希特隆先行回到了密阿雷市，小智三人则继续着旅行，现在小智他们终于离开了荒野地带进入了森林的区域。
柚丽嘉担心道：“哥哥不会有问题吧？”
莎莉娜道：“一定没问题的，我想现在希特隆一定在进行特训才对，毕竟小智的实力可是很强的！”
柚丽嘉道：“也是，哥哥现在一定和希特洛伊特在一起！”
柚丽嘉猜的没错，希特隆在抵达密阿雷市后休息了一晚就立刻和希特洛伊特投入了特训之中，希特隆将小智可能会想到的战术都输入给希特洛伊特模拟对战。
这时火箭队不知死活的又来偷袭，瞬间就被皮卡丘的十万伏特给直接轰飞。
武藏和果然翁被打到了另一个方向，落地后武藏就带着果然翁四处寻找小次郎和喵喵，途中遇到了一只臭臭花使用了麻痹粉，武藏和果然翁就被放倒并掉下了悬崖下的河中。
救了她们的是附近村子中的青年医生伟特，就这样武藏和果然翁都陷入了爱河。
小智三人也在不久后抵达了这个小村庄，算起来他们已经露营好多天了，能找到个地方借宿洗个澡就是很好的了。好巧不巧，遇到了刚看诊回来的伟特医生和武藏，伟特医生知道小智三人是旅行中的训练家后，就让他们去了他家借宿一晚。
武藏现在将头发盘了上去，穿着一件男生的衬衫和牛仔裤，不穿火箭队制服的武藏有一种温柔的感觉。
小智微微一笑，武藏提心吊胆的和众人吃过晚饭就急忙将小智三人拉到了外面，恳求道：“小鬼头，我拜托你们千万不要把我是火箭队的事情告诉伟特医生！我已经决定要退出火箭队跟伟特医生一起生活，果然翁也找到了自己的幸福！”
武藏的这句话也被趴在窗外找来的小次郎和喵喵听到了，小次郎和喵喵看到武藏和果然翁现在的状况也决定成全武藏。
小智道：“这是武藏你自己的决定，我不会干涉，帮你隐瞒也没有问题。”
武藏感激道：“谢谢你们！”
柚丽嘉八卦道：“说一起生活是要结婚的意思吗？”
“结婚？！”武藏脸瞬间就红了，她对伟特医生一见钟情，确实有过这样的想法。
莎莉娜道：“一起生活后不就是这样的发展吗？”
喵喵和小次郎落寞的走在森林中，没有了武藏在身边果然很寂寞。武藏花钱大手大脚京城将他们三个打工赚来的钱很快花完，找食物的时候经常偷懒却吃得最多，但火箭队三人总是一路扶持，无论是低谷还是高峰，他们都追随着小智的脚步为了抓到皮卡丘的目标而奋斗。
就在这个时候喵喵发现了路边有个打开的笼子，里面放着一个波芙蕾。
喵喵道：“怎么看都是陷阱啊喵！”
小次郎瞬间反应了过来，道：“会用这招的是......宝可梦猎人！”
火箭队对宝可梦猎人可没有什么好感，当年他们的阿柏怪和双弹瓦斯就是为了保护被宝可梦猎人抓走的宝可梦而被放生的。
这时一个男人走了出来，道：“恭喜你们答对了！我现在找到了最棒的猎物了——会说人话的喵喵！”
小次郎拿出了精灵球，指挥南瓜精和豪喇花枝一同战斗，但是喵喵它们三只都不敌宝可梦猎人的超铁暴龙，都被宝可梦猎人给抢走了。小次郎现在不能去找武藏只能去寻求小智的帮助！
小次郎拖着受伤的身体来到了伟特医生的小院中，小次郎的伤是刚才为了保护豪喇花枝被岩石炮打伤的。小次郎来到小院已经精疲力尽了，晕倒在了小智的面前，幸好院子里只有小智三人。
小智看到小次郎这个样子，立刻就将常磐之力注入小次郎的身体，小次郎缓缓睁开了眼睛，焦急道：“小鬼头，能请你帮帮我吗？喵喵、豪喇花枝和南瓜精都被宝可梦猎人抓走了！我没有办法了！”
莎莉娜敏锐道：“小次郎难道说你对武藏......”
小次郎没有找武藏显然是知道了武藏想要留在这里的想法，能做到成全她的，那么也就一个解释了，小次郎喜欢武藏，为了她的幸福才能狠心做到放手。
小次郎道：“是，但是我不想破坏她的幸福，我只能求你们帮我了！”
小次郎和武藏互有好感的事情，小智早就注意到了，当年在小次郎被他父母逼婚的时候，义无反顾选择离开家回到火箭队的时候。他们的感情相互扶持或许更多一些，武藏却没有注意到这件事。
（动漫剧情中xY篇第二部12集，15分56秒，小次郎明确表达过自己的内心。）
小智道：“先等等我帮你治疗好伤口再说！我身为宝可梦搜查官是不可能坐视不管的！”
小次郎道：“谢谢！”
小次郎的伤口不深，用常磐之力止血后也就没有什么事了。小次郎道：“我带路吧，就在山脚那里！”
小智走前看了眼窗帘后，武藏早在小智给小次郎治疗的时候就在窗帘后了，小次郎说得话她都听到了，如何选择就看武藏的了！
武藏想着小智他们都去了喵喵它们应该都是没事的，她还是将出现宝可梦猎人的事情告诉了伟特医生。伟特医生当即就冲出了门去，他青梅竹马的女生莓果的大牙狸被宝可梦猎人伤害过。
看着伟特医生担心那个女孩的模样，武藏自嘲一笑但转瞬又变得坚定起来，她将果然翁留下后穿上了火箭队的制服也赶往了山脚的位置。
众人来到山脚的时候，看到了被关在笼子里的喵喵它们，还有很多的宝可梦。小智道：“我是宝可梦搜查官，我宣布你被捕了！”
宝可梦猎人笑道：“年纪这么轻的搜查官我还是第一次见呢！不自量力的小鬼！去吧，超铁暴龙！”
小智道：“皮卡丘，你掩护小次郎将喵喵它们都救出来！乘龙就决定是你了！”
“超铁暴龙，使用岩石炮！”
“使用绝对零度！”
一道冰柱瞬间出现在超铁暴龙的身后，一击必杀！超铁暴龙失去战斗能力的时候，已经被冻成了冰块。
这时武藏也赶到了，宝可梦猎人见自己的最强王牌只一击就败在了小智的手上想要开车带着被抓住的宝可梦们逃走，可是火箭队联手已经将被抓的宝可梦们都救了出来。
小次郎感动的擦去了眼中的泪水，与武藏相视一笑，道：“我们火箭队重新集合，现在该我们反击了！”
武藏道：“就是，我们也要收回点利息才对！”
“索南斯！”果然翁配合道。
武藏道：“果然翁你怎么会在这里？”
喵喵翻译道：“果然翁说它已经跟它们告别了喵！”
武藏道：“你这个大傻瓜！好，我们火箭队一起发动攻击吧！”
......
小智将宝可梦猎人交给了君莎小姐，火箭队三人也就离开了，难得他们没有被打飞。只是走前，武藏让莎莉娜转交了一束花给伟特医生。
与此同时的密阿雷市的幻彩水晶塔中，希特隆将小智的经常使用的战术等转化为数据输入了希特洛伊特的系统中，希特洛伊特完全不能理解小智的行为模式就发生了爆炸。
小智三人返回了伟特医生家中休息了一晚后，第二天才离开村庄。