虹桥医链在经历军团冲击后满目疮痍，破损的符文如同结痂的伤口，在宇宙星空中泛着微弱的光。林婉与秦逸强撑着疲惫的身躯，着手修复防御系统。星孩婴儿安静下来，善恶双体的争斗暂时平息，可他眉心那抹若隐若现的紫痕，却像一道未解的谜题，令两人心中不安。
修复工作进行到关键阶段时，虹桥医链的核心数据库突然发出刺耳警报。大量未知数据疯狂涌入，解析后竟拼凑出一台散发着银白色光芒的仪器——时间透析仪。这台仪器的构造融合了仙医符文与未来科技，表面流转的纹路与审判者AI的代码如出一辙。
“这东西……透着邪性。”秦逸皱眉，灵力在指尖凝聚，随时准备应对突发状况。林婉却鬼使神差地走向仪器，晶化的右手不受控制地泛起微光，与仪器产生共鸣。当她的手触碰到仪器表面的瞬间，一道强烈的光芒将两人吞噬。
意识在时间洪流中翻滚，林婉和秦逸眼前浮现出一幅幅支离破碎的画面。荒芜的宇宙中，漂浮着无数文明的残骸；虹桥医链沦为废墟，上面布满了归墟能量腐蚀的痕迹。而最令林婉崩溃的，是她看到自己手持“罪孽针”，将其狠狠刺入星孩婴儿的胸口。星孩婴儿那充满信任与不解的眼神，如同一把利刃，剜着她的心。
“不！这不可能！”林婉在意识空间中嘶吼，泪水不受控制地滑落。秦逸紧紧握住她的手，试图用体温驱散这冰冷的绝望：“这只是一种可能，未来并非不可改变。”可话音未落，画面突然切换，他们看到秦青鸾残识带领着更庞大的军团，那些傀儡的身体上流淌着与星孩婴儿恶体同源的黑色能量。
就在两人震惊之际，时间透析仪突然失控，将他们抛入一个时间错乱的空间。这里的时间法则完全失效，过去、现在与未来的片段交织在一起。林婉看到年轻时的自己在仙级村为村民治病，脸上洋溢着纯粹的笑容；又看到秦逸满头白发，独自守护着一座荒废的医馆。而在这些画面的缝隙中，一个神秘人始终在暗中观察，他手中握着一块刻有“秦天明”字样的怀表。
秦逸在混乱中努力保持清醒，他发现每当时间片段切换，仪器的核心处就会闪过一道微弱的蓝光。凭借着对仙医阵法的精通，他判断这是有人故意篡改了时间画面。“林婉，我们得找到仪器的控制中枢，这些画面被人动了手脚！”他大喊道，声音在扭曲的时空中回荡。
两人艰难地在时间碎片中穿梭，躲避着突然出现的时间乱流。林婉的晶化右手在混乱中意外触碰到一块特殊的记忆晶体，里面封存着初代道侣最后的意识碎片。碎片中，初代道侣在意识彻底扭曲前，将一个重要信息刻在了时间的缝隙里——“当心观察者，他们在改写命运”。
就在他们即将接近控制中枢时，星孩婴儿的恶体突然出现。他周身环绕着黑色雾气，嘴角挂着嘲讽的笑容：“你们以为能对抗命运？太天真了。”恶体挥手间，无数时间幻影向他们袭来，这些幻影都是两人最恐惧的场景具象化。林婉再次看到自己杀害星孩的画面，而秦逸则陷入了不断失去林婉的循环。
“不能被幻象迷惑！”林婉咬破舌尖，用疼痛保持清醒。她想起秦青鸾曾说过，医者的信念是最强大的武器。她凝聚全身灵力，大声念出《大医精诚》的篇章，纯净的光芒从她口中迸发，驱散了部分幻影。秦逸也随之醒悟，施展仙医秘术，与林婉并肩作战。
在激烈的对抗中，星孩婴儿的善体突然苏醒，他的出现带来了一丝转机。善体与恶体在时间乱流中展开激战，林婉和秦逸趁机突破防线，终于抵达时间透析仪的控制中枢。然而，当他们准备修正时间数据时，中枢系统却弹出一条警告：“修正时间将引发时空悖论，后果自负。”
此时，外界的虹桥医链正遭受新一轮的危机。归墟之地再次传来异动，秦青鸾残识的声音响彻整个宇宙：“林婉，秦逸，准备好迎接真正的末日吧！”而在时间透析仪的深处，那个神秘的观察者身影越发清晰，他转动怀表，嘴角上扬，似乎在期待着一场好戏的开场。林婉和秦逸望着手中的控制中枢，面临着艰难的抉择：他们能否在不引发灾难的前提下，改写注定悲剧的未来？而星孩婴儿的善恶双体之争，又将走向何方？