大会上，500多名在战斗中被俘的人类民兵被公开释放。他们满脸惊讶与感激，眼中还带着一丝劫后余生的庆幸，相互搀扶着，缓缓离开了。而柳清清和龚永驰，这两个罪大恶极之人，被判处死刑，缓刑一年执行。当被释放的人类民兵三三两两归队后，消息如同野火般迅速在人类阵营中蔓延开来。人类的整个战线都动摇了，他们得到了这样的信息：战斗中被俘并不可怕，只要不做殊死抵抗，就能被宽大处理，留一条生路；但若是负隅顽抗，就会被颜色战士们毫不留情地杀掉。
整条战线的人类战士的意志瞬间崩溃了。他们本以为凭借着整体战力的绝对优势，能够给颜色战士致命一击，可结果呢？仅仅抓到了一些掉队的颜色战士，而自己被俘的人员回归后，带来的却是如此令人沮丧的消息。他们的士气一落千丈，眼神中满是迷茫与恐惧。
就在颜色战士们在夜色中悄悄向回奔袭的当晚，李开山的前敌总指挥职务被解除了。新上任的总指挥，雷厉风行地将李开山抓起来，安排押解回人类总指挥部基地后，便匆匆走马上任。整个过程干脆利落，人类阵营内部也陷入了一阵不小的动荡。
内奸被成功捉住了，人类最后的主力又被王鸿飞吸引到了千里之外，而且数万人散落在长达几百公里的沿线，一时之间，人类根本没有能力威胁到这支拥有一万七千颜色战士的庞大队伍。
但为了隐蔽自己的意图，颜色战士指挥部决定，当晚十点开始渡过黄河，凌晨两点前必须离开城区。只留下郑州和十几名战士潜伏在黄河大桥旁等候绿色中队。此时，庞大的队伍面临着一个巨大的威胁——物资与食物。没有吃的，战士们将再次陷入困境，甚至可能溃散，无奈地进入城市任人宰割。不过，无尽的山脉，如同一位宽厚的守护者，给颜色战士提供了庇护。
颜色战士的庞大队伍，在曲折蜿蜒的太行山上艰难穿行。因为没有了追兵，前进的速度慢了许多。山路崎岖，怪石嶙峋，战士们小心翼翼地前行，直到入夜时分，队伍才勉强进入了一个叫紫金山的地方。庞大的社区早已人去楼空，一片死寂。经过数场激战的部落，谨慎地派出五百多个明暗哨位后，第一次无忧无虑地进行了休整。回顾这十几天的战斗和周旋，虽然队伍发展到了一万七千人，但一路阵亡走失的颜色战士高达四千多人，还损失了秦义与蒋宜辰两名高级指挥官，每一个数字背后都是一段沉痛的回忆。
颜色战士一连在山城小区休整了三天，直到郑州带着王宏飞与一路上三三两两收拢回来走散的五百多名低级颜色战士，沿着一路上留下的标记来到小区。刚刚安顿下来，所有指挥员便立刻召开了军事会议。王宏飞带着绿色中队以及配有AK47的两百名战士受命去c治城区接应之前派出去的拯救部队；叶若秋则带领美少女组合以及郑州带领的两百名持有AK47的颜色战士接应失去联络的J城城区拯救部队；张瑞暂时带领主力指挥官，带领全体颜色战士，开山造地，准备种粮。由于轰炸R本的百十颗h弹的烟雾久久不散，快进入十一月的天却没有一丝冬季到来的景象，依旧保持着每日二十多度的气温，仿佛时间都在这诡异的氛围中停滞了。
一切看起来那么平静，实际上却又是那么紧迫。开垦也好，节省也好，都避免不了半个月后断粮的事实，每一位指挥官都清楚，断粮远比几万丧尸的威胁大得多。但眼下最重要的是立刻把队伍整合完毕。
经过绿色中队两天的搜索，解救Z治城区的小队被从太行山大峡谷找了回来；经过五天的搜寻，J城城区的小队被从一个叫九女湖的湖泊旁找到了。两支小队经过多次战斗，将三千多名颜色战士带回了紫金山基地。面临只有七八天粮食的困局，紧急的最高会议再次召开了。
参加会议的指挥员们有叶若秋、王鸿飞、张杰、刘傲桀、张瑞、赵永胜、郑州、唐超、刘紫娟以及刚刚归队的刘越洋。刘梓洋因为伤势，秘密留在了人类城市中。经过大家的深度沟通，最终形成了新的编队。军团为了避免被人类一网打尽，分成了四部。由刘傲桀指挥第一部的六千人驻扎到沥山地区建立基地，由于距离人类主要城市超过一百公里，而且山路崎岖，进可攻、退可守的地形使队伍可以立于不败之地；张瑞为指挥官的第二部六千人去太行山大峡谷建立基地，依托那里的险恶地形，没有人敢于轻易进攻颜色战士；赵永胜则带领人数为八千人的第三部驻扎在紫金山基地，拒守开垦周围的耕地，守护着这最后的希望。
在一片略显昏暗的临时会议室里，烛火摇曳，映照着众人严肃的面庞。叶若秋身姿挺拔，眼神坚定，她带领着自己的美少女组合以及五十名青色战士，组建了最精锐的特种作战偷袭部——暗剑。暗剑的每一位成员都身手矫健，犹如夜空中最锋利的利刃，专门负责对敌人进行秘密潜入、暗杀、偷袭等针对有价值目标的特种打击行动。他们的训练残酷而严苛，常常在月黑风高之夜，模拟各种危险场景，只为在实战中能一击即中。
王鸿飞神情冷峻，他带领着自己的绿色中队，以及一百名紫色战士组成特种打击部——小刀。这支部队就像是一把隐藏在黑暗中的致命小刀，专门针对人类精英卫队的反制和高级丧尸的歼灭设计战术，避免未来作战中颜色军团在特战时吃亏。他们整日研究人类精英卫队的行动规律和高级丧尸的弱点，制定出一套又一套详细的作战方案。
张杰则率领一百五十名灰色战士组成了侦察部——变色龙。张杰的队员们个个如同敏捷的变色龙，擅长伪装与隐匿。他们的快速反应部队主要从事战前抵近侦察，和进入敌后侦察的工作。平时则担负总部安全警戒的工作，特殊情况下也可以进行高强度作战的事宜。无论是在茂密的丛林，还是在繁华的城市，他们都能悄无声息地获取关键情报。