这故事主角叫卢琴。在市立医院眼科手术台上，卢琴正给死刑犯顾远做角膜摘除手术。嘿，也不知道咋回事儿，一滴带着怨气的黑血“啪嗒”溅到她身上了。这事儿就像一颗小石子扔进了平静的湖面，谁也没想到后面会掀起多大的浪。
三天后，卢琴又给少女苏渺移植顾远的角膜。手术成功，大家正欢呼呢，苏渺突然扯着嗓子尖嚎：“我看见自己用手术刀割开了猫的喉咙！”这话一出来，把所有人都吓了一跳。当天夜里，卢琴左眼突然疼得厉害，她赶紧照镜子一瞧，好家伙，瞳孔里浮出了血丝，还凝成了倒吊人形，正是顾远被执行枪决的瞬间，就跟放电影似的。
没多久，苏渺又预见了新罪，说邻居老太的颅骨会被钝器砸碎。卢琴赶紧跑去现场，一看，老人真就倒毙在门前，凶器是沾血的石雕观音像，跟苏渺描述的一模一样。这时候卢琴左眼疼得更厉害了，视野里还出现了新预告，她看见自己双手扼住养母脖颈的剪影。她这才惊恐地发现，所有预见的都是移植者“将犯之罪”，顾远的怨灵正通过罪瞳操控宿主的恶念呢。
为了追查顾远死因，卢琴偷偷潜入法医档案室。从那泛黄的验尸报告里，她发现了惊人真相，原来顾远是被冤判奸杀案，真凶是富豪之子周衍。就在这时，她左眼突然剧痛，还看见自己把绳索套在枯井中女尸的脖颈上，那女尸穿的连衣裙还是她昨天刚买的。她赶紧跑到城郊枯井，那腐臭味儿一飘出来，就瞧见那具尸体躺在那儿，颈间麻绳的结扣方式跟她惯用的手法一模一样，吓得她头发都竖起来了。
之后啊，罪瞳预兆越来越频繁，便利店店员被冰锥刺穿眼球、孤儿院孩童误食毒糖果，卢琴拼命去阻止，可每次都晚了一步。有个暴雨夜，她左眼又映出自己持刀捅向警察的画面，刀柄上还刻着她的名字。她在赶往警局的路上，血雨里浮现出数百个顾远的虚影，那些虚影还嘶吼着：“你每阻止一次罪孽，就替我背负一分怨气！”
卢琴在顾远旧居挖出了陪葬的青铜眼形匣，匣内血书记载着，含冤而死者若把眼角膜移植给活人，就能借宿主所犯新罪凝聚怨力重生。匣底还压着半张古符，符纹跟卢琴手臂自残的抓痕一模一样。当天夜里，苏渺冲进钟表店，用齿轮剜出店主眼球，罪瞳预见的画面彻底应验了。
顾远怨灵在月光下显形，对卢琴说：“你以为在救人？那些凶案都是因为你干涉才发生的！”原来卢琴每阻止一次预见的罪行，就会引发更残酷的新罪。她救下的便利店店员其实是虐猫凶手，警察还曾受贿掩盖周衍的罪行。青铜匣吸饱怨气裂开，露出顾远被剥皮的双目，跟卢琴的罪瞳共振搏动。
卢琴被罪瞳操控，拿着刀逼近养母。千钧一发之际，她一咬牙，把手术刀刺进了左眼！鲜血“噗”地喷溅出来，顾远的怨念暂时退去了。养母颤抖着交出遗书，原来当年她为了钱作伪证指认顾远，而卢琴移植的角膜本属于顾远的盲眼妹妹，她也是真凶周衍的最后一个受害者。
左眼失明的卢琴跑到周家别墅，嘿，罪瞳居然在右眼重生了。她预见自己用青铜匣砸碎周衍颅骨，还发现周衍生母与顾远妹妹相貌相同。原来当年周父强奸顾母生下双胞胎，妹妹被弃孤儿院，周衍为了掩盖血缘秘密连环杀人。顾远怨灵狂笑说：“我要你亲手断绝这肮脏血脉！”
当卢琴被操控着高举青铜匣砸向周衍时，她瞥见镜中自己七窍流血。她知道，这罪要是成了，她就会成为顾远复活的躯壳。于是她一狠心，反手把手术刀捅进右眼，两颗血淋淋的眼球掉进青铜匣。顾远怨灵在匣中尖啸：“你竟敢…”话还没说完呢，卢琴摸索着点燃符纸丢进匣内。
焚烧的青铜匣喷出黑烟，凝成顾远兄妹的虚影。妹妹盲眼淌下血泪，说：“哥哥停手吧…”顾远怨气消散前，把残余力量注入卢琴空洞的眼窝。三个月后，盲眼的卢琴在孤儿院种下向日葵，孩子们围着她嬉闹。微风一吹，她仿佛“看见”金色花盘上浮动的光斑，那是顾远兄妹最后的忏悔。