫最隐秘的角落。
“小卓子、小凳子，咱们想办法溜出去！”小燕子突然停下脚步，眼中闪过一丝狡黠。两人面面相觑，小卓子苦着脸说：“格格，皇阿玛下了死命令，守卫把漱芳斋围得水泄不通，根本出不去啊！”
小燕子眼珠一转，盯上了墙角的大木桶：“咱们扮成送泔水的！把木桶挖个洞，我躲在里面，你们趁机抬出去！”说干就干，三人忙活了大半夜，终于在天亮前完成“计划”。当守卫们看到小卓子和小凳子吃力地抬着散发异味的木桶时，捂着鼻子不耐烦地挥了挥手，就这样，小燕子顺利逃出了漱芳斋。
按照柳青柳红提供的线索，她偷偷来到了冷宫附近的一间破旧屋子前。推开门，一股霉味扑面而来，屋内光线昏暗，一位白发苍苍的老太监正蜷缩在角落里。“公公，我是小燕子，我想打听古井的事！”小燕子急切地说道。
老太监浑浊的眼睛突然亮了起来，颤巍巍地抓住她的手：“格格，您怎么知道……那是皇室最大的秘密啊！当年，皇上为了探寻长生之术，命钦天监建造观星井，却意外打开了时空通道。有人穿越到了未来，也有人从未来回来，而这个秘密，只有历代帝王知晓。”
小燕子浑身发冷：“所以皇阿玛……”老太监点点头：“没错，皇上曾意外穿越到未来，在那里经历了许多事，回来后性情大变，还特意抹去了医案中关于穿越的记载。他一直害怕时空紊乱，会给大清带来灾难。”
与此同时，在现代，阿杰、林悦和周明守在古井旁。井壁上的文字被完整拓印下来，其中提到的“以身为引”让众人不寒而栗。“难道每次穿越，都需要有人献祭？”林悦声音颤抖地说。阿杰握紧拳头：“小燕子在清朝肯定也发现了什么，我们得想办法联系她！”
就在这时，古井突然发出一阵诡异的蓝光，水面剧烈波动。阿杰不顾一切地冲向井边：“小燕子，如果你能听到，千万不要靠近时空通道！其中有危险！”
而在清朝皇宫，小燕子从老太监处得知真相后，立刻赶往景仁宫。她要告诉永琪，要和他一起想办法，阻止皇阿玛为了守护秘密做出傻事。可当她赶到时，却发现景仁宫大门敞开，永琪早已不见踪影。询问侍卫才得知，皇阿玛宣永琪去了观星井……
小燕子心猛地一沉，朝着观星井的方向狂奔而去。夜色中，观星井散发着幽幽的光芒，皇阿玛和永琪的身影在光晕中若隐若现。皇阿玛的声音传来：“永琪，为了大清的安稳，有些秘密必须永远封存！”永琪焦急地喊道：“皇阿玛，小燕子说穿越并非只有危险，或许还有转机！”
小燕子冲进光晕，大声喊道：“皇阿玛！永琪！真相不是这样的！”就在这时，古井突然爆发出强烈的光芒，时空开始扭曲，现代与古代的画面在光晕中重叠，阿杰的声音隐隐传来：“小燕子！快离开！”一场跨越时空的危机，正在逼近……