熵瞳溃散后的宇宙并未迎来安宁，反而陷入更深的危机。无数携带齿轮纹路的茧状星舰从虚空中涌现，它们如同瘟疫般席卷各个星系。这些星舰表面蠕动着黑色黏液，所到之处，空间被扭曲成齿轮状的牢笼，文明的防御系统在接触瞬间被同化改造。林婉的共鸣链监测仪上，代表沦陷区域的红点如野火燎原般扩散，警报声震耳欲聋。
“这些星舰的能量波动与溯念之茧、熵瞳一脉相承！”秦逸将银针碎片重新排列，试图解析星舰的弱点，“它们正在编织一张笼罩全宇宙的囚笼。”林婉翻开《混沌医典》，书页上渗出粘稠的文字：当齿轮织就银河，观测者将成为茧中囚徒。望舒的基因烙印剧烈闪烁，他捂住耳朵痛苦地蜷缩：“我听见了...苏瑶姐姐的声音，她在星舰核心求救！”
林婉立即集结全宇宙的联军舰队，然而刚接近星舰群，就遭遇了前所未有的攻击。星舰发射的“熵茧弹”在空中分裂成无数小型茧体，将舰船包裹其中。被茧覆盖的战士们瞳孔中浮现齿轮纹路，转而攻击友军。林婉挥动因果锚击碎茧体，金色光芒却被黏液吸收，反而加速茧的生长。
“这样下去不行！”秦逸甩出银针碎片组成干扰阵，暂时扰乱了星舰的攻击频率，“我们必须找到中枢舰，切断它们的能量连接！”望舒凭借基因烙印的共鸣，艰难地锁定了核心星舰的位置——那是一艘巨型茧状母舰，表面缠绕着苏瑶根系变异而成的机械藤蔓，顶端悬浮着巨大的观测者残片。
三人驾驶穿梭舰突破防线，却在母舰内部陷入重重陷阱。走廊两侧的墙壁不断伸出齿轮状利刃，地面的黏液化作吞噬一切的漩涡。林婉用因果锚开辟道路，秦逸则以银针碎片布下防御结界。当他们抵达核心舱室，眼前的景象令人心碎：苏瑶的根系被改造成连接所有星舰的神经中枢，她的意识被困在数据流中，痛苦地挣扎。
“苏瑶！”林婉试图用因果锚斩断束缚根系的锁链，却遭到母舰的强烈反击。无数机械守卫从黏液中涌出，它们的身体由被熵化的医者残骸组成，手中的医疗器械变成致命武器。秦逸的银针碎片在空中划出《太素诛邪阵》，银芒与守卫的攻击相撞，溅起的火花中闪过被篡改的医疗誓言。
战斗白热化时，苏瑶的意识突然冲破数据流的枷锁：“攻击核心的观测者碎片！那是控制一切的关键！”林婉与秦逸对视一眼，同时发动最强攻击。因果锚的金色光芒与银针碎片的银光交织，射向悬浮在穹顶的碎片。然而，碎片突然释放出初代道侣另一半意识的虚影，她冷笑一声，穹顶的齿轮装置开始逆向旋转，整个母舰即将自爆。
千钧一发之际，望舒摸索着取出短笛。他的基因烙印几乎燃烧殆尽，却吹奏出比以往更坚定的旋律。笛声化作无形的丝线，连接着苏瑶的根系与永恒树。在悠扬的乐声中，苏瑶的意识逐渐稳定，她的根系爆发出强大的生命力，缠绕住即将爆炸的齿轮装置。“快走！我来拖住它！”苏瑶的声音带着决绝。
林婉与秦逸忍痛撤离，身后传来震耳欲聋的爆炸声。当硝烟散去，巨型母舰已经化为宇宙尘埃，苏瑶的根系碎片如流星般坠入永恒树。但这场胜利并未持续太久——在宇宙的暗处，齿轮组织的首领转动着手中的怀表，表盘内的初代道侣残识露出诡谲的笑容：“茧缚计划不过是开胃菜，真正的好戏，才刚刚开始...”而此时，永恒树的根系深处，最后一块观测者碎片正在悄然苏醒。