在基地沉浸于发展的喜悦中时，【文明火种系统】突然发出红色警报：
【检测到机械神教的舰队正在向基地靠近，预计12小时后抵达。舰队规模庞大，拥有多种先进武器，包括能量脉冲炮和灵能干扰器。建议立即启动防御措施，并做好战斗准备！大事不好！机械神教的舰队气势汹汹地杀过来了，能量脉冲炮和灵能干扰器可不是闹着玩的，大家赶紧行动起来！(╯°□°）╯︵ ┻━┻ 】
云飞得知消息后，立刻召集苏墨、林九、白璃等人商议对策。
苏墨瞳孔中数据流闪烁，迅速分析道：“机械神教此次来势汹汹，他们的能量脉冲炮威力巨大，灵能干扰器还能影响我们的科技设备和灵能护盾。但我们也有优势，如今基地人口已达人，忠诚度高，「信念真实伤害」能发挥强大作用，而且我们还有新解锁的灵能聚核熔炉。”
林九咬着棒棒糖，兴奋地说：“云哥，怕啥！来一个，我们打一个，来两个，我们打一双！正好试试我新练的灵能武技！”白璃则轻抚狐尾，眼神坚定：“我立刻联系妖族盟友，让他们前来支援。”
云飞沉思片刻后，下达命令：“苏墨，带领科研人员想办法破解灵能干扰器，加强灵能护盾；林九，组织灵能武者进行战前训练，准备迎敌；白璃，尽快联系妖族。我通过《子民名册》调动所有子民，加强基地防御工事。”众人领命而去。
此时，金色弹幕在云飞眼前疯狂滚动：
【新夏城居民甲】：云哥加油，一定要把机械神教打回去！
【新夏城灵能武者乙】：大家一起上，守护我们的家园！
【新夏城科研人员丙】：苏墨大神，就靠你破解干扰器啦！
在准备防御的过程中，【文明火种系统】不断提示：【因机械神教舰队逼近，子民们感受到危机，忠诚度提升至180%，「信念真实伤害」效果显着增强。但机械神教舰队实力强大，基地现有防御力量在正面交锋中可能处于劣势，需寻找破敌之策。】
云飞开启数据流义眼，观察基地的防御布局，思考着应对之法。他发现机械神教舰队的能量脉冲炮发射频率存在一定规律，若能抓住这个时机进行反击，或许能打乱他们的进攻节奏。
此时，白璃传来消息：“云哥，妖族盟友愿意支援，但他们距离较远，最快也要8小时才能赶到。我们必须在这段时间内尽量拖延机械神教的进攻。”云飞点了点头，心中有了计划。
随着时间的推移，机械神教的舰队出现在基地上空。一艘艘巨大的战舰散发着冰冷的金属光泽，舰身上闪烁着诡异的能量光芒。机械神教的首领通过扩音器大声喊道：“云飞，今天就是你和你基地的末日！你们的文明不过是对我们的拙劣模仿，乖乖投降，还能留你们一条活路！”
云飞站在基地城头，身后亿万虚影浮现，大声回应：“想要摧毁我们，那就尽管放马过来！我的子民，绝不屈服！”机械神教舰队率先发动攻击，一道道能量脉冲炮如雨点般射向基地。
【文明火种系统】提示：【灵能护盾遭受强力攻击，能量下降至80%。灵能干扰器启动，部分科技设备出现故障，灵能武器充能速度减慢。】
云飞指挥灵能武者们反击，灵能武者们施展出各种强大的灵能法术，与机械神教的攻击碰撞在一起，爆发出耀眼的光芒。林九更是一马当先，他激发全身灵能，施展出新练的灵能武技 “灵能风暴”，只见他手中长枪舞动，周围形成一个巨大的灵能漩涡，将敌人的攻击纷纷卷入其中。
那些被「信念真实伤害」击中的机械神教士兵，身体瞬间被一层金色光芒包裹，他们的机械装备发出“滋滋”的电流声，开始冒烟起火。士兵们痛苦地惨叫着，灵能在体内紊乱地涌动，战斗力瞬间丧失，纷纷倒地不起。在「信念真实伤害」的加持下，一些机械神教的士兵被击中后，身上的机械装备出现故障，战斗力大减。
然而，机械神教的攻击越来越猛烈，灵能护盾的能量持续下降。
【文明火种系统】提示：【灵能护盾能量降至50%，请尽快采取措施增强防御。若护盾破碎，基地将直接暴露在敌人攻击之下。】云飞开启《子民名册》，召唤出所有擅长防御的子民，他们汇聚灵能，为灵能护盾注入新的力量，暂时稳住了护盾。
苏墨带领科研人员全神贯注地操控量子计算机阵列。量子比特在芯片中以极高的速度进行复杂运算，不断模拟和分析灵能干扰器的信号频率。通过发射一系列精准的量子信号，与干扰器发出的干扰波产生共振，从而扰乱其干扰机制。在无数次的尝试后，终于成功破解，整个过程如同在量子的微观世界中进行一场精密的战斗。
【文明火种系统】提示：【成功破解灵能干扰器，科技设备恢复正常运行，灵能武器充能速度恢复。建议趁此机会发动反击。】云飞抓住机械神教能量脉冲炮发射的间隙，指挥众人发动反击。灵能武者们与基地的科技武器一起发动攻击，一时间，天空中光芒交错，爆炸声不断。
就在双方激战正酣时，【文明火种系统】提示：【检测到机械神教舰队正在启动一种强大的秘密武器，预计5分钟后完成充能。该武器威力巨大，可能对基地造成毁灭性打击，请尽快阻止！检测到机械神教秘密武器的能量波动与神秘徽章激活时的波动有微妙联系，这或许是破解武器的关键，但具体关联尚不明确，需谨慎探索。】
云飞深知情况危急，他决定带领一支精英小队潜入机械神教舰队，破坏他们的秘密武器。
在准备潜入行动时，苏墨和林九有了更多交流。苏墨：“林九，这次潜入行动危险重重，你一定要小心，我们需要紧密配合。”林九：“放心吧，苏墨，有我在，那些家伙别想拦住我们！”两人一边交流一边制定计划。
云飞迅速打开《子民名册》，一道光芒闪过，名册上不仅显示出擅长潜入和破坏的子民信息，还根据机械神教舰队的防御布局，为云飞推荐了最佳的潜入小队组合。王虎，擅长近战格斗，灵能防御力高达800，潜入时能应对突发状况，但他的灵能隐匿能力较弱；李瑶，精通灵能隐匿法术，可悄无声息地接近目标，不过她的战斗能力相对较弱……
【新夏日报】头条
《机械神教来袭，基地危在旦夕？》
《云飞冒险出击，能否力挽狂澜？》
【当前人口人（忠诚度180%），基地遭遇机械神教攻击，云飞带领众人抵抗，同时准备冒险破坏敌人秘密武器。下一阶段奖励为解锁全新灵能科技「灵能基因强化剂」，可使子民身体素质提升30%，且有几率觉醒特殊灵能天赋，需人口达到人解锁，当前进度76%。主角团队命运再次陷入未知，故事发展扣人心弦。】