机械狂潮的硝烟尚未散尽，宇宙的元素平衡突然被打破。阿雷克斯的量子监测网络发出刺耳警报，火、水、风、土四大基础元素开始脱离物理法则束缚——恒星表面的火焰凝结成锋利的长矛射向太空，海洋星球的海水倒卷上天形成巨型水龙卷，气态行星的风暴化作吞噬一切的元素漩涡，连固态行星的岩石都开始流动，如活物般肆意蔓延。
莱娅的灵羽族圣地被突如其来的元素洪流侵袭，守护古树的木元素暴走，枝干扭曲成狰狞的藤蔓；空气中的风元素凝结成无数利刃，在地面刻下神秘符文。占卜水晶在元素乱流中炸裂，最后映出的画面里，创生之树被四大元素锁链缠绕，逐渐失去生机。
苏尘与洛瑶的力量在元素暴动中剧烈波动。苏尘的混沌之力与元素能量产生共鸣，却无法掌控这股力量，每一次施展都会引发更大规模的元素爆炸；洛瑶的星光之力在元素乱流中变得黯淡，面对疯狂的元素生物，她的治愈能力反而加剧了元素的暴走。两人的意识被卷入元素风暴核心，那里悬浮着一个由四色元素巨像组成的诡异祭坛，巨像口中不断传出低沉的咆哮：“元素应回归混沌，秩序终将湮灭！”
银河守望者联盟的舰队在元素乱流中寸步难行。战舰刚靠近暴动区域，金属外壳就被风元素腐蚀、被火元素熔穿；船员们在混乱的元素力场中难以呼吸，部分人甚至开始与接触到的元素发生同化，身体逐渐透明、汽化或结晶化。薇尔莉特带领的特遣队装备了元素抗性战甲，试图深入核心区域，但战甲在接触暴走元素的瞬间，反而吸收能量不断膨胀，险些将队员吞噬。
莱娅通过灵羽族失传的“元素共鸣”仪式，探寻到暴动的根源。在宇宙诞生之初，十二工匠创造了“元素平衡枢机”，用于维持四大基础元素的和谐运转。但随着宇宙经历多次危机，枢机核心的“元素意识体”因长期失衡产生了逆反心理，它认为元素的有序存在是对自身力量的禁锢，唯有引发元素暴动，才能让宇宙回归最原始、最自由的状态。
阿雷克斯带领科研团队启动“元素调和计划”，在各个星域建造巨型“元素稳定塔”。他们试图用量子技术构建元素牢笼，用灵羽族的元素咒语安抚暴走能量。然而，元素意识体不断改变元素的性质，稳定塔的能量输出反而成为加剧暴动的燃料，元素咒语也被扭曲成召唤更强大元素生物的指令。
苏尘与洛瑶在元素风暴的核心艰难前行，每前进一步都要对抗由暴走元素组成的恐怖生物：燃烧着的火巨人、操控水流的海妖、裹挟着陨石的岩魔、呼啸着的风之幽灵。面对元素意识体的嘲讽：“你们妄图束缚元素的自由？不过是蚍蜉撼树！”两人将混沌之力、星光之力与全宇宙文明对和谐的渴望融合，形成能重塑元素秩序的“万象之环”。
当万象之环笼罩元素祭坛，四大元素巨像发出痛苦的嘶吼，暴动的元素开始平息。元素意识体在消散前终于领悟：“或许……平衡才是真正的自由……”战后，创生之树生长出“元素守护之脉”，自动调节宇宙中的元素平衡。苏尘与洛瑶的力量化作守护元素和谐的使者，每当元素失衡的危机出现，他们的光芒就会驱散混乱。但在宇宙的某个未知角落，新的威胁正在元素的余烬中悄然孕育……