一艘运送宇宙生物的外星飞船在途径地球时，遭到星际海盗阿尔法斯特人偷袭，迫降地球。地球一方派遣救援小队，及时救下被阿尔法斯特人追击的宇宙生物佩罗塔。在与阿尔法斯特人的交火中，队长少中天身受重伤。危机时刻，佩罗塔和外星飞船船长佩兹取得联络，少中天承受住巨大的宇宙能，通过能量腰带，变身成为金甲战士。自此，地球与星际海盗的作战拉开了序幕。佩罗塔告知救援小队，阿尔法斯特人是银河环境保护的天敌。他们捕捉宇宙生物改造成兵器，通过侵略，扩张自己的黑暗势力。为保护余下的宇宙生物，维护宇宙的和平秩序，保卫故乡地球，以金甲战士为首的一支年轻、勇敢的队伍诞生了。他们在与阿尔法斯特人作战斗的过程中,不断地成长，变得坚强而又自信。而在与宇宙生物的沟通与交流中，他们感悟到地球的未来掌握在人类自己手中，深切体会到人类“保护生态环境、与所有生命和谐共存”的意义。
帕兹船长的飞船载着优玛胶囊在太空遭到攻击，在地球迫降后向优玛研究所求助。研究所的成员在寻找不明信号的过程中，队长少中天因保护一只名叫佩罗塔的优玛受重伤，因人类医疗无法救治少中天，佩罗塔请求帕兹船长的帮助。在帕兹船长的帮助下，少中天意外变身成金甲战士，成功从阿尔法斯特人手中保护了研究所。
阿尔法斯特人主帅派流星海盗在优玛出现的地方埋伏优玛救援队。就在救援队分头寻找优玛下落的时候，落单的北极雪被流星海盗挟持。流星海盗提出用优玛和北极雪交换，而北极雪利用心灵相通的能力将流星海盗的阴谋告知给队长。在人质交换的瞬间，队长成功变身成金甲战士同团队再次摧毁阿尔法斯特人的阴谋，成功救下优玛。
队长少中天追寻一架玩具飞机意外发现了研究所附近的虫洞，进入虫洞后竟然见到了与自己失散多年的父亲，并得知这个虫洞是因为一只名叫x的优玛形成的。与此同时，寻找队长的队员们被阿尔法斯特人攻击，就在全员受伤的时候，队长毅然放弃与父亲相聚的机会，及时出现变身金甲战士打败了阿尔法斯特人，保护了自己的队员。
东方明和团队发生口角，拿走了队长的能量控制腰带，却不料被突然窜出的优玛抢走。后来，阿尔法斯特人吸收了优玛的能量，拿走腰带开始进攻研究所。因队长无法变身，团队的战斗力受到极大的影响，最终被击溃。东方明对自己行为后悔不已，便独自从阿尔法斯特人手中抢下腰带还给队长，队长及时变身，打败了阿尔法斯特人，保护了研究所尽管金甲战士解救了被西鲁达盯上的优玛，但是优玛还是拒绝了特救队的帮助，并且攻击金甲战士。原来是优玛目睹了偷猎者猎杀森林动物的景象，已经不再相信人类了。北极雪得知情况后，利用雪莉送给她的项链，传送佩罗塔去说服这只优玛相信救援队......