红皇后的关闭导致封锁的蜂巢全部开启，包括所有上锁的办公区和实验区的门，当蕾恩与J.d.把守在b食堂，意外在巡逻时发现一名女研究员，她误以为是生还者而走上前，但女研究员却直接咬了她的手，使得赶过来的J.d.朝她开枪，但女研究员在五枪下依然站在原地，最终被蕾恩利用冲锋枪打死。卡普兰等人赶来时发现状况，而麦特也发现女研究员留的血竟然早已凝固，此时众人面前突然出现几十名穿着蜂巢工作服却有大型伤痕的人，所有人为了自保而集体开火，也意外发现他们在中枪后竟然若无其事的站起来，众人觉得无法挡下后决定撤离，但J.d.在撤离途中因为走错门而被众死尸拖去吃掉。
爱丽丝与麦特和队伍分开，但其中一个储物箱因为中枪而爆炸，爱丽丝头部受到冲击后恢复部分记忆，也在最后与麦特分开。蕾恩等人回到红皇后控制室后开始推卸责任，卡普兰认出他们是蜂巢工作人员，也认为他们没已无任何希望。麦特来到办公区，自己妹妹丽萨的工作区，拿到所有关于保护伞公司的资料后遭到变成死尸的丽萨的攻击，但赶来的爱丽丝拿重物敲破丽萨的头，而爱丽丝也想起自己曾经见过她。麦特得救后抱着自己妹妹的尸体痛哭，也对爱丽丝说明自己的真正目的：自己其实是一名前科累累的环保主义者，多年调查企图利用生化病毒征服世界的保护伞公司，因此利用自己妹妹来夺取蜂巢的机密文件，得知她出事后立刻以警察的身份进入蜂巢，也曾经收到自己妹妹有一名出卖自己的线人的消息。
爱丽丝与麦特为了逃离追上的死尸而跑回红皇后控制室与蕾恩等人相遇，而蕾恩也说出如果在一小时之内没赶回宅邸的防爆门外就会被永远困在地下，但爱丽丝决定重新开启红皇后而问出出路，红皇后再度打开后解释了所有的事：保护伞公司利用开发出来的t病毒做病毒实验，而t病毒也会使得一具已死亡的尸体重新启动，启动的尸体也会寻求食欲的欲望，自己封锁蜂巢及杀死所有人是为了不让病毒外泄。但爱丽丝威胁她说出出路，红皇后之后把唯一的出路说出：水电管道。
众人到达地下通道后遭到众感染者的攻击，卡普兰因速度慢而被咬到大腿，蕾恩因为看到变成感染者的J.d.而无法下手，却被他直接咬到脖子。最终除了卡普兰以外，其他人全部逃回实验区，而卡普兰一开始打算自杀了结，但却无法下手而从其他管道逃离。爱丽丝回到淹没一半水的实验室后向麦特表明自己的真实身份，自己就是丽萨的线人，而麦特在无法接受之下问她实情，但爱丽丝完全不记得。爱丽丝来到病毒库后发现病毒已全部被拿走，史宾斯看到病毒库后恢复所有的记忆及表明自己的真实身份：自己是在病毒库偷走所有病毒的人，同时也是让病毒泄漏出去的罪魁祸首，一开始认为自己成功逃离，但却也因为蜂巢的防御系统而失去记忆昏倒在火车上。