决定了前往香薰市的小智一行人，准备在出发前去一趟布拉塔诺博士的研究所。希特隆也重新归队，四人小队重新集结。（研究所将要再次被破坏了！）
布拉塔诺博士热情的欢迎小智四人，刚好今天他要进行烈咬陆鲨超进化数据的研究，用的当然是小智赠送的超级进化石和钥石。布拉塔诺博士在小智和卡露乃对战后，就开始注重培养他和烈咬陆鲨的羁绊。
突然间一声巨大的声响，研究所再次被破坏，一个喵喵机器人闯了进来。不用想也知道是火箭队三人组！
他们抓住了烈咬陆鲨以及超进化石和钥石就要跑，小智怎么可能让他们如愿呢！
“皮卡丘，铁尾！”
皮卡丘一发铁尾就切断了抓住烈咬陆鲨的触手，超进化石落在了烈咬陆鲨的手里，进化钥石落在了布拉塔诺博士的手里。
这时火焰鸡假面带着超级火焰鸡也赶到了这里，超级火焰鸡使用的火焰踢形成的火焰将喵喵机器人包裹住。利莫内大叔喊道：“布拉塔诺博士，就是现在！”
布拉塔诺道：“好，现在就来收集数据！烈咬陆鲨我相信你，超级进化！”
布拉塔诺博士手里的钥石与烈咬陆鲨身上的超级进化石相互呼应，一道强光之后超级烈咬陆鲨登场！
“烈咬陆鲨，使用劈开破坏那台机器！”
瞬间喵喵机器人就变得四分五裂，见势不对的火箭队三人准备要跑。
“破坏死光！”
破坏死光轰向火箭队，一声爆炸后，火箭队三人再次起飞！
“好讨厌的感觉啊！”
“索南斯！”
事情解决后，布拉塔诺博士准备向火焰鸡假面道谢但是他和火焰鸡却已经离开了。
小智一行人告别了布拉塔诺博士就离开了密阿雷市，他们以香薰市为目标持续着旅行！
布拉塔诺博士在小智他们离开后，它来到了利莫内大叔的电器店中，刚才火焰鸡假面离布拉塔诺博士最近，他闻到了熟悉的机油味。利莫内大叔经常帮研究所进行设备维修等工作，所以他对这股味道是很熟悉的！
布拉塔诺博士到的时候，利莫内大叔正在修理洗衣机，看到布拉塔诺博士来问道：“博士，是机器出问题了吗？”
布拉塔诺笑道：“不，好浓郁的机油味啊！不管什么时候闻都另有一番风味呢！其实我今天过来是有件事想要拜托你，能将你的超级火焰鸡来帮助我的研究吗？”
利莫内大叔没想到他的身份竟然被布拉塔诺博士识破了，尴尬的伸出了手和布拉塔诺博士的手握在了一起。
......
离开了密阿雷市的小智四人，目前他们正在一条小溪旁吃午饭，希特隆在上次分别后还特意研究了菜色，料理的手艺有所提高，连宝可梦食物都做的很好吃，宝可梦们都大口大口的吃着。尤其是哈力栗，三两下就将宝可梦食物吃完了还意犹未尽，就将视线落在了顽皮熊猫面前的食物上。
顽皮熊猫抓住了哈力栗想要偷吃的手，将自己的宝可梦食物移了移，哈力栗却不放弃，抢夺间，哈力栗撞翻了咚咚鼠的宝可梦食物。食物的怨恨是很强大的，咚咚鼠当即就用了电击将哈力栗给击飞。
黏美龙主动将自己的宝可梦食物递给了哈力栗和咚咚鼠，让两只重归于好。
这时一只喇叭芽跑到了黏美龙面前，黏美龙伸出手兴奋样子，两只宝可梦很显然认识。
一个大叔也走了过来，欣慰道：“真的是你啊，好久不见黏黏宝......不对，现在应该是黏美龙了！”
小智问道：“请问你认识我的黏美龙吗？”
大叔道：“原来你遇到了一个好的训练家，要不然就不会这么快就进化了！大家好，我叫贤藏，是前面不远处湿地的管理员，黏美龙进化前一直都生活在那里！”
小智四人自我介绍后，小智才问道：“当初我遇到黏黏宝时期的黏美龙的时候，它是被一只首席天鹅带出去的，后来我了解到黏美龙的家乡似乎被什么入侵了，请问到底是发生了什么事？”
黏美龙听到小智提起这件事，虽然它已经变强不是当初的黏黏宝了，但是想起来还是不由的恐惧，当时被欺负的太厉害，都留下了阴影了！
小智安慰道：“黏美龙，放心我在你身边！”
黏美龙相信小智，点了点头平静了下来。
随后小智四人就跟着贤藏大叔来到了湿地，看着眼前熟悉的故乡，有开心也有失落。
湿地地区居住的宝可梦应该是种类最多的，但是放眼看去却没有看到任何的宝可梦，小智释放出波导之力，才察觉到不是没有宝可梦而是都躲了起来，都不敢露面。
贤藏这才叹了一口气将事情的前因后果都说了一遍，道：“这片湿地有一口涌泉，它涌出的泉水具有治愈宝可梦身心的疗效！之前黏黏宝和众宝可梦们都过着和乐的生活，可是因为这口涌泉却引发了一场纷争！”
那天，一只花洁夫人带着众多的虫系、毒系的宝可梦们对湿地进行了入侵，黏黏宝本来都准备逃跑了，可是看到同伴被攻击就返回准备去帮忙，但却被花洁夫人使用的月亮之力给打飞了出去，幸好被首席天鹅带离了湿地，之后就遇到了小智。
莎莉娜道：“怪不得那个时候黏黏宝会这么害怕咚咚鼠了。”
希特隆问道：“那其他的宝可梦们呢？都被赶出去了吗？”
贤藏摇了摇头道：“没有，它们现在都还在湿地上，只是被赶到了湿地的边缘地带。”
黏美龙难受的低下了头，小智道：“贤藏先生，入侵的只有毒系和虫系的宝可梦吗？”
贤藏点了点头，道：“是的。”
小智道：“那么这场入侵事件应该有前因才对，野生宝可梦具有很强的地盘意识，要不是发生了什么事，是不会主动去入侵其他宝可梦生活的地方的。”
贤藏道：“这么说来也是！”