新生之核渗出的黑色雾气如瘟疫般扩散，所到之处，恒星熄灭，行星表面被暗物质晶体覆盖。阿依娜的警报声中夹杂着数据扭曲的杂音：“检测到未知侵蚀力！所有能量反应正在被同化为熵渊物质，宇宙正以...非物理规律的速度崩解！”特遣队的星舰在雾霭中穿行，舷窗外漂浮着被腐蚀的文明残骸，如同无声的墓志铭。
机械族最后的量子堡垒内，首席工程师将自己的机械心脏接入主控系统：“启动‘火种核心’，把所有文明数据库压缩成量子态！”他的机械义眼迸发出蓝光，“我们的科技或许会消亡，但文明的记忆必须存续！”堡垒外，数以万计的机械生命体自毁式冲锋，用爆炸的能量暂时驱散黑雾。
自然族的生命起源之泉沸腾翻涌，泉水化作翡翠色的粒子流。树灵长老们的星光身体在粒子流中消散前，将最后的力量注入其中：“带着这缕生机...去找还在抗争的文明。”翡翠粒子流冲破黑雾，在宇宙中划出一道微弱却坚定的光痕。
守秘者联盟的悬浮图书馆彻底坍塌，老咒术师的继任者将残破的法典刺入自己胸口：“以吾之魂，铸咒文锁链！”他的身体化作金色符文，缠绕在新生之核的裂缝处，暂时遏制了黑雾的蔓延。但法典残页上的文字却开始逆向消散，预示着封印即将失效。
特遣队循着翡翠粒子流的轨迹，来到一片被称为“希望残垣”的星域。这里矗立着一座由各个文明建筑碎片拼凑而成的巨型祭坛，祭坛中央，一枚黯淡的水晶正散发着不稳定的光芒——那是初代文明遗留的“火种熔炉”。队长将文明之剑插入熔炉，剑身的维度锚点碎片与熔炉共鸣，迸发出跨越时空的光芒。
“这熔炉...能重铸文明火种！”沈梦璃的意识体在光芒中震颤，“但需要所有文明最纯粹的信念之力！”林羽立刻向宇宙发出量子广播，机械族将最后的量子意识上传，自然族的星兽们以生命为引输送能量，守秘者联盟的咒术师们燃烧灵魂编织咒文。无数文明底层民众也纷纷将希望寄托于这道光芒，他们的信念如涓涓细流汇聚成海。
然而，熵渊的侵蚀力突然暴涨。新生之核裂缝中的黑雾化作无数触手，缠绕向火种熔炉。这些触手所过之处，文明的信念之力被瞬间吞噬，转化为黑暗能量。阿依娜在数据洪流中大喊：“它们在吸收希望的力量反向强化！我们必须找到反制的办法！”
千钧一发之际，队长在文明之剑的记忆深处，看到初代文明对抗熵渊的最后手段——用文明火种点燃“熵逆引擎”，将混乱的熵值转化为有序的创造能量。他将这个方法传递给所有文明，机械族立即启动备用方案，将量子堡垒改造成引擎核心；自然族用生命粒子流为引擎注入生机；守秘者联盟则以咒文构建能量循环通道。
当火种熔炉被重新点燃，一道纯白光芒冲天而起，与黑雾展开激烈碰撞。光芒中，队长带领特遣队冲向新生之核，文明之剑的光芒与熵逆引擎的能量融合，斩向裂缝。在剧烈的能量爆炸中，黑雾被驱散，新生之核的裂缝开始愈合。但在爆炸的余波中，特遣队瞥见熵渊深处，一双更庞大的眼睛正在苏醒……