转过头来的梅德菲斯，眼眶里那只有着三角形瞳孔金色米字纹路的噬星之眼冷漠毫无感情的注视着晴生。晴生被这只眼睛盯得头皮发麻，但是晴生鼓起勇气开始质问梅德菲斯，发生的一切是不是都是梅德菲斯的阴谋。见晴生质问就说明他已经开始怀疑一切，梅德菲斯觉得大势已成，也就没有丝毫隐瞒的告诉了晴生一切。
时间追溯到多年以前，当时梅德菲斯所属的艾克西夫文明凭借着其卓越的科技实力，建立起了一个先进的科技模型，通过这个模型，他们成功地预测出宇宙最终将因科技的过度发展而走向毁灭。面对如此严峻的未来，一部分人主张采取极端措施，即完全停止科技发展，以避免这场灾难的降临。
于是，艾克西夫文明将“停止科技发展”这一条件代入到预测模型之中，重新进行了一次预测。然而，令人震惊的是，这次预测的结果显示，即使停止科技发展，宇宙仍将因其他原因而面临毁灭。
面对这样的结果，艾克西夫文明陷入了深深的困惑和绝望。但他们并未轻易放弃，开始尝试将各种不同的因素代入预测模型，以寻找可能的解决方案。然而，无论他们如何努力，每次预测的结果都指向同一个结论：无论采取何种措施，宇宙终将不可避免地走向毁灭。
得知这一残酷事实后，整个艾克西夫文明陷入了极度的绝望与崩溃之中。他们曾对科技充满信心，但如今却发现自己无法改变宇宙的宿命。就在这时，虚空基多拉的出现给了他们一丝希望之光。
虚空基多拉诞生于艾克西夫文明母星上的异纬度里，当艾克西夫文明发现存在于异纬度的虚空基多拉的同时，虚空基多拉也发现了艾克西夫文明，但是虚空基多拉克服了毁灭艾克西夫的本能。
本应该毁灭驱逐文明的怪兽居然可以克服本能，这件事十分不可思议，原本艾克西夫文明因为对宇宙命运的绝望产生了浓厚的宗教氛围，想要以此获得精神寄托。可以克服本能的虚空基多拉的出现让艾克西夫文明有了现实存在的精神寄托对象，他们开始把虚空基多拉当做神来崇拜。
因为宇宙的尽头是毁灭，宇宙里所有的事物早晚都会毁灭，于是艾克西夫文明献祭了自己的母星，让虚空基多拉得到了极大的成长。虚空基多拉和一般的行星级怪兽不同，它不存在于现实的物质纬度，而是高纬度，不需要物质星球生存。艾克西夫文明的母星因为已经诞生了异纬度的虚空基多拉所以就不会诞生其他行星级怪兽。因此艾克西夫没有被作为大过滤器的行星级怪兽毁灭驱逐，反而发展出先进的科技正是因为虚空基多拉的特质。
因为在献祭母星后，虚空基多拉变强了很多。于是，认为反正宇宙里的一切都要因为这样那样的原因要毁灭的艾克西夫文明把让虚空基多拉变强大吞噬一切星球毁灭宇宙当做了自己的毕生追求。为了实现目标，艾克西夫文明分散全宇宙寻找可以孕育行星级怪兽的星球，催化行星级怪兽的诞生和成长，当行星级怪兽成熟后，艾克西夫就会召唤虚空基多拉降临，吃掉行星级怪兽和星球，获得实力提升。
梅德菲斯滔滔不绝地说着，话语如同潮水般涌入晴生的耳中。当晴生得知自己竟然成为了让虚空基多拉完全体降临的祭品，而那艘搭载着老年人的登陆舰爆炸也并非意外而是梅德菲斯的阴谋时，愤怒如火山喷发般涌上心头。他再也无法抑制内心的冲动，决定与梅德菲斯一决生死。
然而，梅德菲斯仅仅是用那只充满邪恶力量的噬星之眼凝视了一下晴生，后者便瞬间陷入了无尽的幻觉之中。在这恐怖的幻景中，晴生仿佛置身于一个扭曲、黑暗且充满绝望的世界里，无法自拔。
与此同时，行星哥斯拉正遭受着虚空基多拉三个龙首的疯狂撕咬，其体内的能量不断被吞噬。就在这危急时刻，洛亚的身影出现在战场上。他化身为一只两百米高的魔龙，全身覆盖着暗金色的鳞片，闪烁着神秘的光芒；粗壮精悍的双足支撑着庞大的身躯，每一步都带着震撼大地的力量；长长的尾巴如同鞭子一般横扫而过，凌厉无比；后腰处的触手缓缓游动，随时准备出击；水晶质感的锋利爪子和尾刃闪烁着寒光，轻易便能撕裂一切；三排锋利的粉紫色水晶质感珊瑚状背鳍高耸入云，散发出令人心悸的气息；可以收起的巨大华丽羽翼上点缀着粉紫色水晶，增添了几分优雅与威严；胸口有着结合冥王兽铠甲后与戴斯特洛伊亚胸口外骨相似的坚固骨甲，为其内脏提供了强大的防御能力；头部类似基多拉的头颅但额头上长有一根独角，这根独角和脑后的角转变成了水晶质感，透露出一种神秘而高贵的气质。
洛亚降临虚空基多拉虐杀行星哥斯拉的战场后没有犹豫，一发粉紫色原子吐息朝着梅德菲斯攻击而去。梅德菲斯和晴生所在的山头瞬间消失，连带着梅德菲斯眼眶里的噬星之眼也消失不见。撕咬吞食着行星哥斯拉能量的虚空基多拉原本明亮的身体突然变得黯淡。失去了噬星之眼帮助观测，虚空基多拉开始被本世界的物理法则捕获，仪器的屏幕上可以显示出虚空基多拉的身体可以被扫描观察了。
感觉到虚空基多拉萎了，行星哥斯拉可就精神了，行星哥斯拉开始发力，挣脱了虚空基多拉的撕咬禁锢。行星哥斯拉巨大的利爪抓住虚空基多拉的一个龙首的上下颌，使劲掰断。洛亚也没有客气，锋利的尾刃横扫配合来自新哥斯拉的放射线流，切断了虚空基多拉的一个龙首，然后抓住吞噬进了体内。行星哥斯拉挥舞利爪，打飞了虚空基多拉的最后一个龙首，而虚空基多拉的另外两个龙首，一个被洛亚切断吞噬，另一个早就因为被行星哥斯拉重创而消失。
行星哥斯拉发出一声怒吼，它庞大的身躯开始闪烁着蓝色的光芒，这是它正在蓄力荷电粒子炮的迹象。随着能量的不断聚集，荷电粒子炮的威力也在不断增强。终于，荷电粒子炮发射出去，一道巨大的蓝色光束直直地冲向第一个黑洞。
黑洞在荷电粒子炮的冲击下瞬间崩溃，消失得无影无踪。行星哥斯拉并没有停下，它紧接着将荷电粒子炮对准了第二个黑洞。同样的，这个黑洞也在荷电粒子炮的攻击下被摧毁。
然而，就在行星哥斯拉准备对最后一个黑洞发动攻击的时候，异变突生。一个巨大的金光闪耀的法阵出现在黑洞下方，挡住了荷电粒子炮的攻击。荷电粒子炮与法阵碰撞在一起，产生了剧烈的爆炸，但法阵却没有受到任何影响。
接着，无数金色光点从黑洞下面的金色法阵里出现，它们像雨点般落在地面上，并迅速汇聚在一起。这些金色光点逐渐凝聚成一只巨大的生物，宛如凤凰涅盘一般。这只生物有着三头、双翼和两尾，浑身散发着耀眼的金光，仿佛是由黄金铸就而成。
巨龙双翼展开朝天，三个龙首也仰天长啸，震耳欲聋的龙吟声响彻天地。显然，这只巨龙就是虚空基多拉，而且还是过去的虚空基多拉。原来，虚空基多拉感应到自己被洛亚吃掉了一个龙头后，愤怒不已，竟然利用高维生物对时间的操纵能力，将过去的自己投影到这里来对付行星哥斯拉和洛亚。