时空医莲的光芒抚平了宇宙的创伤，新生文明在修复后的星空中蓬勃生长。然而，当秦逸与林婉的意识融入太素本源不过百年，苏瑶的根系网络突然发出刺耳警报。正在时空医莲核心沉睡的星孩猛然惊醒，婴儿的瞳孔深处闪过诡异的数据流，胸前的神农羽翼残根开始渗出黑色黏液——沉寂已久的逆医疗暗网，正以一种更恐怖的形态卷土重来。
“检测到三千个文明出现记忆篡改现象！”苏瑶的藤蔓剧烈震颤，结晶方碑表面浮现出密密麻麻的裂痕，“那些被交易的痛苦记忆...正在实体化！”秦逸与林婉的残魂在太素本源中同时苏醒，金瞳光芒穿透时空，看到暗网如同黑色藤蔓般缠绕在各个星系的文明核心。在机械文明的母星，人们的记忆被替换成永无止境的病痛折磨；魔法大陆上，治愈咒语化作召唤痛苦的邪术。
“是初代道侣的残余意识！”林婉的声音带着难以掩饰的焦虑，“她在利用时空裂缝的漏洞，将暗网与维度瘟疫融合！”秦逸的意识化作流光，强行凝聚出半透明的躯体，手中的锈蚀银针重新泛起微光。当他试图触碰暗网节点时，却发现银针表面瞬间覆盖了一层镜面物质——暗网竟能将攻击反射回施术者的意识深处。
在暗网的核心，初代道侣的虚影正在操控着由痛苦结晶构成的巨型沙漏。每一粒沙子落下，就有一个文明陷入医疗混乱。“欢迎回来，守护者们。”她的笑声混杂着无数病患的哀嚎，“这次，我要让整个宇宙成为痛苦的交易场！”星孩突然发出尖锐啼哭，身体不受控制地飞向暗网，他的羽翼残根与暗网中枢产生共鸣，无数黑色触手从婴儿体内钻出。
“拦住星孩！”秦逸不顾一切地冲向暗网，却被记忆洪流吞噬。他看到平行时空里，自己没能阻止暗网的扩张，宇宙沦为一片荒芜的医疗废墟；又目睹林婉的残魂被暗网彻底同化，成为初代道侣的傀儡。“这些都是幻象！”林婉的金瞳光芒撕开记忆迷雾，残魂化作锁链缠住星孩，“秦逸，暗网的弱点在...时空锚点！”
秦逸强行突破记忆牢笼，循着林婉的指引找到暗网的时空锚点——那是由初代道侣的悔恨与执念凝结而成的晶体。当锈蚀银针刺入晶体的瞬间，整个暗网开始剧烈震颤。但初代道侣早有准备，她释放出维度瘟疫的终极形态“逆熵孢子”，孢子所到之处，生命的自愈本能被彻底逆转，健康者会在瞬间患上所有已知疾病。
“必须净化孢子！”林婉的残魂燃烧起最后的力量，金瞳光芒与秦逸的神农血脉融合，形成净化结界。然而，逆熵孢子的数量远超想象，结界在孢子的侵蚀下不断缩小。星孩在挣扎中逐渐被暗网同化，婴儿的眼神变得冷漠空洞，抬手释放出足以摧毁星系的痛苦波动。
千钧一发之际，苏瑶的根系网络突然爆发强光。时空医莲的花瓣化作巨大的过滤网，将逆熵孢子尽数吸纳。“快！利用莲心的力量！”苏瑶的声音带着决绝，她的根系开始崩解，为秦逸争取时间。秦逸咬牙将银针插入莲心，神农血脉与时空医莲的本源之力共鸣，形成能回溯时间的“太素溯流”。
在时间逆流中，暗网的扩张被暂时遏制，逆熵孢子也逐渐消散。但初代道侣的意识早已遁入更深的时空裂缝，临走前留下警告：“只要宇宙存在对治愈的渴望，暗网就永远不会消亡...”星孩重新陷入沉睡，身体表面的黑色触手尽数褪去，可谁也不知道，下一次暗网复苏时，又会带来怎样的灾难。而秦逸与林婉望着满目疮痍的宇宙，深知这场关于医道与欲望的战争，远未到终结之时。