小智和小霞从宫门市回到了真新镇，整理极巨化数据和整理调查进度的同时，小智还开始进行了了融合两项战斗系统的专项特训，首先进行特训的就是喷火龙、妙蛙花和水箭龟它们三个。它们是小智最早掌握超进化的宝可梦，超进化加上Z招式就是最近训练的重点。
这天，小智接到了小胜的电话，小胜在今年的芳缘联盟上得到了前四强的成绩，对于新人训练家而言已经是很不错的成绩了。小胜打算下个月就来关东地区开始挑战关东地区的联盟大会，但是在那之前被亚希达先生邀请参加了芳缘对战开拓区的落成仪式所举办的玻璃哨杯的比赛。
小胜想着小智在真新镇就也邀请了小智来参加。
小智和小霞通过了胡帕的光环直接来到了位于暮水镇附近的芳缘对战开拓区的所在地。
小胜早就等在码头了，看到了小智和小霞是直接通过胡帕的光环来的，还有些震惊，但是震惊很快就被兴奋替代了。小胜上次见到小智还是在去年的卡洛斯联盟上。
小胜兴奋道：“小智、小霞姐姐！你们来了啊！”
小胜的身高比起去年又长高了一些。
小智道：“小胜好久不见了！我看到了电视转播，恭喜你获得了芳缘联盟大会的前四强！”
小胜有些不好意思的推了推了眼镜道：“谢谢你小智！”
小霞道：“前四强已经是个很棒的成绩了！小胜说明你也没有少锻炼宝可梦。”
小胜道：“那么我就给你们看看我在卡洛斯联盟之后收服的宝可梦们吧！”
小胜的宝可梦分别是大王燕、沙漠蜻蜓、七夕青鸟、超力王和大狼犬，除此之外小胜的宝可梦还有已经进化的蜥蜴王、沙奈朵和请假王，这样的阵容已经对于刚出道一年的训练家而言已经很强了！
小智道：“每一只的发育都很好，小胜看来你培养宝可梦真的很用心。小胜你最近有联系过小遥吗？”
小胜道：“我都是参照小智和小刚你们做过的事情而已。姐姐啊，有！她说最近要回趟家，听说米可利先生下一步要叫上姐姐和小光姐姐一起去阿罗拉地区推行华丽大赛呢！只顾着说话了，小智，亚希达先生也在等着你呢！”
小智道：“这样挺好的！亚希达先生啊，我们也有很久没有见了！”
在前往对战场地的时候，小胜说了一下这次玻璃哨杯的比赛规则，是派出两只宝可梦的单打对战，获胜者将得到五色的玻璃哨组合的奖励以及一个宝可梦的蛋。
五色的玻璃哨可以让宝可梦携带，分别是蓝色解除睡眠、黄色解除混乱、红色解除着迷、黑色增加遇到实力高的宝可梦几率、白色增加遇到实力低的宝可梦几率。
小胜带着小智和小霞直接通过了选手通道见到了亚希达先生，时间过去了五年亚希达先生还是和原来一样没有什么变化。
亚希达道：“小智好久不见了！要见到你还真是不容易啊！”
小智道：“听小胜说了之后我就过来给亚希达先生你捧场了！亚希达先生的下一步是要去合众地区建立对战开拓区？”
亚希达道：“这不是还要多亏你了！联盟对于我的计划全力支持。怎么样有没有兴趣去担任合众地区对战开拓区的开拓之脑？”
小智在神奥地区的旅行回来后跟达马岚奇会长提到过亚希达在各地都建立对战开拓区的想法，多一种战斗的形式对于联盟而言也是好事，所以之后联盟给了亚希达一路绿灯。
小智道：“还是不了！我跟当年的回答是一样的。”
亚希达道：“那我也还是当年的那句话，我这里的大门都为你敞开着！”
就在这时，广播播报了玻璃哨杯的比赛即将开始的消息，小胜道：“小智，你在第二组哎！我在第一组，我们就在决赛见吧！”
小霞道：“那我就先带着皮卡丘去观众席了！你们都要加油！”
小智登记参赛的是花漾海狮和心麟宝，两只的实力已经累计到了一定的地步了，现在只差用对战加强对战了，但这次锻炼的重点是心麟宝，花漾海狮只是陪跑宝可梦。
小智的心麟宝一路横扫，以压倒性的优势直接进入了决赛。小胜也不遑多让以七夕青鸟和大王燕也是顺利进入了决赛。
决赛没有任何意外的就是小智和小胜进行对决。
这还是小胜在正式舞台上向小智挑战！
主持人道：“终于来到了对战开拓区玻璃哨杯的决赛！这场比赛的冠军将在特别来宾真新镇的小智博士和橙华市的小胜选手中产生！小智博士时隔一年参与的宝可梦的正式对战，真是太令人期待了！之前小智博士的心麟宝一路以压倒性的优胜进入决赛。小胜选手则是今年芳缘联盟的前四强，听说小胜选手还和小智博士一起旅行过！这场对战真是让人太期待了！”
小胜道：“小智我会全力以赴的！我的第一只是它，出来吧大王燕！”
小智道：“心麟宝就决定是你了！”
【大王燕】
【属性：一般、飞行】
【性别：雄】
【特性：毅力（如果变为异常状态，会拿出毅力，攻击会提高）】
【实力：道馆初级】
“小智我的大王燕也是在橙华森林中收服的傲骨燕进化的！使用影子分身！”
大王燕瞬间分出了多个分身，将心麟宝给包围在了其中。
“空气斩！”
“躲开！”
大王燕的翅膀释放出的斩击劈向心麟宝，但心麟宝的身影下一刻就消失了，在出现的时候已经来到了大王燕的身后。大王燕的空气斩要是命中心麟宝效果极好，但心麟宝的速度是小智特意训练过的。
“岩崩！”
心麟宝大吼一声，无数岩石从天而降。
“大王燕，快躲开！”
大王燕迅速做出回应，但是岩崩的速度比起大王燕还要快上许多。降落的岩石砸中了大王燕的背部，将大王燕打落。
“追上去，使用头锤！”
心麟宝朝着掉落的大王燕奔跑了起来，笔直的扑向大王燕，大王燕无法扇动翅膀被撞飞了出去，失去了战斗能力。
裁判道：“大王燕失去战斗能力！心麟宝赢得胜利！”
小胜收回了大王燕道：“小智你果然还是我最崇拜的人！能跟你对战我真是太开心了！出来吧，七夕青鸟！”
小智没有更换宝可梦，依旧是派出心麟宝。
【七夕青鸟】
【属性：龙、飞行】
【性别：雄】
【特性：自然回复（回到同行的队伍后，异常状态就会被治愈）】
【实力：道馆初级】
“七夕青鸟，使用龙之波动！”
“躲开！”
心麟宝以极快的速度避开了龙之波动的攻击。
“使用灭亡之歌！”
七夕青鸟吟唱起了魅惑的旋律，音符融合成一个光球消失不见。灭亡之歌的效果已经存在了，小智微微一笑，打算用拖延战术了吗？
“逆鳞！”
“棉花防守！”
小智直接打算速战速决，心麟宝的双眼变得猩红，径直扑向七夕青鸟。七夕青鸟用自己的羽毛做防御，但是面对连续攻击的逆鳞渐渐有些力不从心。
“就是那里，使用巨声！”
心麟宝发出了巨大的震动限制住了七夕青鸟的动作。
“龙之波动！”
心麟宝在巨声之后紧接着使用了龙之波动，在七夕青鸟还没有反应过来的时候，龙之波动就将七夕青鸟吞噬了进去。
就在此时，心麟宝进化成了鳞甲龙。
裁判宣布道：“七夕青鸟失去战斗能力，鳞甲龙赢得胜利！所以对战开拓区玻璃哨杯的冠军是小智选手！”
小智只带走了冠军奖杯，至于奖品和精灵蛋则交给了小胜。
小智和小霞在亚希达的邀请下留下了三天，小胜带着小智转赠的奖品先返回了橙华市。