月球之战结束后的第七天，地球仿佛被一只无形的巨手攥住咽喉。日本樱岛火山口蒸腾的烟雾中，首次检测到暗紫色的量子粒子；喜马拉雅山脉深处传来沉闷的轰鸣，地质雷达屏幕上的波形图扭曲成诡异的螺旋状；美国黄石公园的间歇泉喷出的不再是滚烫的沸水，而是泛着金属光泽的暗紫色流体。世界各地的地质监测站如同惊弓之鸟，红色警报此起彼伏，环太平洋火山带与地中海—喜马拉雅地震带的地壳深处，持续传来与星轨图腾频率高度吻合的量子波动，仿佛地球的心脏正在被邪恶力量强行改写心跳频率。
灰原哀实验室的全息投影不断闪烁着刺目的红光，地球模型表面的警示光点如同溃烂的伤口。她将地核探测数据与星轨图腾的能量图谱重叠，银灰色的发丝下，眼神布满血丝。“地核中的量子图腾正在苏醒，”她的声音像是从冰窖中传来，“它与宇宙残留的暗紫色能量形成共振回路。更糟糕的是，这种共振正在瓦解地球的量子磁场——东京塔的导航系统出现时空错位，南极科考站的时间记录倒退了三小时，这些都是磁场紊乱的前兆。”实验室里的电子设备接连发出刺耳的蜂鸣，量子计算机的显示屏突然跳出满屏乱码，仿佛在无声地尖叫。
少年侦探团的成员们被笼罩在压抑的氛围中。元太蜷缩在沙发角落，手中的鳗鱼饭早已凉透，他却毫无食欲，突然捂住胸口剧烈颤抖，额头青筋暴起，嘴里喃喃念着“3.......”这些看似随机的数字，在灰原哀的脑波分析仪中，竟与地核的量子波动频率存在某种隐秘关联；光彦将实验室的地板铺满拓扑图纸，红蓝色的线条交织成迷宫，他的眼睛布满血丝，固执地用放大镜比对每一条曲线，试图从数学规律中找到破解图腾的密钥；步美整日抱着膝盖坐在窗边，原本灵动的大眼睛失去光彩，每当提及梦境，她就浑身发抖：“有个发光的东西...在岩浆里转啊转，它好像在数我们的心跳...”
柯南的侦探徽章持续散发着灼人的温度，荆棘纹路中的金色光芒如同将熄的烛火，明灭不定。他摩挲着徽章表面的镜面，那里偶尔会闪过地核深处的模糊画面——液态金属的海洋中，某种古老的存在正在苏醒。当他望向先天失明少女时，发现对方正用盲杖敲击地面，侧耳聆听着只有她能“看见”的声音：“地下传来齿轮咬合的声音...越来越近了。”
国际量子物理学会的全息会议充满了末日般的氛围。来自中国的量子地质学家调出地核三维扫描图像，画面中，一个直径超过千公里的暗紫色图腾悬浮在地核的液态金属海洋之上。它的纹路与星轨图腾如出一辙，表面流转的幽光中，隐约可见无数人影在痛苦挣扎。“根据同位素检测，这个结构的形成时间至少在46亿年前，”科学家推了推颤抖的眼镜，“也就是说，在地球诞生之初，它就已经存在了。这根本不是地质构造，而是高等文明埋下的‘宇宙开关’。”
为了阻止量子图腾完全觉醒，柯南带领众人登上由灰原哀改良的“量子钻探者号”。飞船外壳闪烁着冷冽的蓝光，那是由反物质涂层构成的防护盾。随着钻探深度增加，舱内温度飙升至2000c，量子护盾发出不堪重负的嗡鸣。探测器的警报声突然变得尖锐——前方的量子磁场强度已超过设备上限，仪表盘的指针疯狂旋转，在某一刻，所有显示屏同时亮起诡异的暗紫色。
当钻探船冲破最后一层地壳屏障，众人被眼前的景象震撼得说不出话。液态金属的海洋翻涌着暗紫色的浪花，粘稠的物质如同活物般扭曲蠕动。直径千公里的量子图腾悬浮在海洋中央，表面的纹路如同血管般凸起，每一次能量脉动，都让整个地核空间产生肉眼可见的扭曲。在图腾核心，一个与月球信标同源的能量体缓缓转动，它每旋转一圈，就有无数暗紫色粒子喷薄而出，射向地球表面。
“准备战斗！”柯南的喊声被突然爆发的轰鸣淹没。图腾表面的纹路剧烈扭曲，液态金属沸腾着凝聚成怪物。岩浆与地脉融合的守卫挥舞着燃烧的巨斧，量子化的远古恐龙嘶吼着喷出腐蚀性的紫色雾气，它们的身体不断重组，子弹与能量光束穿过躯体却无法造成实质性伤害。先天失明少女高举盲文素描本，光芒驱散了部分怪物，却在接触图腾核心的瞬间被吞噬。
“它们的能量循环与地核磁场同频！”光彦突然大喊，他的拓扑图纸在量子风中猎猎作响，“就像共鸣电路，我们需要改变磁场频率！”柯南立刻指挥船员启动量子干扰装置，船身爆发出刺目的蓝光。当干扰频率与地核磁场达到某个临界值时，怪物们的动作出现了0.1秒的停滞。
“就是现在！”柯南带着几名队员冲向图腾的能量节点。然而，暗紫色的能量突然汇聚成漩涡，神秘人从中走出。他的实体比在月球时更加凝实，周身缠绕的暗紫色能量如同锁链，每一次甩动都在空间中划出裂痕。“地核图腾是宇宙熵增定律的具象化，”他的声音裹挟着岩浆的轰鸣，“只有重启世界，才能终结永恒的熵寂。”
柯南的侦探徽章爆发出前所未有的强光，金色锁链如巨龙般缠住神秘人的权杖。先天失明少女将手按在素描本上，所有“希望先锋队”的孩子同时将信念注入其中。当希望的光芒与金色能量融合的刹那，地核中的液态金属掀起数百公里高的巨浪，能量碰撞的冲击波向着宇宙深处扩散。而在图腾核心，那个转动的能量体表面，终于出现了第一道裂痕... ...