宇宙暗网中，支配者残留的病毒意识如无形的毒瘤，在量子数据流间飞速蔓延。裂缝文明的主服务器突然瘫痪，所有防御系统反向运转；修真文明的灵气网络被篡改，修士们体内的灵力开始暴走。自由方舟的警报声此起彼伏，监测屏上，暗紫色的病毒代码如同活物，正沿着星桥的能量脉络向各个星系渗透。
“这些代码在改写文明的底层逻辑！”科学家的手指颤抖着划过全息投影，“机械文明的程序被植入绝对服从指令，生物文明的基因链出现未知序列...”不完美之种的新芽再次蜷缩，藤蔓上渗出带有腐蚀性的黑液，林婉的星光在花蕊中忽明忽暗：“病毒核心藏在暗网深处的‘支配中枢’，但暗网已被完全污染，贸然进入...九死一生。”
秦逸的星光之躯泛起细密的裂纹，暗网病毒与他体内的平衡印记产生排斥反应，剧痛如电流般窜遍全身。他望着被病毒侵蚀的星系，意识中不断闪现文明被彻底数据化的画面——所有生命失去情感与思想，成为支配者的提线木偶。“无论多危险，必须摧毁中枢。”他引导共生之力修复裂痕，将终焉之剑的剑柄与星溯号的主控系统相连。
觉醒者们将意识接入暗网，却瞬间陷入光怪陆离的虚拟世界。这里的空间由二进制代码构成，每一道数据流都可能是致命陷阱。残缺派修士的混沌之力在数据海洋中化作破碎的乱码，裂缝文明的黑客精英被病毒程序追击，化作一串串消失的代码。“保持意识集中！”秦逸的声音在数据洪流中回荡，“病毒会放大恐惧，找到真实的锚点！”
众人沿着病毒传播的轨迹深入，遭遇“数据守卫者”的拦截。这些由病毒凝聚而成的怪物形态诡异：有的是能吞噬意识的巨型二进制眼球，有的是挥舞着代码镰刀的机械骷髅。小女孩将机械心脏与暗网防火墙融合，发射出“逻辑清道夫”程序，暂时瘫痪部分守卫者；秦逸则挥动终焉之剑，剑刃上的共生纹路与数据碰撞，爆发出净化的金色光芒。
突破重重阻碍后，众人抵达暗网核心区域。一座由暗紫色数据流构筑的“支配王座”悬浮在中央，王座上，支配者残留的意识体正在重组，他的身体由密密麻麻的代码构成，面部闪烁着无数被同化文明的面孔。“欢迎来到新世界的中枢，”他的声音由机械音与无数低语混合而成，“在这里，所有反抗都是无效的递归程序。”
王座突然释放“数据吞噬者”，这些黑色的漩涡能将意识分解成最原始的0和1。觉醒者们的虚拟身体开始崩解，残缺派领袖燃烧最后的神识，结出“混沌逆算法”，试图扰乱吞噬者的运行逻辑；裂缝文明则启动“量子回滚协议”，将部分区域的数据状态回溯到病毒入侵前。但每一次反抗，都让支配者的意识体变得更加凝实。
秦逸感受到体内的共生本源与暗网产生共鸣，他突然意识到：“暗网也是共生的一种形态！病毒只是破坏了平衡！”他引导星光之力，在数据海洋中构建出“共生防火墙”，将不完美之种的生机转化为能修复代码的“生命算法”。当防火墙与吞噬者相撞，暗网空间剧烈震颤，部分被污染的数据开始恢复原本的色彩。
“原来如此...你想重塑暗网的秩序。”支配者的意识体发出刺耳的笑声，“但你永远无法消灭支配的本能！”他将整个王座的能量注入手中的“数据权杖”，权杖顶端凝聚出能格式化所有数据的“归零射线”。千钧一发之际，星孩的锈蚀银针突然穿透维度，刺入权杖核心。银针引发的时间涟漪中，秦逸看到了暗网的起源——曾经，它是文明间自由交流的纽带，却因支配者的野心沦为凶器。
“暗网不该被支配，而应被守护。”秦逸将共生之力、平衡印记，以及所有文明对自由连接的渴望，化作“逆命数据洪流”。洪流冲击权杖的瞬间，支配者的意识体开始崩解，但在消散前，他将病毒的终极指令“支配永劫”散播到整个暗网。无数暗紫色的倒计时在各个星系的网络中浮现，预示着一场更大的危机即将降临。而在暗网最深处，一双由代码构成的眼睛闪烁着红光，默默注视着这一切...