熵能炸弹危机解除后，宇宙并未迎来真正的安宁。林婉与秦逸发现，即便摧毁了被篡改的数据网络，零星的熵寂病毒仍在文明边缘地带悄然蔓延。更令人不安的是，秦逸的观测者银纹检测到时空波动异常——在熵海深处，竟出现了与初代实验室能量频率完全一致的信号，而信号源头，直指过去。
“这些波动...像是有人在刻意改写历史。”秦逸的银纹在星图上勾勒出诡异的弧线，他的脸色凝重如铁，“如果放任不管，现在的一切努力都将化为泡影。”林婉握紧手中残破的典籍，失明的双眼中金芒流转：“去初代实验室刚建成的时间节点，也许能从根源阻止熵寂的诞生。”
两人驾驶经过改装的“溯时号”飞船，利用星孩提供的归墟能量残片，强行撕开时空裂缝。当飞船穿越漩涡状的时空乱流，眼前的景象让他们瞳孔骤缩——一片荒芜的星域中，初代道侣正指挥着一群学者搭建实验室，此时的她眼神清澈，尚未被熵寂力量污染。
“小心！”秦逸突然将林婉拽向一旁，一道暗紫色的能量束擦着飞船掠过。逆医文明的时间特工早已在此埋伏，他们的舰船表面布满扭曲的时间符文，船头的巨炮正在蓄能。“你们以为能改变注定的结局？”特工首领的声音通过量子通讯传来，“杀死过去的道侣，熵寂就永远不会诞生！”
林婉心中警铃大作。她立即驱动典籍释放防护结界，金芒与暗紫色光束相撞，爆发出刺目的光芒。“不能让他们得逞！”她对秦逸喊道，“如果道侣死亡，未来的医疗文明将彻底断层，宇宙会陷入更大的混乱！”秦逸点头，银纹化作锋利的箭矢，射向敌舰的能源核心。
战斗中，林婉注意到一个诡异的细节：每当己方攻击即将命中敌舰，敌舰的规避动作总是快人一步。她突然顿悟，用意识与典籍沟通：“这些特工能预知我们的行动，因为他们...来自更遥远的未来！”典籍剧烈震颤，内页浮现出模糊的预言：“观测者即为变数，被观测者亦影响观测。”
秦逸的银纹在操作台上急速游走，观测者之力构建出复杂的量子纠缠场。“我明白了！”他眼中闪过光芒，“我们既是观测者，也是被观测者。他们能预知未来，是因为我们的行动已经成为历史的一部分！”他强行改变战术，让银纹随机生成攻击轨迹，同时用观测者之力干扰敌舰的时间探测系统。
就在局势胶着时，实验室方向突然传来骚动。一名年轻的道侣助手在搬运设备时失足，眼看就要跌入能量核心。林婉几乎本能地驱动典籍，金芒化作绳索将助手拉回安全地带。这一干预却引发了蝴蝶效应——实验室的能量平衡被打破，原本平稳的建设进度出现偏差。
“你们做了什么？！”特工首领的声音带着惊恐，“时间线正在崩溃！”果然，整个时空开始扭曲，无数记忆碎片在空中飞舞，有的显示着道侣误入歧途的未来，有的则是宇宙在熵寂中毁灭的末日景象。林婉与秦逸的意识在碎片冲击下摇摇欲坠，他们看到了自己的无数种结局：有的成为独裁的医神，有的沦为熵寂的傀儡。
千钧一发之际，秦逸想起在镜像维度领悟的“观测即改变”理论。他将银纹注入时空乱流，构建出中立的观测立场——既不干预历史，也不被历史影响。林婉则用典籍释放“医道本心”的波动，金芒如同一盏明灯，在混乱中开辟出一片稳定区域。两人合力将失控的能量引向别处，实验室最终恢复正常建设。
战斗结束后，逆医特工的舰船消失在时空裂缝中。林婉与秦逸疲惫地瘫坐在驾驶舱，他们知道，这次干预虽然没有改变道侣接触熵寂的命运，但至少保留了未来的可能性。离开前，秦逸用银纹在虚空中刻下警示符文，林婉则将典籍的一缕残念留在实验室——那是“大医精诚”的真正含义。
当飞船穿越时空回到现实，林婉的意识中突然响起初代道侣的困惑低语：“我究竟是灾难的始作俑者，还是命运的受害者？”这句话如同一记重锤，让两人意识到，熵寂的真相远比想象中复杂。而在熵海深处，一双眼睛正透过时间的迷雾，注视着他们的一举一动......