大明帝国与荷兰之间的马六甲海战终于落下帷幕，这场激烈的海战让双方都付出了巨大的代价。
荷兰人在这场战斗中遭受了重创，除了十艘武装商船狼狈地逃向锡兰岛方向外，他们的二十艘五百吨级战舰中有三艘被击沉，其余十七艘均被明军俘虏。此外，五十艘武装商船除了逃走的十艘，被击沉了三十艘，余下的十艘成为明军的战利品。更糟糕的是，还有千余荷兰军人被明军俘虏，战死、淹死的更是不计其数。
然而，明军这边的损失也不容小觑。四艘辅助舰被击沉了三艘，十四艘二百吨级盖伦船中，一艘被击沉，四艘遭受重创，五百吨级的战舰也有一艘被击沉，五艘受到重创。就连八百吨和一千吨级的战舰也都各自带伤。在这场激战中，明军阵亡将士达七百余人，受伤者更是多达五百余人。
尽管如此，这场战斗最终还是以明军的惨胜而告终，荷兰舰队几乎全军覆没。随着大明帝国援军的及时赶到，亚齐舰队剩余的两百余艘舰只面临着严峻的局势。除了十余艘凭借着顺风之势侥幸逃脱外，其余的舰只果断地举起了白旗，向明军投降。
可以说，这一仗，彻底将荷兰人在南洋海面上所有海上力量一扫而空，如果他们要想卷土重来，那么就得要从南亚半岛乃至更加遥远的本土重新调派实力更加强大的一千五百吨级的战舰以及数量更多的千吨以下的战舰才行。
即便是一千五百吨级战舰，明军也不怕，因为他们有着百余艘一千吨级的盖伦船。或许，单打独斗打不过你，但是，双拳难敌四手，哪怕十比一也能群殴死你。
何况现在这个时期正处于三十年战争的高潮时期，荷兰人有没有这个精力将自己庞大的舰队调到如此遥远的东方，尚且还是个未知数。
因此，大明帝国不光是名义上，实际上已经是东亚地区，乃至是亚洲第一强的海军强国。
这场战斗的影响是极其深远的，接二连三的打败了海上强国西班牙和荷兰。欧洲列国真正的开始正视起这位亚洲巨无霸，随后在天启二十四年（1644年）初英、法、葡、西、荷、瑞等国纷纷派出使者出使大明，不过这只是后话了。
天启二十二年（1642年）九月初二，马六甲海战结束的第二天，亚齐陆军果断的解开了包围圈，两万余士兵在元帅兰卡曼的率领下迅速撤往了马来半岛中部山区。
九月末，明军刚刚登陆爪哇岛东部地区，马塔兰苏丹国便派出了使臣向明军投降。
十月初，万隆苏丹国背弃了荷兰人向明军投降。
十月中旬，明军在巴达维亚城周边歼灭了荷兰仆从军千余人，彻底包围了该城。同时，海军第一分舰队在海面上封锁了港口，自此，巴达维亚成为了一支鳖，被彻底封锁。
十一月初五，断粮许久的亚齐军向彭亨苏丹投降，随即两万亚齐人便被交给了明人。
十一月初十，明军及其仆从军正式登陆苏门答腊岛。帕迦鲁荣王国、亚鲁王国、夏克苏丹国、德马克苏丹国纷纷倒戈，投向了大明帝国的怀抱。
十二月初，明军彻底包围了亚齐苏丹国的首都大亚齐，十二月十五日，明军攻占了王宫，女苏丹萨菲亚丁在王宫中上吊自杀，亚齐苏丹国灭。
十二月末，荷属东印度公司，巴达维亚总督安东尼·范·迪门高举白旗，开城向明军投降。
这座荷兰人耗时二十余年修建的坚城正式落入大明帝国的手中。
自此，耗时两年三个月的南洋之役彻底结束。
天启二十三年（1643年）大明帝国钦差，菲律宾总督范文程在更名为雅加达的原荷兰总督府召开了南洋会议，参会的有将近三十余个原苏丹国，数个王国以及百余个部落首领。
在这个被后世称之为雅加达和会的会议上，范文程作为大明帝国代表与参加会议的一百多个酋长、苏丹签署了和平协议。
各部落酋长、国王、苏丹国正式放弃世俗管理权、国王封号，正式加入大明帝国马来行省、印尼行省。
而大明仅仅只是付出了百余个郡王、侯爵的封号。相比起以往的爵位，此时军事实力空前强大的大明帝国并不会为这些尊贵的爵位支付哪怕一龙元的俸禄。
在随后的十年里，大明帝国的军队、官员陆续接管了各地的管理权，无数的当地特产，如香料、胡椒、蔗糖经过华商商会之手被送入了大明帝国千家万户。
特别是，香料、胡椒的全球最大产地被大明帝国霸占，致使欧洲各国都失去了这些让他们养成了依赖的食品佐料。也为后来欧洲各国派出使团出使大明帝国埋下了伏笔。
随后的时间里，随着马来省的霹雳州、巴生河及鹅麦河汇流处发现了锡矿；彭亨、丁加奴、柔佛发现了优质铁矿；沙巴州的基纳巴卢山南坡的马穆发现了铜矿；吉兰丹发现了金矿。在印尼省的巴布亚岛上发现了铜、金矿；在邦加岛和勿里洞岛发现了锡矿；同时还在省内多处发现了露天煤矿。
因此，大明帝国随后加强了对两省的控制，并开始逐步的将国内的百姓移民到了两地。
天启二十三年（1643年）春，南洋舰队郑森，率领一支十余艘的小型舰队以及一个营的士兵，从帝汶岛出发，开始了自己的远洋之旅。
三月初二，他们在一个名叫新荷兰的大陆登陆。在这个没有任何建筑的港口登陆时，年轻胆肥的郑森笑着给这个港口取了一个名字——成功港。随后的三个月时间里，他冒着台风，绕着这座岛屿航行了一圈，并命人画出了整座大岛的地图。随后在这座岛的东北方向，再次发现两座紧紧挨在一起，像一把手枪的岛屿。
同年底，一封来自南洋舰队郑芝龙的捷报被送入了北京城朱由校的手中。
天启二十四年（1644年）正月，朱由校下旨，给年仅二十岁的郑森赐名为郑成功，并册封其为延平侯，同时正式给他发现的海港命名为成功港，他发现的大岛取名为澳州，形似手枪的两座岛屿被命名为新希望。
二月，内阁下达指令，正式开启往澳州、新希望移民的政令。