而陈琦这边也开始动作频频，他首先捐了一个监生的名头。要知道，这可是晚清时期为了解决财政问题而向豪商们开放的一种买官途径。起初，这个监生的头衔仅仅是一个纯粹的虚名，旨在提升商人的社会地位。然而，随着时间的推移，监生逐渐有了为官的机会，尤其是在一些传统文人不太愿意涉足的领域，比如洋务等事务中。
陈琦之所以选择这样做，完全是出于对未来计划的考量。拥有一个公开的身份，至少能让很多事情变得简单许多。与此同时，与黑旗军的正式合作协议也已经准备就绪。陈琦提供了初版协议，并前往会见刘永福。这次会面还有县衙的县令以及兵备道的官员作为见证人，可以看出刘永福对此事非常重视。
尽管这种合作形式在黑旗军身上尚未尝试过，但在其他军队，如湘军和淮军身上却是有过先例的。因此，这并不算突兀。只不过，黑旗军将其摆到了明面上来处理罢了。。
而刘永福看到陈琦成了监生，干脆当着县令和绿营管带的面，给陈琦安排了一个黑旗军的后勤管理，名义上是黑旗军下属团练，以陈琦为主，刚好他现在是监生的身份，直接给他升级为9品外委把总，在县令和兵备道的见证下，书写公文用印，很快就确定了下来。
等刘永福上报之后，朝廷经过一番深思熟虑后，下发了陈琦的把总的印信以及官服。至此，陈琦终于名正言顺地成为了黑旗军的一员。
对于这个突如其来的任命，陈琦感到十分惊讶和困惑。毕竟，连黄飞鸿这位黑旗军的总教头事先都对此毫不知情，显然这完全是刘永福个人的决定。
刘永福之所以做出这样的安排，其实也是有他自己的考量的。因为陈琦送来的各类物资不仅品质上乘，甚至好过市面上的其他同类产品，关键价格还相对低廉实惠。刘永福深知，像陈琦这样的财神爷绝对不能轻易放过。目前黑旗军自身并无任何产出，所有的物资都是赊账而来。因此，刘永福才会想方设法地笼络住陈琦这棵摇钱树。
面对刘永福的好意，陈琦并未推辞，而是欣然接受了下来。整个过程异常顺利，进展迅速。然而，这件事却很快传遍了大街小巷。一时间，各种流言蜚语纷至沓来。有人说黑旗军如今已是病急乱投医，竟然直接任命一个商人担任九品官员；更有人戏称陈记商行成了冤大头，被黑旗军白白占了便宜。这些负面言论使得众多官场人士对黑旗军的前景愈发看淡，原本就对他们心存疑虑的人此刻更是坚定了自己的看法。
而陈琦这边，则是开始频繁地展开一系列大规模行动。他率先接手了黑旗军的后勤工作，不仅改善了士兵们的伙食和医疗条件，还建立起完善的战场救护制度。此外，黑旗军拥有了精良的武器装备，同时针对各种可能出现的情况制定了相应的应对计划，配备了不同类型的作战服装，以及各类行军所需的器具等等。当然，所有这些都被详细记录在账目上，这让刘永福感到有些心疼。然而，当看到民团士兵们的精神面貌日益焕然一新时，他心中又涌起阵阵喜悦之情。
接下来，陈记商行相继开设了榨米行、面粉厂以及各种工坊，并开始招募流民和工人。随着时间的推移，陈记商行的商品种类变得愈发丰富，生意渠道也迅速拓宽。他们积极寻找游商进行合作，货物畅销南北各地。由于陈琦身兼黑旗军 9 品外委把总的职务，其他竞争对手一时之间难以对其采取行动。一旦发生冲突或矛盾，黑旗军的民团会立即出面解决问题，确保一切顺利进行。
与原着中的情况截然不同，此时的黑旗军不仅没有断粮饷、面临解散的危机，反而拥有着良好的后勤保障和充足的物资供应。相较之下，那些天天接受训练的民团士兵更是不可小觑。他们绝非界面上的小混混可比，实力强劲得多。
在陈琦的带领下，这些民团士兵成功地清除了许多城中的狐鼠之辈。陈琦做事非常谨慎，他总是先搜集到充分的犯罪证据，然后才会命令民团实施抓捕行动。随后，便是与县衙之间的分赃事宜。起初，县衙对此并不太情愿，但面对确凿无疑的证据以及大量可供操作的收益——包括现银、田地等，他们最终还是心动了。至于那些店铺、矿产和荒地，则由黑旗军接手管理。然而，实际上这些产业都已转交给陈记商行用于抵债，这也是黑旗军账目上首次出现结余的原因所在。
对于未来的发展，陈琦提出了购买武器的建议，并声称自己有渠道能够解决这个问题。如此一来，便可以招募更多的士兵加入黑旗军。目前的黑旗军虽然历经数场激战，但尚未满员编制，刘永福对此仍有些犹豫不决。于是，陈琦找到了黄飞鸿，两人一同劝说刘永福，并重新提及了剿匪计划。
而刘永福这里也终于拿到了梦寐以求的朝廷剿匪诏令，可以名正言顺地出兵剿匪了。这背后自然少不了县衙的推波助澜，毕竟只有让刘永福得到足够多的好处，才能确保他们能够顺利完成剿匪任务。要知道，如果只是一支刚刚接受招安的军队，妄图单独外出剿匪，那简直就是痴人说梦！朝廷怎么可能会轻易答应这样的请求呢？他们担心这支军队势力坐大后难以掌控。然而，有了县衙作为担保，一切都变得不一样了。
不仅如此，刘永福还主动向朝廷呈上了一份折子，表示愿意出征阮朝，但希望能有足够的时间来做好充分的准备工作。例如，补充完整人员编制、结清朝廷拖欠已久的饷银等等。与此同时，陈琦也没有闲着。他一方面致力于发展陈记商行的业务，另一方面还要兼顾黑旗军的后勤事务。