林轩消散后的宇宙，因本源结晶的融入而焕发出勃勃生机。玄界的灵气变得更加纯净醇厚，悬浮的岛屿重新绽放出绚丽光彩，断裂的灵脉在混元法则的滋养下逐渐愈合；地球上，那些因腐化法则变异的生物恢复了正常形态，被机械堡垒破坏的城市废墟上，崭新的建筑如春笋般拔地而起，科技与灵气的融合也进入了全新阶段。
林晚晴手持本源结晶，在青玄宗旧址上建立起混元盟。盟内集结了玄界各大宗门与地球古老家族的精锐，他们以本源结晶为核心，构建起守护两界的法则屏障。王虎整日泡在工坊里，将湮灭炮与混元法则结合，研发出能自动追踪腐化波动的 “混元湮灭阵列”；影则带领着影卫，穿梭于玄界与地球的各个角落，清理纪元议会残留的暗桩。
然而，表面的平静之下，暗流正在悄然涌动。在宇宙边缘的一片被称为 “虚渊裂隙” 的神秘区域，空间裂缝中不断渗出暗紫色的雾气。这些雾气凝聚成实体，竟重塑出一位黑袍人的身形 —— 正是曾在暗物质堡垒中 “消亡” 的机械头颅。他胸口处，一颗跳动着的暗紫色晶体散发着诡异光芒，上面布满与深渊核心同源的纹路。
“玄天仙尊以为消灭了核心成员就能高枕无忧？” 机械头颅的金属触须扭曲蠕动，“深渊核心的碎片早已散落宇宙，只要集齐足够的力量……” 他话音未落，虚渊裂隙深处传来锁链拖拽的声响，数十个被腐化的身影缓缓走出，他们眼中闪烁着幽紫光芒，身上缠绕着散发恶臭的黏液。
与此同时，在地球的一处古老遗迹中，考古队意外发现了刻有纪元议会图腾的石板。当研究人员试图拓印图腾时，石板突然爆发出暗紫色光芒，将所有人的意识卷入一个虚幻空间。在那里，他们看到了一个巨大的齿轮装置，装置中心镶嵌着一块深渊核心碎片，而在齿轮的阴影中，机械头颅正发出阴森的笑声。
这一异常事件很快传到混元盟耳中。林晚晴立刻召集众人，她将混沌灵根与本源结晶产生的感应投影在议事厅中：“最近玄界与地球多处出现腐化波动，这些波动虽微弱，但都与纪元议会的气息有关。先祖留下的混元法则屏障能抵御大规模攻击，却难以察觉这种渗透式的威胁。”
星陨转动着修复的星渊罗盘，罗盘指针在某个方向剧烈震颤：“根据罗盘显示，所有波动的源头似乎都指向虚渊裂隙 —— 那是宇宙边缘最不稳定的区域，就连星渊族的古籍都鲜有记载。”
王虎拍了拍新研发的巨型机甲，金属外壳上流转着金黑色的混元符文：“管他什么裂隙！咱们直接杀过去，把那些漏网之鱼一锅端了！”
影却皱起眉头，青玄剑在手中轻轻晃动，剑刃映出她凝重的神色：“不可大意。机械头颅能在核心爆炸中存活，必然留有后手。而且从地球遗迹的情况来看，他们似乎在通过某种图腾，潜移默化地腐化普通人的意识。”
经过商议，混元盟决定兵分两路。林晚晴带领青玄宗精锐与星渊族修士前往虚渊裂隙，探寻机械头颅的踪迹；影则率领影卫深入地球各个角落，调查纪元议会残留图腾的影响。王虎留在混元盟总部，负责调试和完善防御阵列，同时研发针对深渊核心碎片的武器。
林晚晴一行人乘坐星渊纸舟抵达虚渊裂隙时，眼前的景象令人不寒而栗。这里的空间如同破碎的镜面，无数裂缝中渗出暗紫色雾气，雾气凝聚成各种扭曲的生物，它们的身体由腐化法则与暗物质构成，每一次嘶吼都能引发空间震荡。
“小心，这些生物的攻击会污染灵识！” 星陨话音刚落，一只形似巨蝎的腐化生物便挥舞着毒尾袭来。它的毒刺上滴落的液体，竟能腐蚀星渊纸舟表面的星纹。林晚晴立刻催动混沌灵根，血色符文化作锁链缠住巨蝎，然而接触到腐化力量的锁链，开始迅速变黑。
“混元净世！” 林晚晴大喝一声，从本源结晶中引动一缕混元之力。金黑色的光芒闪过，巨蝎发出凄厉惨叫，身体在光芒中分解成虚无。但更多的腐化生物从裂缝中涌出，它们似乎受到某种召唤，悍不畏死地冲向星渊纸舟。
在地球的另一边，影带领影卫潜入一座被腐化影响的城市。街道上的居民眼神空洞，如同行尸走肉，他们的皮肤上浮现出细小的暗紫色纹路。影的青玄剑微微发烫，剑身上的符文自动亮起，指引她找到了城市地下的一处祭坛。祭坛中央，一块刻满纪元议会图腾的石碑散发着幽光，石碑周围，几个黑袍人正在举行某种邪恶仪式。
“破！” 影身形一闪，青玄剑如闪电般刺向石碑。但在剑刃触及石碑的瞬间，一股强大的反震力将她弹开。黑袍人见状，纷纷祭出法器，暗紫色的能量形成囚笼，将影卫们困住。“你们以为能阻止纪元的降临？” 为首的黑袍人狞笑着，“机械大人的计划，早已渗透到宇宙的每一个角落！”
而在虚渊裂隙深处，林晚晴终于发现了机械头颅的巢穴。那是一座由暗紫色晶体构建的高塔，塔顶，机械头颅正将收集到的深渊核心碎片嵌入一个巨大的阵法中。当他看到林晚晴等人时，发出一阵刺耳的笑声：“来得正好，你们的力量，将成为阵法启动的最佳祭品！” 随着他的话音落下，高塔周围的晶体开始疯狂吸收虚渊裂隙的能量，一场新的危机，正在逼近……