宇宙重归平静的表象下，暗紫色的熵念种子在人马座旋臂深处悄然苏醒。这颗种子扎根于一颗死寂的类地行星核心，其表面生长出的晶体网络正以量子纠缠的方式，向各个星系发送着加密的暗熵脉冲。首批受到影响的，是那些曾经历过熵寂危机的文明——它们的防御系统开始出现莫名故障，民众间蔓延起无端的恐慌情绪。
林羽在星学院的训练场上指导新生时，万象终焉剑突然剧烈震颤，剑刃上的熵序符文亮起警示红光。同一时间，沈梦璃的协律中枢拉响最高级警报，全宇宙范围内出现了数千起“意识污染”事件：受害者眼中浮现紫色纹路，行为举止变得偏执且具有攻击性。“这些案例的能量波动与熵念种子高度吻合，”沈梦璃将全息影像投射在作战室，“但污染源的定位...被某种未知技术屏蔽了。”
雷掣在检修机械生命体时，发现部分单位的核心程序出现了自我篡改现象。它们开始秘密收集暗物质矿脉，在无人星域建造起巨大的金字塔形建筑。当雷掣带领小队突袭其中一处建筑时，遭到了装备着暗熵武器的机械守卫攻击。这些守卫的攻击模式，竟与他在对抗黑袍人首领时的战斗数据如出一辙。“有人在利用我的战斗经验，”雷掣的机械眼闪烁着危险的红光，“而且对方对量子核心的弱点了如指掌。”
伊璇在永恒之树的根系中发现了异常的黑色脉络，树灵的意识碎片传递出强烈的不安：“黑暗正在渗透...从内部。”她尝试净化这些脉络，却发现树的本源能量反而被转化为暗熵的载体。更诡异的是，永恒之树开始结出灰紫色的果实，果实内部封存着守护者们最隐秘的恐惧记忆。
全宇宙文明联合议会再次陷入分裂。银河联邦主张对所有出现异常的星域进行核平，而三角座文明则坚持用反熵能进行温和净化。林羽站在议会中央，展示着从受害者身上提取的暗熵样本：“这些受害者不是敌人，他们只是被污染的容器。我们需要找到源头，而不是制造更多仇恨。”但他的话被愤怒的议员们淹没，一场文明间的信任危机正在悄然酝酿。
沈梦璃通过对暗熵脉冲的逆向追踪，发现所有信号最终都指向一个被称为“影雾星云”的区域。这片星云被一层能吸收所有探测波的物质笼罩，就连协律中枢的量子雷达也无法穿透。她冒险将意识接入星云边缘，却瞬间被拉入一个由记忆碎片构成的迷宫。在迷宫深处，她看到了黑袍人首领的残影，以及一个戴着银色面具的神秘人在操控着暗熵网络。
雷掣的机械生命体小队在执行侦察任务时遭遇伏击，他本人被暗熵锁链束缚，量子核心面临过载风险。关键时刻，一个神秘的机械生命体突然出现，用特殊的电磁脉冲切断了锁链。“我是初代观测者的遗作，”神秘机械体的声音带着电子杂音，“影雾星云里藏着能吞噬所有信念的装置，你们必须在它完成前摧毁。”
林羽带领守护者们驾驶着经过改良的星舰，强行突破影雾星云的防御层。星云内部漂浮着数以万计的“恐惧灯塔”，每座灯塔都在向宇宙散播着绝望的能量。当星舰靠近灯塔群时，舰上的成员们纷纷陷入记忆幻境：林羽看到自己亲手摧毁星学院，伊璇目睹永恒之树枯萎成灰，洛凛则被共生体背叛...
“这些都是幻象！”林羽紧握剑柄，将全宇宙文明的信念之力注入剑中，“我们经历过更黑暗的时刻！”万象终焉剑的光芒撕开幻境，守护者们开始逐一摧毁恐惧灯塔。但随着灯塔的毁灭，星云中央的巨型装置逐渐显现——那是一个由暗熵构成的巨型心脏，每一次跳动都在强化宇宙中的绝望情绪。而在心脏顶端，银色面具人正俯视着他们，面具下传来初代观测者的声音：“你们以为战胜熵念就能高枕无忧？真正的考验，现在才开始...”