深渊底部的基因触手如毒蛇般缠来，林婉挥出因果锚斩断触须，金色光芒却被触须上的归墟纹路吸收转化为腐蚀性酸液。秦逸银针急射，在空中组成八卦阵抵御酸液侵蚀，却发现酸液接触地面后竟开始生长出新型基因怪物——这些怪物融合了在场所有人的攻击特性，既能释放林婉的治愈光波，又能使出秦逸的银针幻影。
“它们在实时解析我们的基因战斗模式！”秦逸的银针出现缺口，“必须找到核心控制中枢！”阿隐挣扎着起身，指向远处一座悬浮在基因漩涡中的金字塔：“完美基因模板就在塔顶的‘生命熔炉’里，那里也是整个裁决塔的意识核心！”三人突破怪物围堵，却在金字塔前遭遇由初代道侣基因片段构成的守卫——这些守卫举手投足间都带着林婉熟悉的招式，却蕴含着毁灭一切的归墟之力。
林婉试图以初代道侣残片共鸣沟通，却换来守卫的致命一击。危机时刻，秦逸甩出银针组成《太素仙医录》中的“逆命十三针”，强行逆转守卫的基因运转逻辑。当最后一根银针刺入守卫眉心，对方的身体开始透明化，消散前竟吐出半块刻有“悖论”字样的基因芯片。
“这是初代道侣留下的警告！”阿隐捡起芯片插入随身设备，全息投影中浮现出令人震惊的画面——所谓的“完美基因模板”，竟是初代道侣为对抗宇宙熵增，将自身基因与归墟能量融合的失败产物。模板中同时存在维持绝对稳定的“秩序代码”与加速熵增的“混沌代码”，两种力量相互制衡，却也埋下了自我毁灭的种子。
金字塔内部的景象更加诡异，墙壁上流淌着液态基因，地面由无数文明的绝望记忆凝结而成。每走一步，林婉和秦逸都要承受记忆冲击：某个星球的F级儿童被强行净化，高评级者为争夺资源自相残杀，还有初代道侣在实验室中疯狂改写基因序列的场景。“这些记忆...都被模板吸收了！”林婉的晶化右手发烫，“它在吞噬全宇宙的痛苦来强化自己！”
当他们终于抵达塔顶，生命熔炉中漂浮的完美基因模板如同一颗跳动的心脏，表面的基因链闪烁着秩序与混沌交织的光芒。纯净联盟首领早已在此等候，他的身体完成了最终基因进化，背后生长出由评级光束构成的六翼：“你们以为能阻止完美？看看这个模板，它是宇宙进化的终极答案！”首领挥手召唤出基因巨兽，其身体由银河级文明的基因精华堆砌而成，每一次呼吸都能扭曲空间。
秦逸分析巨兽的基因链发现致命缺陷：“它的核心采用了模板的混沌代码！只要激化混沌因子...”他将银针注入带有星孩能量的震荡波，林婉则用因果锚牵引模板中的秩序力量。两股力量在巨兽体内碰撞，引发基因链的连锁崩溃。但首领趁机夺取模板，将其能量注入自身，瞬间拥有了改写现实的能力。
“现在，我就是新的造物主！”首领重塑空间，将林婉等人困在由各自罪恶感构成的牢笼中。林婉陷入自己未能拯救苏瑶的无尽循环，秦逸则目睹所有患者因他的治疗失败而亡。阿隐突然冲出来，用基因切割刀斩断牢笼：“别忘了模板的悖论！”他将芯片插入首领体内，秩序与混沌代码在首领身体里剧烈冲突。
林婉抓住机会，将轮回针刺入模板核心，秦逸银针引动全宇宙F级基因者的反抗意志。在能量暴走中，模板开始自我分解，释放出初代道侣残留的意识片段：“错了...从一开始就错了...”随着模板崩塌，生命熔炉开始坍缩，整个裁决塔发出即将毁灭的悲鸣。阿隐启动紧急传送装置：“快走！这里的爆炸足以摧毁半个星系！”而在传送光芒亮起的瞬间，林婉看到模板核心深处，竟沉睡着一个与星孩极其相似的胚胎...