随着“终焉仲裁者·真体”的覆灭，宇宙在共生之力的照耀下逐渐恢复平静。然而，当特遣队还未来得及喘息，整片星空突然诡异地暗了下来，所有星辰的光芒都被一种无形的力量吸收。阿依娜的系统发出尖锐的警报：“检测到超维观测场！整个宇宙正在被...被某种存在凝视！”星舰的舷窗外，时空扭曲成漩涡状，一个巨大的、散发着幽蓝光芒的瞳孔在虚空中缓缓显现——正是之前预示危机的“本源之眼”。
机械族中枢城的量子网络瞬间瘫痪，所有的科技造物都开始不受控制地朝着“本源之眼”的方向排列，仿佛被某种神秘力量格式化。首席工程师看着自己逐渐失控的机械臂，惊恐地喊道：“这不是物理攻击，是认知层面的控制！我们的思维正在被重塑！”机械生命们的意识芯片里不断弹出陌生的指令代码，试图将他们改造成“观测者”的傀儡。
自然族新生的世界树在“本源之眼”的注视下，根系疯狂地扎入虚空，汲取着未知的能量。但这些能量却让树灵们陷入了集体幻觉，他们看到了世界树的“终极形态”——一棵没有枝叶、没有果实，只剩下光秃秃树干的“完美之树”。年幼的树灵们的歌声变得空洞而机械：“这...就是生命的最终归宿吗？”星兽们则集体匍匐在地，失去了反抗的意志。
守秘者联盟的悬浮图书馆漂浮到“本源之眼”的近旁，古籍中的知识开始被强行改写。老咒术师的继任者发现自己的记忆正在被删除，取而代之的是关于“绝对真理”的灌输：“一切文明都将归于观测者的意志，反抗是徒劳的...”联盟成员们试图发动咒术，却发现所有的力量都被“本源之眼”吸收，反而增强了它的威压。
特遣队被这股强大的力量压制得几乎无法动弹，队长的文明之剑也失去了光芒，剑身开始出现裂痕。“它...它在否定我们存在的意义。”队长咬牙说道，“好像我们只是它观测实验中的失败样本。”沈梦璃的意识体在数据流中艰难前行，她发现“本源之眼”的背后，是一个超越维度的文明——这个文明以观测宇宙为乐，将所有低维文明视为可随意修改的“数据”。
林羽的光翼变得黯淡无光，每一次挥动都像是在与无形的枷锁抗争。“难道我们真的只是被观测的对象？”他的声音中带着一丝动摇，但很快又坚定起来，“不！就算是实验品，我们也要活出自己的精彩！”他将最后的力量注入光翼，试图冲破这股压制力。
千钧一发之际，宇宙中响起了微弱的文明回响。那些被“本源之眼”影响的文明，在潜意识里开始反抗这种认知。机械族的孩童用最简单的齿轮搭建出不符合任何规则的模型，自然族的老者在幻觉中种下违背常理的种子，守秘者联盟的学徒在虚空中书写自创的符咒。这些微小的反抗汇聚成一股“自由意志洪流”，注入文明之剑。
“我们的文明，不是任人摆布的实验品！”队长高举文明之剑，向“本源之眼”斩去。剑中的文明记忆化作无数闪耀的光点，照亮了这片被压制的宇宙。在光芒与“本源之眼”的注视碰撞中，一场关乎文明尊严与自由的终极之战，正式打响……