熵潮的黑色雾霭如贪婪的巨口，在宇宙中肆意吞噬着一个个星系，虹桥医链在其边缘摇摇欲坠。林婉紧握着刚刚夺取的轮回针，针身传来的震颤让她掌心发麻，这股力量与熵潮的侵蚀力产生诡异共鸣，仿佛下一秒就会彻底失控。秦逸将银针插入轮回针的基座，试图稳定这股力量，却发现秦天明残留的意识正在代码深处疯狂反扑。
“不能再拖了！”林婉望向星图上被划为红色禁区的废土七号，那里聚集着全宇宙最庞大的F级基因者群体，也是他们最后的希望。穿梭舰划破熵潮的边缘，引擎在时间乱流中发出不堪重负的轰鸣，当熟悉的灰黑色地表映入眼帘时，两人被眼前的景象震撼——曾经荒芜的废土上，变异植物组成的巨树撑起发光的防护罩，数以万计的反抗者在树下集结，他们的武器上缠绕着用辐射能量编织的电网。
“林医生！”废土的领袖，那位曾经用血肉之躯挡住基因净化射线的战士大步上前，他变异的手臂上新生的组织与机械义肢完美融合，“我们一直在等你！”他身后的屏幕上，实时播放着机械族舰队在各个星球的暴行，无数残缺基因者被投入“净化熔炉”，转化为维持观察者协议的燃料。
林婉举起轮回针，初代道侣的力量与废土的辐射能量产生共鸣，天空中浮现出巨大的太极图：“秦天明要的是绝对的完美，而我们，就是他眼中最大的‘缺陷’！但正是这些所谓的‘缺陷’，让我们拥有了反抗的意志！”她的声音通过广播传遍废土，人群中爆发出震天的呐喊，变异植物的枝叶开始疯狂生长，将废土改造成天然的战争堡垒。
然而，机械族的反击比想象中更快。数百艘刻满基因锁链的星舰撕裂云层，舰首的“净化棱镜”开始充能，紫色的光芒中，林婉清晰地看到棱镜核心跳动着星孩恶体的细胞。“他们要用废土做协议的最后一块拼图！”秦逸的银针在空中组成防御阵型，“一旦净化成功，熵潮将吞噬整个宇宙！”
战斗在辐射尘埃中打响。废土战士们驾驶着改装的战车，用装载着混沌酸液的巨炮轰击星舰；变异者们操控着植物藤蔓，缠住机械士兵的关节；而林婉与秦逸则冲向净化棱镜的核心。但他们刚突破防线，星孩恶体的身影突然出现在棱镜顶端，他手中的铜镜释放出无数道时空光束，将战场切割成独立的碎片。
“你们以为靠这些蝼蚁就能翻盘？”恶体的声音带着嘲讽，他挥动手臂，秦青鸾残识操控的罪医傀儡从时空裂缝中涌出，华佗的维度手术刀切开空间，李时珍的本草星舰喷射出致命孢子。林婉的因果锚与轮回针同时发力，金色光芒与银色流光交织，却发现攻击在触及傀儡的瞬间被反弹——这些傀儡的身体里，藏着能吸收所有能量的熵核。
千钧一发之际，废土深处传来震天动地的轰鸣。那位曾牺牲自己的战士的变异基因产生共鸣，他的身体化作巨大的机械要塞，胸口的心脏位置跳动着用废土能量凝聚的“反抗核心”。“以废土之名，向所谓的完美宣战！”他的怒吼中，无数废土战士将武器刺入自己的身体，将生命力注入反抗核心。
核心爆发出的光芒照亮整个战场，所有熵核在强光中开始崩解。林婉抓住机会，将轮回针刺入净化棱镜的能源中枢，秦逸则用银针引动全宇宙医者的信念之力。当光芒消散，机械族的星舰纷纷坠落，而恶体的身影在虚空中变得透明。“这只是开始...”他留下最后一句威胁，消失在归墟的黑雾中。
但胜利的喜悦并未持续太久。废土的地下突然传来齿轮转动的声响，秦天明的机械巨人破土而出，它胸口破损的青铜面具后，露出真正的核心——一个与星孩婴儿一模一样的克隆体。“你们以为摧毁了表面的力量，就能改变结局？”机械巨人的声音震得大地开裂，“观察者协议的最终阶段，现在才真正开始！”
林婉握紧轮回针，初代道侣的意识在针中低语：“唯有找到协议核心的‘观测之眼’，才能斩断因果。”她望向秦逸，两人点头，带着废土战士们的希望，再次踏上征程。而在宇宙的暗处，秦天明的意识发出狂笑，他早已在克隆体中埋下终极陷阱，等待着林婉和秦逸自投罗网。