朱载坖将赵文华的奏疏下部议，就是看看朝廷对于惩办衍圣公和孔家的态度如何。
朱载坖对于赵文华是很满意的，这就是奸佞的好处了，赵文华根本不需要朱载坖暗示他什么，他明白自己这个刑部尚书应该怎么帮朱载坖分忧，所以直接上疏，要求严惩衍圣公，以此试探朝廷对于此事的态度。
赵文华的奏疏下部议之后，引起了极大的反响，尤其是有关衍圣公府的种种恶行，其实朝廷早就有所耳闻，但是之前一直没有处理，现在赵文华将这些都重新翻了出来，朝廷就不得不处理了。
对于赵文华奏疏，朝廷的反对声浪并没朱载坖想象的那么大，对于衍圣公加以惩戒，基本上没有什么问题，只是惩戒要到什么地步的问题。
一些官员认为应当严惩孔家，剥夺他们祭祀孔子的权力，清丈土地，由朝廷直接派人负责圣人的祭祀就行了，圣人是圣人，孔家是孔家，这是两码事情。
而另外一些官员认为对于孔家加以薄惩就是了，让孔家收敛一些，毕竟是圣人苗裔嘛，还是要顾及一些脸面的。
朱载坖看了这些奏疏之后，认为火候差不多了，于是朱载坖召集内阁辅臣、六部九卿，科道言官和翰林学士、侍读、侍讲等官员，一道商量应该怎么处理衍圣公和孔家。
朱载坖说道：“卿等说说，应当怎么处理山东的事情。”
作为首辅的高拱肯定是要首先发言的，高拱说道：“陛下，臣以为，衍圣公府不法事甚多，必须要是严查之后，才能再做决断。”
高拱的意思就是很明确，就是不管什么，先查下去再说，其实大家都很清楚，像孔家这样的巨室豪门，北地的烂事肯定是不会少的，朝廷要是真的动真碰硬的查下去，肯定是会将很多烂事翻出来的，到时候这么多的烂事，即便是想将孔家轻轻放过也是不可能了。
赵文华则是仍然坚持自己的观点，就是必须严惩孔家，其余的臣子们也各自发表了自己的看法。
朱载坖这才说道：“朕有一事不解，还望卿等解惑，这曲阜知县到底是为朝廷牧民还是为孔家撑腰？”
朱载坖的话一出，在场的臣子们都明白了朱载坖的意思，就是要严惩孔家，之前的曲阜知县都是由衍圣公保举的，由于衍圣公拥有保举之权，这些知县有都是孔家人，衍圣公是孔家族长，大部分的曲阜知县都是衍圣公的传声筒罢了，与其说他们是在为朝廷牧民，倒不如说他们是在为孔家办事。
朱载坖说道：“之前曲阜知县由孔家人担任的，照例世职升转，无甚大罪不轻参革，不升转则无所希冀，不参革则无所顾忌，久于其职，致废祖放纵，颠倒是非，百姓安能受益？此非善法也，朕前以废之，而孔尚贤仍喋喋不休，为此上疏，心生怨望，朕恐其有不忍言之想，则圣人蒙羞矣！”
朱载坖说了这么多，赵文华立马反应过来，说道：“陛下所言极是，陛下上谕煌煌，严令衍圣公不得言及政务，而其公然抗旨，上疏言事，可见其内心之怨望，怨则生逆也！清陛下早做处断，以绝后患。”
赵文华的助攻打的很及时，其实在朝廷重臣们眼中，孔尚贤这个衍圣公已经是没有必要再当了，不重处孔尚贤，此事是很难善了的。
王锡爵也出来说道：“陛下，孔家世袭曲阜知县，并非一直是前朝旧例，汉唐之时，曲阜县令的选任依照回避制度，由异地人员充任，并非由孔家人担任了，宋真宗大中祥符元年，改曲阜为仙源县，并规定由孔子后裔充任仙源县令，方有此制。”
赵志皋也出来说道：“陛下，孔氏多无粮之地，异姓纳溢额之粮，衍圣公亦均受其利，如此则曲阜非朝廷之州县，乃孔家之封国也！尊重适以养其骄横，世职反厚其茶毒，非保全圣人苗裔之道也！”
赵志皋当了一把钦差，对于地方的一些事情有所了解，现在他是极为反感这些所谓豪门世家的。
朱载坖见申时行在一边若有所思，于是问道：“申学士可有什么要说的？”
申时行这才说道：“陛下，臣以为陛下之策甚好。衍圣公宜隆之以爵，而不应授之以权，有爵之可荣，而无权之是累，是保全圣人苗裔之道也，况祭祀大典，乃朝廷之盛举也，孔家何以代大明也？是朝廷之祭与孔家之祭，宜以区分也。”
申时行说完，朱载坖觉得很对，朝廷尊奉孔子，结果祭祀的却是孔家，这显然不太合适，家祭与国祭确实是要分开。
朱载坖当即拍板说道：“申学士说得是，赵宗伯要令礼部拿出一个方案来，由朝廷每岁派遣重臣予以祭祀，以彰朝廷尊奉孔圣之意也。”
朱载坖的想法很简单，就是要剥夺孔家祭祀孔圣的权力，将孔家和孔圣做个切割，借此将孔家所享受的各种特权予以剥夺。
朱载坖当即说道：“孔尚贤一案，事关重大，朕不能等闲视之。遣南京刑部右侍郎洪朝选为钦差，会同抚按官员一道查察本案，至于孔圣之祭典，由礼部拟定，朝廷遣官祭祀，以符朝廷尊孔奉儒之意也！”
接下来就是处理衍圣公孔尚贤，对于这个蠢货，朱载坖没有任何客气的，朱载坖直接说道：“孔尚贤放肆妄言，抗旨不尊，令锦衣亲军锁拿，解送京师，由三法司会审。”
朝廷的各项命令随即以上谕的形式发出，虽然对于朝廷处理孔家，不少官员和士子是有想法的，但是让他们再去闹事，显然不可能的，他们很清楚，朱载坖不怕闹事，收拾这帮士子也很有心得，再说了，之前朱载坖连朱家的亲王们都收拾了，蜀王现在还在京师呢！
自家人都能收拾，收拾个孔家算什么，读书人头没那么铁，他们最知道留得青山在不怕没柴烧的道理，所以除了一些言论之外，并没有掀起什么风波。