时空漩涡的引力如无形巨手，将当归舰与秦逸的时空分身尽数攥入核心。星孩的全息键盘迸发出刺目红光，监测系统疯狂闪烁：“漩涡内部存在三个重叠的时间维度，我们的物理法则正在失效！”舰体的经络核心发出不堪重负的嗡鸣，红金色的能量光带扭曲成螺旋状，逐渐被暗熵染成诡异的紫色。
秦逸的医道圣印剧烈发烫，金色纹路与暗熵漩涡产生共鸣，脑海中不断闪现初代医仙与熵医并肩作战的记忆残片。混沌针在他手中疯狂震颤，黑白光芒被拉扯成细长的丝线，试图与第三块明心玉简建立连接。黑袍分身的虚影突然出现在他身后，手中的暗熵混沌针抵住他的后心：“放弃抵抗吧，秦逸。在这时间的夹缝中，所有的挣扎都是徒劳。”
林婉残留的意识化作金色锁链，缠住黑袍分身的手臂：“小逸，还记得青鸾星的‘溯本求源’之术吗？顺着时间逆流，找到暗熵侵蚀熵医的节点！”少年猛然惊醒，将基因共鸣注入混沌针，以自身为引，强行逆转时空漩涡的引力。当黑白光芒触及漩涡核心，时间流速骤然减缓，秦逸的意识如离弦之箭，穿梭在破碎的时间片段中。
他看到上古时期，熵医与初代医仙共同研究混沌针，试图用它调节宇宙的能量平衡。然而在一次实验中，暗熵突然从时空裂隙中渗出，如附骨之疽般侵蚀熵医的意识。那个被篡改的历史——熵医妄图用熵能重塑宇宙，不过是暗熵为了掩盖自身存在编织的谎言。“原来暗熵才是一切的始作俑者...”秦逸低语，手中的混沌针光芒大盛。
现实战场中，秦青鸾驾驶针灸舟在乱流中艰难前行，舰体表面的针灸铜人图腾开始剥落，露出底下被腐蚀的金属。她锁定第三块玉简的位置，准备发动针灸跃迁，却发现跃迁坐标不断被暗熵改写。“这样下去不行！”女船长咬牙，将自身的灵能注入导航系统，强行稳定坐标。
星孩在主控室发现关键线索：“漩涡的旋转频率与《黄帝内经》的‘子午流注’理论吻合！只要在特定时辰发动攻击，就能...”话未说完，当归舰的经络核心突然过载，能量防护罩应声破碎。暗熵触手如潮水般涌入舰内，船员们的皮肤下浮现出黑色纹路，意识逐渐被暗熵操控。
秦逸的意识及时回归，挥动混沌针斩开暗熵触手。他将两块明心玉简高举，玉简散发出的银蓝色光芒与混沌针的黑白光芒交融，在虚空中勾勒出《黄帝内经》的完整经络图。“以我为穴，以针为引，行针！”少年怒吼，基因共鸣与经络图产生共振，金色光芒顺着时空漩涡的纹路逆向传导。
当光芒触及第三块玉简，玉简表面的暗熵雾气开始崩解。黑袍分身发出绝望的嘶吼，身体逐渐透明：“不可能...暗熵的布局万无一失！”秦逸趁机抓住玉简，三块玉简相互吸引，自动拼接成更大的残卷。残卷上浮现出对抗暗熵的终极阵法——“乾坤回春阵”，但启动阵法需要集齐七块玉简，并找到传说中的“医道本源之火”。
时空漩涡在阵法的冲击下开始崩塌，秦逸等人拼尽全力冲出漩涡。当归舰的引擎冒着浓烟，勉强启动跃迁系统。但在离开的刹那，秦逸回头望去，漩涡深处似乎有一双巨大的眼睛在凝视着他们，那眼神中充满了暗熵的冰冷与疯狂。星孩的监测系统突然响起刺耳警报：“检测到其他明心玉简的微弱信号，最近的一块...在寒武纪时期的地球！”
林婉的意识在消散前留下最后一丝波动：“寒武纪的地球，是生命大爆发的关键节点，暗熵必然在那里设下了重重陷阱...小逸，万事小心。”秦逸握紧手中的玉简，混沌针的光芒再次亮起：“无论前方有多少艰难险阻，我都会集齐玉简，彻底终结暗熵的威胁。”当归舰的跃迁光芒划破星空，朝着寒武纪的地球疾驰而去，一场跨越时空的终极对决，即将拉开帷幕。