小智带着小霞回到真新镇第一时间就是回家，刚好能赶得上晚饭。
小智兴奋道：“我回来了！”“皮卡！”
花子笑道：“欢迎回来小智、小霞还有皮卡丘。”
皮卡丘扑进了花子的怀中，撒着娇。
小健、小茂和大木博士也从屋子里走了出来，小健道：“恭喜你小智拿下芳缘联盟的冠军。”
小茂抱怨道：“小智，你的论文能不能写慢点。”小茂再次见到小智，第一时间就是抱怨。
小智笑道：“抱歉抱歉。”
大木博士道：“太好了，你们终于回来了！小智你妈妈做了很多菜等你们回来哦！连带着我们都有口福了！”
小霞道：“花子阿姨打扰了！”
花子道：“哪里会呢！我欢迎还来不及呢！”
就在大家即将要开饭的时候，门口响起了车的喇叭声，小智一开门就看到了小遥和小胜。
小胜道：“小智我们来了哦！”
小遥道：“在家里待了一天，我们就想说早点出发，到未白镇就遇到小田卷博士了，所以我们就顺路搭便车过来了。”
今晚的小智家异常的热闹......
翌日一早，小智就被大木博士和小田卷博士带走了，大木博士要研究芳缘三神，但是它们三个都无视大木博士很久了，刚好有空加上小智，小田卷博士也来凑热闹他们要将小智的价值发挥到最大。
小霞、小健还有小遥姐弟，正在照顾关东的初始御三家，再过不久就会有新人训练家出发旅行了。
小胜看着三小只恨不得现在就成为训练家出发旅行，他道：“每只都小小的好可爱哦！”
小霞道：“对于初学者而言，这是最合适的。”
小胜疑惑道：“那小智的皮卡丘应该也是大木博士赠送的吧！怎么强的离谱呢？”
小健一时之间都不知道怎么解释了，道：“要不等会小胜你去问问大木博士吧！原因只有博士最清楚了。”小健成功将话题岔开。
小胜兴奋的摸摸小火龙，又摸摸妙蛙种子，就在小胜伸手想要摸摸杰尼龟的时候，杰尼龟居然大哭了起来。
小胜以为是自己吓到它了，急忙道歉道：“对不起嘛！”
杰尼龟虽然止住了哭声，但脸上还带着泪痕，但手上和嘴巴里的动作不停，吃着它的宝可梦食物。
小健道：“小胜，这孩子的个性就是很爱哭，所以你不用在意了啦。”
给三小只喂食结束，小胜自告奋勇要把它们收进精灵球中，只是最后轮到杰尼龟的时候，它又哭了起来，直接扑到了小遥怀中。小遥摸着它的小光头安慰道：“别怕别怕啊！”
小健道：“看样子杰尼龟很喜欢小遥呢！”
小霞道：“真没办法，小遥在杰尼龟平静下来前，它就交给你了！”
小茂来到楼上找人道：“咦，小智、小田卷博士还有爷爷他们呢？”
小霞道：“应该在空间里，大木博士他们拉着小智去找裂空座了。”
小茂道：“真是没办法，花子阿姨让我来给大家送午餐。要不这样吧，难得有机会，我们大家也去空间中进行一次野餐如何？”
小胜道：“太棒了，还能跟小智的神兽们一起吃饭，这可是难得的经历啊！”
空间中，大木博士和小田卷博士一人拉一边拖着小智去跟每个神兽挨个打招呼，让调查的时候要配合。小智道：“那个，两位博士，能不能先去吃午饭，吃完再继续好吗？”
大竺葵和拉帝亚斯女友力十足，将两人拉开。
小霞他们也找到了小智他们，小霞解释道：“小茂来给我们送午餐，空间里的事情还没完，所以我们就一致决定来找你们一起在空间里野餐。”
这样的体验还是第一次，神兽和大家的宝可梦围绕在一起，这顿午饭是最棒的体验了。
这天就在空间里愉快的玩耍落下了帷幕，隔天，小智一行人跟大木博士他们告别，但那只爱哭的杰尼龟说什么都舍不得小遥。
小田卷博士道：“看样子杰尼龟已经决定了自己的主人了！”
大木博士笑道：“好像是这个样子，小遥我就将杰尼龟拜托给你了！”
小遥道：“这孩子选择了我啊！谢谢大木博士。杰尼龟你以后就是我的宝可梦喽！”
杰尼龟兴奋的点了点头：“杰尼杰尼。”
大木博士递给了小智与小遥新的宝可梦图鉴，虽然知道小智除了在参赛登记的使用过图鉴，其他的时候都在落灰，但是这是大木博士的工作。小遥却很开心收到新的宝可梦图鉴。
小胜用羡慕的眼神看着自家姐姐手里新的宝可梦图鉴，小健将小胜之前拜托他升级系统的宝可梦领航员递给了小胜：“小胜，对战开拓区和世界地图我都传输进去了哦！”
小胜抱着宝可梦领航员，没有了失落的感觉道：“谢谢你小健。”
小茂对小智道：“我会暂时留在真新镇，一个月后我要去趟神奥地区。 ”
小智道：“嗯。”神奥地区，小智早就打算好了结束对战开拓区的挑战后就去。
大木博士道：“小智你打算完成对战开拓区的挑战后，也打算去神奥地区吗？”
小智道：“没错，是我早就决定好的事情了！”
小智四人告别了花子他们，刚出真新镇没有多久，小刚的身影就出现在众人眼前，他背靠一棵大树，自认为很帅气的道：“你们不会忘了我了吧！”
小智拍了拍小刚的肩膀道：“忘记谁都不会忘记你的！小刚继续请你多多指教了！”
小刚拍着胸脯道：“就交给我吧！”
“打扰你们很不合时宜，但你们也别忘记我们！”
“火箭队！”
火箭队的热气球降落在小智他们的面前，小次郎道：“为了庆祝新的旅程，我们也准备了新的登场台词！”
“虽然我没有听到发生了什么的声音。”
“来自地平线的那一边！”
“来自大霹雳的那一边！”
“传来了呼唤我们的声音。”
“让你们久等了喵！”
“勇敢绽放的邪恶之花。”
“坚强又甜蜜的反派角色。”
“武藏！”
“小次郎！”
“我是喵喵的喵。”
“有火箭队的地方。”
“世界啊！”
“宇宙啊！”
“在等待着你！（喵）”
“索南斯。”
“铃铃。”
喵喵强调道：“我们这就走了，不用送了喵。”
火箭队带着喵喵热气球离开了。
小霞无奈道：“他们到底是来干什么的？”
小刚疑惑道：“就是为了让我们听他们的新登场台词？”
小智道：“管他们的，我们继续走吧！”
于是，小智五人再次踏上了新的旅程......
（接下来就是波导勇者的剧情了！敬请期待！）