虚相侵蚀的阴霾尚未散尽，宇宙文明的认知根基便遭遇前所未有的冲击。阿雷克斯的机械联邦发现，所有智能系统开始自我否定基础逻辑——超算主机不断重复“1+1≠2”的错误运算，导航系统将前后左右的概念彻底颠倒；莱娅的灵羽族圣地，古老的语言体系瞬间崩溃，文字符号扭曲成无意义的线条，先知们的预言能力彻底失效，只能发出无法理解的呓语。全宇宙生命体的思维开始混乱，连“我是谁”“世界是什么”的基本认知都变得模糊不清。
苏尘与洛瑶的力量在认知风暴中濒临瓦解。苏尘的混沌之力失去了方向性，每次释放都会引发空间的逻辑混乱，物体开始违背惯性定律随意移动；洛瑶的星光之力分裂成无数矛盾的属性，治愈与毁灭、生长与腐朽的力量同时迸发，连她自己都无法掌控。两人的意识被抛入一片由破碎认知构成的混沌空间，这里漂浮着扭曲的概念碎片，“上”与“下”、“生”与“死”的界限荡然无存，中央悬浮着一个由乱码组成的巨大头颅，发出刺耳的电子音：“当认知不复存在，一切都将失去意义。”
银河守望者联盟的舰队在执行任务时陷入认知灾难。战舰的武器系统无法分辨“敌”与“友”，随机向任何目标发动攻击；船员们的神经接驳装置播放着混乱的感官信息，有人感觉自己身处火焰却并未灼伤，有人听见无声的呐喊。薇尔莉特带领的特遣队装备了“认知稳定器”，试图重建思维秩序，却发现装置反而加速了认知崩解，队员们的意识逐渐分裂成多个相互矛盾的个体。
莱娅发动灵羽族最后的禁术“万识共鸣”，以燃烧全族灵魂为代价，揭开这场危机的真相。在宇宙诞生之初，十二工匠创造了维系认知稳定的“理序中枢”，但随着文明发展带来的认知冲突不断累积，中枢核心被“惑识之主”侵蚀。这个由所有文明困惑、迷茫与错误认知聚合而成的存在，认为现有的认知体系是对宇宙真理的亵渎，唯有让一切认知崩解，才能迎来“真正的觉醒”。
阿雷克斯带领科研团队启动“认知重构工程”，在各个星域建造巨型“理序灯塔”。他们试图用量子算法重新定义基础概念，用灵羽族的古老咒文修补破碎的认知网络。然而，惑识之主不断制造新的认知悖论，灯塔的能量输出反而加剧了混乱，咒文也被扭曲成瓦解思维的指令。普通星球上，居民们陷入集体疯狂，有人坚信自己是一颗恒星，有人将石头当作亲人，整个社会秩序彻底崩塌。
苏尘与洛瑶在混沌空间中艰难前行，每一步都要对抗来自灵魂深处的认知崩塌。他们遭遇由混乱认知具象化的怪物：能扭曲逻辑的诡辩之魔、篡改记忆的虚妄巨眼、将概念随意重组的混沌之影。惑识之主在乱码头颅中发出狂笑：“你们的坚持不过是认知的囚徒！”两人在不断崩溃的思维中相互支撑，终于意识到：真正的认知力量，源于对“未知”的包容与对“探索”的坚持。
关键时刻，全宇宙文明将对“理性”的信仰与对“秩序”的渴望注入两人意识。苏尘与洛瑶将混沌之力、星光之力与文明意志融合，形成能重塑认知的“明悟之光”。当光芒照亮混沌空间，破碎的概念开始重组，惑识之主的身体崩解成无数光点。战后，创生之树生长出“认知根系”，自动监测并修复思维异常。但在宇宙最隐秘的角落，惑识之主的残念仍在凝聚，等待着以更致命的方式，再次摧毁文明的认知根基……