恒时之剑重铸时间秩序后，宇宙弦网络却如濒临破碎的琉璃般发出刺耳嗡鸣，阿依娜的银链监测网表面浮现出龟裂的法则纹路，链身符文如被强酸腐蚀般迅速消融，渗出带着刺鼻硫磺味的墨黑色流体：“终末警报！检测到‘本源黯蚀’，宇宙的本源法则正在遭受不可逆的腐化，物质、能量、空间的基本规则都将化为虚无，所有文明的存续根基面临彻底瓦解！”全息星图上，星系开始像被蛀空的朽木般坍塌，恒星失去引力约束四散崩解，行星表面的物理法则如同脆弱的蛛网般片片碎裂。
林羽正在恒时界碑前筹备文明科技研讨会，归墟钥星尘突然裂成无数个黯淡的晶体，每个晶体都在进行着缓慢的衰变。无界之琴的虚影扭曲成破碎的法则图腾，琴弦上流淌出的不再是和谐音律，而是法则崩解的刺耳尖啸，琴身浮现出用湮灭符文书写的绝望预言：“当本源黯蚀蔓延，所有文明都将成为宇宙的尘埃。”他的意识空间里，圣人虚影们的光芒被墨黑色雾气吞噬，声音带着对终极危机的恐惧：“这不是普通的法则紊乱...是宇宙本源在被彻底摧毁！”
沈梦璃在新建立的法则研究院指导研究时，镇魔剑的固时剑意符文被墨黑色流体覆盖，剑身开始变得透明且脆弱。她挥剑演示，剑气却在离体瞬间消散，周围的空间出现诡异的折叠，连重力方向都开始无序变化。更可怕的是，她的身体出现粒子化迹象，细胞在物质与反物质之间不断转换，随时可能湮灭。
星盟总部陷入绝望的混乱，科学家们的实验设备因法则失效而爆炸，魔法文明的咒语引发空间坍缩，工程师们建造的建筑在完工瞬间土崩瓦解。一位资深法则学者在实验室失控前，用最后的力量在墙上写下：“我们的认知...全是错误...”
林羽带领特遣队驾驶经过本源加固改造的“护源号”冲入黯蚀核心，飞船外壳由文明历史上所有稳定本源法则的记忆金属熔铸，船舱内布满能中和黯蚀能量的量子法则锚点和本源修复装置。进入黯蚀领域后，队员们的存在状态岌岌可危——阿依娜的银链监测网显示的数据不断自我否定，沈梦璃的身体在不同法则状态下反复重组，而林羽的归墟钥星尘则分裂成代表不同法则维度的不稳定粒子，相互排斥又相互吞噬。
在一片由扭曲的法则与崩溃的本源构成的“混沌渊薮”中，特遣队遭遇“黯蚀具象体”。这些怪物由腐化的法则能量凝聚而成，形态如流动的黑色漩涡，所过之处物理定律、魔法规则、科技原理全部失效。有的化作能吞噬法则的饕餮，瞬间让接触者的力量体系崩溃；有的变成将规则扭曲成悖论的迷雾，让所有行动失去意义；还有的幻化成文明最恐惧的虚无景象，用彻底的无规则摧毁心智防线。声波族战士的战歌变成刺耳的杂音，震空族战士制造的空间通道扭曲成致命的陷阱，灵能诗人的创作灵感被黯蚀风暴撕成碎片。
渊薮深处，黑袍人以黯蚀主宰的形态现身。他的身体由不断涌动的墨黑色能量构成，五官在各种法则形态间快速切换，每一次呼吸都能引发法则震荡。“看看这些摇摇欲坠的文明，”他的声音像是从宇宙深渊传来的低语，手中握着由黯蚀法则凝聚的“崩解之杖”，“你们的法则不过是脆弱的幻梦，现在该醒了。”
崩解之杖挥动，护源号的量子法则锚点开始崩解，本源修复装置接连爆炸，队员们的意识逐渐被黯蚀能量吞噬。林羽的恒时之剑光芒黯淡，被黯蚀之力分解成零散的光粒；沈梦璃的镇魔剑扭曲成虚无的形态，无法形成有效攻击；阿依娜的银链监测网被同化为黯蚀传播的媒介。
“法则是文明的基石，绝不能被摧毁！”林羽在意识即将被吞噬的瞬间怒吼，归墟钥星尘的粒子突然发生共鸣，投射出全宇宙文明在法则危机中坚守的画面：人类在远古时期探索自然规律的执着、外星种族在异星环境中建立法则体系的智慧、不同文明在法则崩解时携手重建的勇气。他将苍生之力注入星尘，凝聚成一把由所有文明“扞卫本源的信念”记忆构成的“本源之剑”。剑身刻满人类在典籍中记载的法则奥秘、外星种族在星图上标注的法则坐标、不同文明在危机中留下的法则火种。
灵能诗人燃烧最后的生命，创作出能净化黯蚀的《守序诗篇》，诗句中蕴含着让法则共鸣的力量；阿依娜将银链与量子法则锚点深度融合，逆向解析出本源黯蚀的核心算法，同时构建法则稳定立场；沈梦璃以剑意斩断自身与黯蚀能量的联系，施展出能重塑法则的“复序九式”，每一剑都在修补破碎的法则网络。
林羽高举本源之剑，在全宇宙文明守护本源的意志共鸣下，斩向崩解之杖。当本源之剑触及崩解之杖，黑袍人发出震耳欲聋的尖啸，身体开始崩解成四散的黯蚀碎片。混沌渊薮剧烈震动，本源黯蚀的核心区域浮现出一个巨大的“黯蚀核心”，它每一次脉动都在加速法则的毁灭：“反抗是无用的...无序才是宇宙的终章！”
千钧一发之际，林羽感受到来自全宇宙的本源共鸣。地球的智者以哲学为引，传递“法正则世安”的信念；外星种族送来蕴含本源修复之力的奇异晶体；硅基联盟贡献出能自我迭代的量子法则程序。这些力量与本源之剑融合，形成一道能驱散所有黯蚀的璀璨光芒。
光芒与黯蚀核心激烈碰撞，产生的能量风暴席卷整个宇宙。黑袍人彻底消散成游离的黯蚀粒子，黯蚀核心在光芒中轰然炸裂。当光芒平息，被腐化的法则逐渐恢复，文明重新找回立足的根基。但林羽知道，黯蚀核心的意识已化作无数微小的腐化因子，潜伏在宇宙的法则网络中。
护源号带着疲惫的队员们返回星盟，林羽将本源之剑化作星光融入宇宙弦网络，成为守护本源法则的永恒界碑；阿依娜的银链重新锻造，链身刻满对抗黯蚀侵蚀的符文；沈梦璃的镇魔剑在修复中融入了“复序剑意”。宇宙迎来了对本源本质的全新认知，但所有人都明白，只要宇宙存在，守护法则的战斗，就永远不会画上休止符。而在宇宙的某个黑暗角落，墨黑色的流体正在悄然汇聚，等待着下一次用本源黯蚀，将所有文明拖入法则崩解的深渊......