大西洋深处，陨石坠入的海域泛起诡异的幽蓝色光芒，冰冷的海水瞬间沸腾。在这片沸腾的水域下方，隐藏着一座被海藻与珊瑚覆盖的古老遗迹，建筑表面布满与陨石相同的神秘符文。当陨石触底的刹那，遗迹中央的祭坛亮起刺目的紫光，沉睡万年的“深海蛊母”缓缓睁开了布满复眼的头颅。
林羽等人刚从地核危机中缓过神，阿依娜的探测器便发出刺耳的警报：“全球海洋磁场异常！所有海底通讯光缆遭到不明力量干扰！”话音未落，世界各地的沿海城市传来噩耗——巨浪中浮现出无数由海洋生物变异而成的蛊兽，它们的身体上布满发光的蛊纹，所到之处，海水被染成毒紫色。
“这些蛊兽的气息...与堕星渊的暗物质如出一辙。”玄机子的青铜罗盘重新拼凑完成，却始终指向大西洋深处，“那里恐怕藏着比混沌蛊祖更古老的存在。”天机阁紧急启动“龙渊战船”，这艘由上古龙鳞与玄铁打造的战船，能在深海中自由穿梭。然而，当战船驶入陨石坠落海域，周围的海水突然变得粘稠如胶，无数形似章鱼的“噬魂蛊”吸附在船身，它们的触须不断腐蚀着龙鳞。
沈梦璃挥动镇魔剑，剑气在水中形成巨大的漩涡，将蛊虫卷入其中。但这些蛊虫被斩杀后竟化作毒雾，渗入战船的缝隙。阿依娜迅速施展巫祝净化咒，银链上的朱雀火焰在水中熊熊燃烧，暂时驱散了毒雾。林羽则将万象归墟钥插入甲板，五元素之力在水中形成防护罩，青色生长之力催生的海藻屏障，赤色创造之力凝聚的火焰漩涡，共同抵御着蛊虫的攻击。
随着战船深入，一座巨大的海底金字塔出现在众人眼前。金字塔表面的符文闪烁着幽光，与陨石上的纹路完美契合。当战船靠近时，金字塔突然裂开，一群身披鳞甲的“深海巫卫”冲出，他们手持由珊瑚与鱼骨制成的长矛，矛头滴落的毒液能瞬间腐蚀金属。天机阁弟子们纷纷祭出法器，有人抛出能召唤水龙的玉珠，有人挥动可冻结海水的冰扇，与巫卫展开激烈战斗。
林羽发现，这些巫卫的弱点在于眉心的紫色蛊核。他集中七情灯的力量，七色光芒凝聚成光箭，射向巫卫的蛊核。光箭击中的瞬间，巫卫的身体轰然炸裂，化作一团黑色烟雾。但更多的巫卫从金字塔中涌出，同时，金字塔顶端的祭坛上，深海蛊母开始吟唱古老的咒语，海水剧烈动荡，一只足有百米长的“深渊巨鲲”破水而出，它的眼中闪烁着蛊毒的幽光，张开的巨口足以吞下整艘战船。
“这是深海蛊母的本命蛊兽！”阿依娜大喊，“必须摧毁祭坛，打断它的施法！”沈梦璃脚踏七星步，御剑冲向金字塔。她在途中遭遇无数蛊鱼的攻击，这些蛊鱼的鳞片如同锋利的刀片，不断划伤她的皮肤。沈梦璃咬牙施展昆仑派禁术“天罚剑阵”，万千剑气组成的剑阵绞碎蛊鱼，终于接近祭坛。
与此同时，林羽与阿依娜合力对抗深渊巨鲲。林羽调动归墟钥的黑色死亡之力，形成黑洞般的漩涡，试图吞噬巨鲲的攻击；阿依娜则将银链化作巨网，缠绕住巨鲲的鳍。但巨鲲突然喷出紫色毒雾，毒雾中竟浮现出众人内心最恐惧的幻象。林羽看到昆仑派再次覆灭，阿依娜目睹族人被蛊母屠戮，两人的攻击节奏被彻底打乱。
千钧一发之际，玄机子带领天机阁众人组成“周天星斗大阵”，星辰之力化作锁链，暂时困住巨鲲。沈梦璃抓住机会，镇魔剑引动白虎之力，一剑斩向深海蛊母。蛊母发出尖锐的嘶鸣，身体开始崩解。但在它消散前，将最后一丝力量注入金字塔，金字塔爆发出强烈的紫光，海底遗迹开始下沉，同时，深海深处传来更强大的脉动，仿佛有什么远古存在正在苏醒……