夏夜闷热得像蒸笼，小满躲在凉席上翻来覆去睡不着。窗台上的萤火虫灯笼突然扑棱棱亮起，那是爷爷去年夏天编给她的，此刻每只纸萤火虫都闪烁着奇异的光，拼出通往衣柜的箭头。
柜门吱呀自动敞开，挂满藤蔓的拱门在黑暗中浮现。小满刚踏进去，脚下的木地板就变成柔软的苔藓，头顶垂下的常春藤瞬间绽放出会唱歌的铃铛花。深处传来叮咚水声，拨开叶片，她看见银鳞鱼尾在月光下一闪而逝。
\"人类小孩不许偷看！\"湿漉漉的声音从芦苇丛传来。浑身沾满露珠的绿发少年抱着陶罐探出头，他的耳朵尖尖的，赤脚踩过的地方立刻长出发光的三叶草，\"我是守泉人阿萤，你怎么会闯进萤火森林？\"
小满还没开口，远处突然传来尖啸。整片森林的萤火虫同时熄灭，阿萤脸色骤变，陶罐里的泉水泛起血色涟漪。\"暗影蝾螈又来了！\"他拉起小满狂奔，树根自动拱起形成台阶，带他们跃上最高的橡树。
月光下，沼泽中央翻涌着沥青般的黑雾，九只长着尖牙的蝾螈破土而出，鳞片泛着金属冷光。它们张开巨口，吐出的黏液所到之处，三叶草迅速枯萎成灰烬。阿萤举起陶罐，泉水化作光刃劈向怪物，却被黑雾反弹回来。
\"这样不行！\"小满发现蝾螈眼睛里倒映着自己的萤火虫灯笼，那些被黑暗吞噬的纸萤火虫突然重新发亮，\"试试用光把它们引到河边！\"她摘下灯笼抛向空中，所有萤火组成发光的锁链缠住蝾螈的尾巴。
阿萤立刻领悟，将泉水泼向天空。月光与泉水交融，在沼泽上空织出巨大的光网。蝾螈们发出痛苦的嘶吼，黑雾中渐渐显露出被困住的萤火虫精灵。原来这些怪物是被污染的泉水所化，体内囚禁着森林的光明。
战斗结束时，黎明的第一缕阳光穿透云层。阿萤疲惫地瘫坐在焦黑的草地上，他的鳞片黯淡无光，耳尖的露珠也失去了光泽。\"暗影蝾螈每百年苏醒一次，这次要不是你...\"他突然剧烈咳嗽，陶罐里的泉水彻底变成黑色。
小满翻开灯笼夹层，那里藏着爷爷临终前塞给她的银哨。当哨声响起，所有纸萤火虫化作实体，翅膀上的磷粉飘进陶罐。泉水重新变得清澈，还浮现出爷爷年轻的面容。\"傻丫头，萤火虫灯笼里藏着守护森林的契约。\"影像中的爷爷眨眨眼，消失前留下一串风铃草。
阿萤震惊地看着小满：\"你是初代守泉人的血脉！这些年我们一直在等守护者归来。\"他带小满来到森林深处的许愿池，池底沉睡着十二座水晶雕像——正是被污染的泉水侵蚀前的守泉人模样。
突然，最后一座雕像闪过红光。一只断尾的蝾螈从池底浮起，它眼中的黑雾正在消散，露出和阿萤相似的绿眼睛。\"哥哥！\"阿萤颤抖着伸手，小满将发光的风铃草放在蝾螈额头。黑雾彻底褪去，恢复成少年模样的守泉人虚弱地说：\"暗影之源...在旧矿井...\"
三人循着线索来到废弃的矿洞。深处的地下湖漂浮着巨大的污染核心，像颗跳动的黑色心脏。阿萤的哥哥突然拦住他们：\"太危险，这是我当初没完成的任务。\"但小满注意到核心表面布满蛛网般的裂痕，和自己灯笼上爷爷修补的痕迹一模一样。
\"让我试试！\"小满取出银哨，萤火虫们衔来发光的丝线。她模仿着爷爷缝补灯笼的手法，将光明一点点织进污染核心的裂痕。阿萤兄弟用泉水清洗伤口，十二座水晶雕像同时苏醒，将最后的力量注入丝线。
当第一百只萤火虫落在核心上时，黑色心脏轰然炸裂。纯净的泉水喷涌而出，淹没整个矿洞。逃出生天时，晨光正温柔地抚摸每一片新生的三叶草。阿萤的哥哥重新获得了鱼尾，十二位守泉人围着许愿池跳起古老的舞蹈。
离别时，阿萤送给小满一串萤火项链：\"只要森林需要，它就会指引你回来。\"小满把项链和灯笼放进衣柜，发现柜门内侧浮现出新的藤蔓花纹。当月光再次爬上窗台，那些花纹就会变成会动的故事，讲述着萤火森林永远讲不完的传说。