南宋年间，江南有座小镇叫青溪镇。原本宁静祥和的小镇，突然被一场可怕的瘟疫笼罩。染上瘟疫的人先是浑身乏力、发热咳嗽，接着便会全身长满红疹，痛苦不堪，没几天就气息奄奄。
镇上的大夫们束手无策，开的药方毫无效果，病死的人越来越多。一时间，小镇上哭声震天，家家户户都挂起了白幡，弥漫着绝望的气息。
济公听闻了青溪镇的惨状，心中怜悯众生，决定前往救助。他一路风尘仆仆，终于来到了青溪镇。
刚进镇子，济公就看到街上冷冷清清，店铺大多关门大吉，偶尔有几个行人也是脚步匆匆，脸上满是惊恐。济公拦住一个神色慌张的年轻人，问道：“小施主，这镇上到底发生了何事，为何如此凄凉？”
年轻人叹了口气说：“大师，我们镇上闹瘟疫啦，死了好多人，大家都怕被传染，都不敢出门了。”
济公点点头，说：“莫怕莫怕，老衲前来，便是要解这瘟疫之困。”
济公先来到镇上的医馆，向大夫们详细询问了病人的症状和之前用过的药方。大夫们无奈地摇头，说各种方法都试过了，就是不见效。
接着，济公开始在镇上四处走访，查看患病之人的情况。他发现，患病的大多是家境贫寒、居住在潮湿阴暗之地的人，而那些住在通风良好、干净整洁房屋里的人，患病者相对较少。
经过一番仔细调查，济公心中有了猜测。他又来到镇外的河边，发现河水浑浊不堪，散发着一股刺鼻的气味，河面上还漂浮着许多垃圾和死鱼。原来，前些日子镇上的一些不良商家为了节省成本，将污水和垃圾都排到了河里，导致河水被严重污染。而镇上的居民大多饮用这河里的水，时间一长，便引发了瘟疫。
济公回到镇上，召集了所有的百姓。他站在高台上，大声说：“乡亲们，老衲已经查明，这场瘟疫并非天灾，而是人祸。是那些不良商家将污水和垃圾排到河里，污染了水源，咱们喝了这被污染的水，才染上了瘟疫。”
百姓们听了，纷纷义愤填膺，要求严惩那些商家。可那些商家却狡辩说：“疯和尚，你别在这里胡说八道，这瘟疫明明是老天爷降下的惩罚，跟我们有什么关系！”
济公笑着说：“既然你们不承认，那老衲就给你们证明一下。”说着，他让几个年轻力壮的小伙子去河边打来几桶水，又从怀里掏出一些草药，放进水里，并用法力加热起来。不一会儿，水变得清澈起来，还散发着一股淡淡的药香。
济公说：“乡亲们，这水已经被老衲用草药净化过了，大家可以放心饮用。而且，以后大家都要注意，不能再饮用这被污染的河水了。”
百姓们半信半疑，但还是有人试着喝了净化后的水。过了几天，那些喝了净化水的人，病情竟然有了明显的好转。其他百姓见状，纷纷效仿，都开始饮用净化后的水。
与此同时，济公又让镇上的青壮年们一起清理河道，将河里的垃圾和死鱼都打捞上来，并对河水进行了进一步的净化处理。
在济公的带领下，青溪镇的百姓们齐心协力，与瘟疫展开了一场艰苦的斗争。没过多久，瘟疫终于被控制住了，患病的人越来越少，小镇又渐渐恢复了往日的生机。
那些不良商家看到自己的恶行被揭穿，瘟疫也被控制住了，吓得纷纷跪地求饶。济公对他们说：“你们为了私利，不顾百姓死活，罪不可赦。但老衲希望你们能真心悔改，以后多做善事，弥补自己的过错。”
商家们连连点头，表示以后一定会改过自新。
青溪镇的百姓们对济公感恩戴德，纷纷拿出家里的食物和财物来感谢他。济公却笑着拒绝了，他说：“乡亲们，老衲救你们，并非为了这些财物。只要大家以后能珍惜生命，爱护环境，和睦相处，老衲就心满意足了。”
说完，济公又摇着破扇子，云游四方去了。而他在青溪镇妙解瘟疫谜团的故事，也在江南一带流传开来，成为了人们口中的传奇。